Hi Ines DSSP? (In ccp4 as “mkdssp” in $CBIN)? Should work with any (valid??) PDB file
“Oldie but goodie”... Harry > On 7 Apr 2022, at 09:24, Munoz.Ines <[email protected]> wrote: > > Dear all, > > Is there any program or server that automatically assign the secondary > structure elements into a pdb generated by alpha fold? > > Many thanks > Inés > > > > > Inés G. Muñoz > Head of Crystallography and Protein Engineering Unit > Spanish National Cancer Research Centre, CNIO > > [email protected] > Phone +34 91 732 8000 (ext. 3020) > > Melchor Fernández Almagro, 3 > 28029 Madrid, Spain > www.cnio.es > > > <image002.jpg> > > > > > > > Fb Amigos del CNIO | Tw @CNIOStopCancer | Youtube canalcnio > > > > **ADVERTENCIA LEGAL**: Este correo electrónico, y en su caso los ficheros > adjuntos, pueden contener información protegida para el uso exclusivo de su > destinatario. Se prohíbe la distribución, reproducción o cualquier otro tipo > de transmisión por parte de otra persona que no sea el destinatario. Si usted > recibe por error este correo, se ruega comunicarlo al remitente y borrar el > mensaje recibido. > De conformidad con lo dispuesto en el Reglamento (UE) 2016/679 relativo a la > protección de los datos personales de las personas físicas, la información > personal que nos pueda facilitar a través de este correo electrónico quedará > registrada por la Fundación CNIO con la finalidad de tramitar el objeto del > presente correo electrónico. El tratamiento de sus datos personales se > encuentra legitimado por ser necesario para gestionar el objeto del presente > mensaje. Estos datos personales no serán comunicados a ningún destinatario > salvo a aquellos que usted nos autorice o así venga exigido por una ley. Ud. > podrá ejercer los derechos de acceso, rectificación, supresión, limitación de > tratamiento, portabilidad y oposición en la siguiente dirección: c/Melchor > Fernandez Almagro 3, 28029 (Madrid). Podrá ponerse en contacto con el > Delegado de Protección de Datos en: [email protected]. Para el caso de > que Ud. precise conocer información adicional sobre el tratamiento de sus > datos personales, puede consultar dicha información adicional en el siguiente > enlace dentro de nuestra página web: > https://www.cnio.es/es/privacidad/index.asp > > **LEGAL NOTICE**: This email and any attached files may contain protected > information for the sole use of its intended recipient or addressee. Anyone > other than the intended recipient or addressee is strictly prohibited from > distributing, reproducing or transmitting the email and its contents in any > way. If you receive this email in error, please notify the sender and delete > the message. > Pursuant to the provisions of EU Regulation 2016/679 regarding the protection > of personal data, any personal information you provide through this email > will be registered by the CNIO Foundation in order to deal with content of > this email. Your personal data must be processed in order to be able to deal > with the content and purpose of this message. Your personal details will not > be passed on to anyone else unless you authorise us to do so or we are > required to do so by law. You may exercise your rights regarding access, > rectification, suppression, limitation of processing, portability and > opposition by writing to the following address: c/Melchor Fernandez Almagro > 3, 28029 (Madrid). You may contact the Data Protection Delegate (Delegado de > Protección de Datos) at: [email protected]. If you require further > information about the processing of your personal data, go to the following > link on our webpage: https://www.cnio.es/es/privacidad/index.asp > > To unsubscribe from the CCP4BB list, click the following link: > https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/WA-JISC.exe?SUBED1=CCP4BB&A=1 > ######################################################################## To unsubscribe from the CCP4BB list, click the following link: https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/WA-JISC.exe?SUBED1=CCP4BB&A=1 This message was issued to members of www.jiscmail.ac.uk/CCP4BB, a mailing list hosted by www.jiscmail.ac.uk, terms & conditions are available at https://www.jiscmail.ac.uk/policyandsecurity/
