Pierre Gruet pushed to branch debian/master at Debian Med / relion
Commits: ad6f0881 by Pierre Gruet at 2026-02-22T17:01:28+01:00 Repacking without embedded copy of Eigen - - - - - e7061c72 by Pierre Gruet at 2026-02-22T17:01:41+01:00 New upstream version 5.0.1+dfsg - - - - - 93e376a4 by Pierre Gruet at 2026-02-22T17:01:58+01:00 Update upstream source from tag 'upstream/5.0.1+dfsg' Update to upstream version '5.0.1+dfsg' with Debian dir bbf0ddc1d30df9b11ed486d8a22722df11e5179d - - - - - bd62d442 by Pierre Gruet at 2026-02-22T17:54:25+01:00 Updating changelog - - - - - 332 changed files: - debian/changelog - debian/copyright - debian/watch - − src/Eigen/Cholesky - − src/Eigen/CholmodSupport - − src/Eigen/Core - − src/Eigen/Dense - − src/Eigen/Eigen - − src/Eigen/Eigenvalues - − src/Eigen/Geometry - − src/Eigen/Householder - − src/Eigen/IterativeLinearSolvers - − src/Eigen/Jacobi - − src/Eigen/KLUSupport - − src/Eigen/LU - − src/Eigen/MetisSupport - − src/Eigen/OrderingMethods - − src/Eigen/PaStiXSupport - − src/Eigen/PardisoSupport - − src/Eigen/QR - − src/Eigen/QtAlignedMalloc - − src/Eigen/SPQRSupport - − src/Eigen/SVD - − src/Eigen/Sparse - − src/Eigen/SparseCholesky - − src/Eigen/SparseCore - − src/Eigen/SparseLU - − src/Eigen/SparseQR - − src/Eigen/StdDeque - − src/Eigen/StdList - − src/Eigen/StdVector - − src/Eigen/SuperLUSupport - − src/Eigen/UmfPackSupport - − src/Eigen/src/Cholesky/LDLT.h - − src/Eigen/src/Cholesky/LLT.h - − src/Eigen/src/Cholesky/LLT_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/CholmodSupport/CholmodSupport.h - − src/Eigen/src/Core/ArithmeticSequence.h - − src/Eigen/src/Core/Array.h - − src/Eigen/src/Core/ArrayBase.h - − src/Eigen/src/Core/ArrayWrapper.h - − src/Eigen/src/Core/Assign.h - − src/Eigen/src/Core/AssignEvaluator.h - − src/Eigen/src/Core/Assign_MKL.h - − src/Eigen/src/Core/BandMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/Block.h - − src/Eigen/src/Core/BooleanRedux.h - − src/Eigen/src/Core/CommaInitializer.h - − src/Eigen/src/Core/ConditionEstimator.h - − src/Eigen/src/Core/CoreEvaluators.h - − src/Eigen/src/Core/CoreIterators.h - − src/Eigen/src/Core/CwiseBinaryOp.h - − src/Eigen/src/Core/CwiseNullaryOp.h - − src/Eigen/src/Core/CwiseTernaryOp.h - − src/Eigen/src/Core/CwiseUnaryOp.h - − src/Eigen/src/Core/CwiseUnaryView.h - − src/Eigen/src/Core/DenseBase.h - − src/Eigen/src/Core/DenseCoeffsBase.h - − src/Eigen/src/Core/DenseStorage.h - − src/Eigen/src/Core/Diagonal.h - − src/Eigen/src/Core/DiagonalMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/DiagonalProduct.h - − src/Eigen/src/Core/Dot.h - − src/Eigen/src/Core/EigenBase.h - − src/Eigen/src/Core/ForceAlignedAccess.h - − src/Eigen/src/Core/Fuzzy.h - − src/Eigen/src/Core/GeneralProduct.h - − src/Eigen/src/Core/GenericPacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/GlobalFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/IO.h - − src/Eigen/src/Core/IndexedView.h - − src/Eigen/src/Core/Inverse.h - − src/Eigen/src/Core/Map.h - − src/Eigen/src/Core/MapBase.h - − src/Eigen/src/Core/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/MathFunctionsImpl.h - − src/Eigen/src/Core/Matrix.h - − src/Eigen/src/Core/MatrixBase.h - − src/Eigen/src/Core/NestByValue.h - − src/Eigen/src/Core/NoAlias.h - − src/Eigen/src/Core/NumTraits.h - − src/Eigen/src/Core/PartialReduxEvaluator.h - − src/Eigen/src/Core/PermutationMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/PlainObjectBase.h - − src/Eigen/src/Core/Product.h - − src/Eigen/src/Core/ProductEvaluators.h - − src/Eigen/src/Core/Random.h - − src/Eigen/src/Core/Redux.h - − src/Eigen/src/Core/Ref.h - − src/Eigen/src/Core/Replicate.h - − src/Eigen/src/Core/Reshaped.h - − src/Eigen/src/Core/ReturnByValue.h - − src/Eigen/src/Core/Reverse.h - − src/Eigen/src/Core/Select.h - − src/Eigen/src/Core/SelfAdjointView.h - − src/Eigen/src/Core/SelfCwiseBinaryOp.h - − src/Eigen/src/Core/Solve.h - − src/Eigen/src/Core/SolveTriangular.h - − src/Eigen/src/Core/SolverBase.h - − src/Eigen/src/Core/StableNorm.h - − src/Eigen/src/Core/StlIterators.h - − src/Eigen/src/Core/Stride.h - − src/Eigen/src/Core/Swap.h - − src/Eigen/src/Core/Transpose.h - − src/Eigen/src/Core/Transpositions.h - − src/Eigen/src/Core/TriangularMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/VectorBlock.h - − src/Eigen/src/Core/VectorwiseOp.h - − src/Eigen/src/Core/Visitor.