Je ne suis pas compétent en la matière, donc prudence, mais quelques observations./suggestions:
- mon ulimit de fichers ouverts perso (attaché à mon utilisateur et aux processus fils) est de 1024 - ton comptage pourrait agréger par exemple plusieurs instances de firefox. Or si je comprends bien (ce n'est pas certain) la limite concerne le processus, pas l'application. - il se pourrait aussi peut-être que le messages "trop de fichiers ouverts" soit fallacieux et que le problème vienne d'ailleurs - j'essaierais d'abord de mettre owncloud/netxcloud hors de l'équation en déparamétrant les connexions (login) automatiques et les plug-in de Gnome Nautilus pour owncloud/nextcloud. - je tenterais de créer/modifier un .profile personnel avec un ulimit -n plus élevé (1024 par défaut si j'ai bien saisi) - je regarderais les warnings (WW) et erreurs (EE) dans le log gdm (accessible par journalctl maintenant normalement, je m'y perds un peu maintenant que entre Xorg lancé par un utilisateur lamba et Wayland)