Bonjour Olivier,
je n'ai jamais vraiment utilisé de cartes eMMC donc ce qui suit à
prendre avec réserves, je n'y connais quasiment rien.
D'une part, ce que tu identifies comme des messages d'erreur ne sont
peut-être que des messages d'information. Auquel cas tu peux simplement
demander à ce que ce soit moins verbeux ou cacher les messages de boot
avec un splash graphique (Plymouth...)
D'autre part dans Debian est empaqueté mmc-utils qui pourrait t'apporter
des infos voire modifier la configuration ou l'environnement de ta carre
eMMC:
https://www.kernel.org/doc/html/latest/driver-api/mmc/mmc-tools.html