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX/TypeCasting.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX512/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX512/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX512/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AVX512/TypeCasting.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AltiVec/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AltiVec/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/AltiVec/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/CUDA/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/Default/ConjHelper.h - − src/Eigen/src/Core/arch/Default/GenericPacketMathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/Default/GenericPacketMathFunctionsFwd.h - − src/Eigen/src/Core/arch/Default/Half.h - − src/Eigen/src/Core/arch/Default/Settings.h - − src/Eigen/src/Core/arch/Default/TypeCasting.h - − src/Eigen/src/Core/arch/GPU/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/GPU/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/GPU/TypeCasting.h - − src/Eigen/src/Core/arch/HIP/hcc/math_constants.h - − src/Eigen/src/Core/arch/MSA/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/MSA/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/MSA/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/NEON/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/NEON/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/NEON/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/NEON/TypeCasting.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SSE/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SSE/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SSE/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SSE/TypeCasting.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SYCL/InteropHeaders.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SYCL/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SYCL/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SYCL/SyclMemoryModel.h - − src/Eigen/src/Core/arch/SYCL/TypeCasting.h - − src/Eigen/src/Core/arch/ZVector/Complex.h - − src/Eigen/src/Core/arch/ZVector/MathFunctions.h - − src/Eigen/src/Core/arch/ZVector/PacketMath.h - − src/Eigen/src/Core/functors/AssignmentFunctors.h - − src/Eigen/src/Core/functors/BinaryFunctors.h - − src/Eigen/src/Core/functors/NullaryFunctors.h - − src/Eigen/src/Core/functors/StlFunctors.h - − src/Eigen/src/Core/functors/TernaryFunctors.h - − src/Eigen/src/Core/functors/UnaryFunctors.h - − src/Eigen/src/Core/products/GeneralBlockPanelKernel.h - − src/Eigen/src/Core/products/GeneralMatrixMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/products/GeneralMatrixMatrixTriangular.h - − src/Eigen/src/Core/products/GeneralMatrixMatrixTriangular_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/GeneralMatrixMatrix_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/GeneralMatrixVector.h - − src/Eigen/src/Core/products/GeneralMatrixVector_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/Parallelizer.h - − src/Eigen/src/Core/products/SelfadjointMatrixMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/products/SelfadjointMatrixMatrix_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/SelfadjointMatrixVector.h - − src/Eigen/src/Core/products/SelfadjointMatrixVector_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/SelfadjointProduct.h - − src/Eigen/src/Core/products/SelfadjointRank2Update.h - − src/Eigen/src/Core/products/TriangularMatrixMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/products/TriangularMatrixMatrix_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/TriangularMatrixVector.h - − src/Eigen/src/Core/products/TriangularMatrixVector_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/TriangularSolverMatrix.h - − src/Eigen/src/Core/products/TriangularSolverMatrix_BLAS.h - − src/Eigen/src/Core/products/TriangularSolverVector.h - − src/Eigen/src/Core/util/BlasUtil.h - − src/Eigen/src/Core/util/ConfigureVectorization.h - − src/Eigen/src/Core/util/Constants.h - − src/Eigen/src/Core/util/DisableStupidWarnings.h - − src/Eigen/src/Core/util/ForwardDeclarations.h - − src/Eigen/src/Core/util/IndexedViewHelper.h - − src/Eigen/src/Core/util/IntegralConstant.h - − src/Eigen/src/Core/util/MKL_support.h - − src/Eigen/src/Core/util/Macros.h - − src/Eigen/src/Core/util/Memory.h - − src/Eigen/src/Core/util/Meta.h - − src/Eigen/src/Core/util/NonMPL2.h - − src/Eigen/src/Core/util/ReenableStupidWarnings.h - − src/Eigen/src/Core/util/ReshapedHelper.h - − src/Eigen/src/Core/util/StaticAssert.h - − src/Eigen/src/Core/util/SymbolicIndex.h - − src/Eigen/src/Core/util/XprHelper.