Take a look at org.biojavax.bio.db.ncbi.GenbankRichSequenceDB If this doesn't do what you want it to do, you can always grab records using the Entrez e-utils from NCBI (here: http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/eutils_help.html ) then parse the resulting Genbank records using BJX.
cheers, Richard On Mon, 2006-06-19 at 10:29 -0300, Anderson Moura da Silva wrote: > Hi everybody, > > Is there a way to get a sequence online using biojava entering the name or a > reference for the sequence? > > > Thanks a lot > Anderson Moura - Brasil > > > Esta mensagem, incluindo seus anexos, pode conter informações privilegiadas > e/ou de caráter confidencial, não podendo ser retransmitida sem autorização > do remetente. Se você não é o destinatário ou pessoa autorizada a recebê-la, > informamos que o seu uso, divulgação, cópia ou arquivamento são proibidos. > Portanto, se você recebeu esta mensagem por engano, por favor, nos informe > respondendo imediatamente a este e-mail e em seguida apague-a. > > > _______________________________________________ > Biojava-l mailing list - [email protected] > http://lists.open-bio.org/mailman/listinfo/biojava-l > -- Richard Holland (BioMart Team) EMBL-EBI Wellcome Trust Genome Campus Hinxton Cambridge CB10 1SD UNITED KINGDOM Tel: +44-(0)1223-494416 _______________________________________________ Biojava-l mailing list - [email protected] http://lists.open-bio.org/mailman/listinfo/biojava-l
