Tiago,

> Preciso roda uma aplicacao via apache, sendo que ela tem que se
> executada via super usuario, existe maneira de roda o apache como
> root, ou algum script, e qual seria o script pode ser em php, nao sei,
> para que o usuario que estiver rodando o apache virar super usuario?

Você precisará  rodar o script via sudo.

[]s
Ronan



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