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/ComplexEigenSolver.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/ComplexSchur.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/ComplexSchur_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/EigenSolver.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/GeneralizedEigenSolver.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/GeneralizedSelfAdjointEigenSolver.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/HessenbergDecomposition.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/MatrixBaseEigenvalues.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/RealQZ.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/RealSchur.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/RealSchur_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/SelfAdjointEigenSolver.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/SelfAdjointEigenSolver_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/Eigenvalues/Tridiagonalization.h - − src/Eigen/src/Geometry/AlignedBox.h - − src/Eigen/src/Geometry/AngleAxis.h - − src/Eigen/src/Geometry/EulerAngles.h - − src/Eigen/src/Geometry/Homogeneous.h - − src/Eigen/src/Geometry/Hyperplane.h - − src/Eigen/src/Geometry/OrthoMethods.h - − src/Eigen/src/Geometry/ParametrizedLine.h - − src/Eigen/src/Geometry/Quaternion.h - − src/Eigen/src/Geometry/Rotation2D.h - − src/Eigen/src/Geometry/RotationBase.h - − src/Eigen/src/Geometry/Scaling.h - − src/Eigen/src/Geometry/Transform.h - − src/Eigen/src/Geometry/Translation.h - − src/Eigen/src/Geometry/Umeyama.h - − src/Eigen/src/Geometry/arch/Geometry_SSE.h - − src/Eigen/src/Householder/BlockHouseholder.h - − src/Eigen/src/Householder/Householder.h - − src/Eigen/src/Householder/HouseholderSequence.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/BasicPreconditioners.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/BiCGSTAB.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/ConjugateGradient.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/IncompleteCholesky.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/IncompleteLUT.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/IterativeSolverBase.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/LeastSquareConjugateGradient.h - − src/Eigen/src/IterativeLinearSolvers/SolveWithGuess.h - − src/Eigen/src/Jacobi/Jacobi.h - − src/Eigen/src/KLUSupport/KLUSupport.h - − src/Eigen/src/LU/Determinant.h - − src/Eigen/src/LU/FullPivLU.h - − src/Eigen/src/LU/InverseImpl.h - − src/Eigen/src/LU/PartialPivLU.h - − src/Eigen/src/LU/PartialPivLU_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/LU/arch/Inverse_SSE.h - − src/Eigen/src/MetisSupport/MetisSupport.h - − src/Eigen/src/OrderingMethods/Amd.h - − src/Eigen/src/OrderingMethods/Eigen_Colamd.h - − src/Eigen/src/OrderingMethods/Ordering.h - − src/Eigen/src/PaStiXSupport/PaStiXSupport.h - − src/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h - − src/Eigen/src/QR/ColPivHouseholderQR.h - − src/Eigen/src/QR/ColPivHouseholderQR_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/QR/CompleteOrthogonalDecomposition.h - − src/Eigen/src/QR/FullPivHouseholderQR.h - − src/Eigen/src/QR/HouseholderQR.h - − src/Eigen/src/QR/HouseholderQR_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/SPQRSupport/SuiteSparseQRSupport.h - − src/Eigen/src/SVD/BDCSVD.h - − src/Eigen/src/SVD/JacobiSVD.h - − src/Eigen/src/SVD/JacobiSVD_LAPACKE.h - − src/Eigen/src/SVD/SVDBase.h - − src/Eigen/src/SVD/UpperBidiagonalization.h - − src/Eigen/src/SparseCholesky/SimplicialCholesky.h - − src/Eigen/src/SparseCholesky/SimplicialCholesky_impl.h - − src/Eigen/src/SparseCore/AmbiVector.h - − src/Eigen/src/SparseCore/CompressedStorage.h - − src/Eigen/src/SparseCore/ConservativeSparseSparseProduct.h - − src/Eigen/src/SparseCore/MappedSparseMatrix.