J'ai crié à l'aide un peu vite, finalement je m'en suis sorti tout seul.

J'ai fait sudo lsof /var/cache/debconf/config.dat pour connaitre le
processus qui bloquait, il s'agissait de frontend, j'ai killé frontend,
j'ai pu exécuter dpkg --configure -a, et terminer la mise à jour.

Voilà voilà, ça servira peut être un jour à d'autres.

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