Hola, El sistema raid es mejor montarlo sobre discos internos (sean mecanicos o ssd) que sobre discos usb. Los discos usb son mas lentos.
No entiendo muy bien tu planteamiento, pero te pongo un ejemplo: imaginate un pc con 3 discos duros (HD0, HD1, HD2). HD0 contiene el sistema operativo y el sofware necesario, HD1 esta dedicado a lo que quieres almacenar, HD2 lo tienes de respaldo. Un saludo
