Ok, I submitted it, hope somebody can help with this. Cheers, Christoper
On 12/3/18 3:20 PM, Nicola Soranzo wrote: > Hi Christopher, > can you please submit an issue for this at > https://github.com/galaxyproject/galaxy/issues/ with the relevant logs > and/or tracebacks? > > Cheers, > Nicola > > On 03/12/2018 13:33, Previti wrote: >> Dear all, >> >> In my ongoing saga concerning our data libraries, I came across >> another issue after our update from 17.09 to 18.05. >> When trying to import fastq.gz files into a data library (linking the >> files from a user directory), the format is not recognized >> automatically. >> >> I specifically have to set the data type to fastq.gz in order for it >> to work at all and even then it sometimes ends up throwing an error >> (state = error). >> >> Is there anything in particular I need to change to make this work >> reliably? >> >> Cheers, >> >> Christopher >> >> >> >> -- >> *Dr. Christopher Previti* >> Genomics and Proteomics Core Facility >> High Throughput Sequencing (W190) >> Bioinformatician >> >> German Cancer Research Center (DKFZ) >> Foundation under Public Law >> Im Neuenheimer Feld 580 >> 69120 Heidelberg >> Germany >> Room: B2.102 (INF580/TP3) >> Phone: +49 6221 42-4661 >> >> christopher.prev...@dkfz.de <http://www.dkfz.de/> >> www.dkfz.de <http://www.dkfz.de/> >> >> Management Board: Prof. Dr. Michael Baumann, Prof. Dr. Josef Puchta >> VAT-ID No.: DE143293537 >> >> Vertraulichkeitshinweis: Diese Nachricht ist ausschließlich für die >> Personen bestimmt, an die sie adressiert ist. >> Sie kann vertrauliche und/oder nur für den/die Empfänger bestimmte >> Informationen enthalten. Sollten Sie nicht >> der bestimmungsgemäße Empfänger sein, kontaktieren Sie bitte den >> Absender und löschen Sie die Mitteilung. >> Jegliche unbefugte Verwendung der Informationen in dieser Nachricht >> ist untersagt. >> >> >> >> ___________________________________________________________ >> Please keep all replies on the list by using "reply all" >> in your mail client. To manage your subscriptions to this >> and other Galaxy lists, please use the interface at: >> https://lists.galaxyproject.org/ >> >> To search Galaxy mailing lists use the unified search at: >> http://galaxyproject.org/search/ > > > ___________________________________________________________ > Please keep all replies on the list by using "reply all" > in your mail client. To manage your subscriptions to this > and other Galaxy lists, please use the interface at: > https://lists.galaxyproject.org/ > > To search Galaxy mailing lists use the unified search at: > http://galaxyproject.org/search/ -- *Dr. Christopher Previti* Genomics and Proteomics Core Facility High Throughput Sequencing (W190) Bioinformatician German Cancer Research Center (DKFZ) Foundation under Public Law Im Neuenheimer Feld 580 69120 Heidelberg Germany Room: B2.102 (INF580/TP3) Phone: +49 6221 42-4661 christopher.prev...@dkfz.de <http://www.dkfz.de/> www.dkfz.de <http://www.dkfz.de/> Management Board: Prof. Dr. Michael Baumann, Prof. Dr. Josef Puchta VAT-ID No.: DE143293537 Vertraulichkeitshinweis: Diese Nachricht ist ausschließlich für die Personen bestimmt, an die sie adressiert ist. Sie kann vertrauliche und/oder nur für den/die Empfänger bestimmte Informationen enthalten. Sollten Sie nicht der bestimmungsgemäße Empfänger sein, kontaktieren Sie bitte den Absender und löschen Sie die Mitteilung. Jegliche unbefugte Verwendung der Informationen in dieser Nachricht ist untersagt.
___________________________________________________________ Please keep all replies on the list by using "reply all" in your mail client. To manage your subscriptions to this and other Galaxy lists, please use the interface at: https://lists.galaxyproject.org/ To search Galaxy mailing lists use the unified search at: http://galaxyproject.org/search/