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseAssign.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseBlock.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseColEtree.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseCompressedBase.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseCwiseBinaryOp.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseCwiseUnaryOp.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseDenseProduct.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseDiagonalProduct.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseDot.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseFuzzy.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseMap.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseMatrix.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseMatrixBase.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparsePermutation.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseProduct.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseRedux.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseRef.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseSelfAdjointView.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseSolverBase.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseSparseProductWithPruning.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseTranspose.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseTriangularView.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseUtil.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseVector.h - − src/Eigen/src/SparseCore/SparseView.h - − src/Eigen/src/SparseCore/TriangularSolver.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLUImpl.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_Memory.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_Structs.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_SupernodalMatrix.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_Utils.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_column_bmod.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_column_dfs.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_copy_to_ucol.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_gemm_kernel.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_heap_relax_snode.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_kernel_bmod.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_panel_bmod.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_panel_dfs.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_pivotL.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_pruneL.h - − src/Eigen/src/SparseLU/SparseLU_relax_snode.h - − src/Eigen/src/SparseQR/SparseQR.h - − src/Eigen/src/StlSupport/StdDeque.h - − src/Eigen/src/StlSupport/StdList.h - − src/Eigen/src/StlSupport/StdVector.h - − src/Eigen/src/StlSupport/details.h - − src/Eigen/src/SuperLUSupport/SuperLUSupport.h - − src/Eigen/src/UmfPackSupport/UmfPackSupport.h - − src/Eigen/src/misc/Image.h - − src/Eigen/src/misc/Kernel.h - − src/Eigen/src/misc/RealSvd2x2.h - − src/Eigen/src/misc/blas.h - − src/Eigen/src/misc/lapack.h - − src/Eigen/src/misc/lapacke.h - − src/Eigen/src/misc/lapacke_mangling.h - − src/Eigen/src/plugins/ArrayCwiseBinaryOps.h - − src/Eigen/src/plugins/ArrayCwiseUnaryOps.h - − src/Eigen/src/plugins/BlockMethods.h - − src/Eigen/src/plugins/CommonCwiseBinaryOps.h - − src/Eigen/src/plugins/CommonCwiseUnaryOps.h - − src/Eigen/src/plugins/IndexedViewMethods.h - − src/Eigen/src/plugins/MatrixCwiseBinaryOps.h - − src/Eigen/src/plugins/MatrixCwiseUnaryOps.h - − src/Eigen/src/plugins/ReshapedMethods.h The diff was not included because it is too large. View it on GitLab: https://salsa.debian.org/med-team/relion/-/compare/c38bbeae796a1594eba33696878299fe6adf09ab...bd62d44268a9c3f492b76cf76e8dd81d09057fd9 -- View it on GitLab: https://salsa.debian.org/med-team/relion/-/compare/c38bbeae796a1594eba33696878299fe6adf09ab...bd62d44268a9c3f492b76cf76e8dd81d09057fd9 You're receiving this email because of your account on salsa.debian.org.
_______________________________________________ debian-med-commit mailing list [email protected] https://alioth-lists.debian.net/cgi-bin/mailman/listinfo/debian-med-commit
