Hello evryone, I doing a simulation of a ligand-protein interaction with gromacs 4.5.5. Everything looks fine after I equilibrate the protein-ligand complex. I'm running these commands:
grompp -f nvt.mdp -c em.gro -p topol.top -n index.ndx -o nvt.tpr mdrun -deffnm nvt Nevertheless, I got this error: "Reading file nvt.tpr, VERSION 4.5.5 (double precision) Segmentation fault" What should I do? Carlos Javier Alméciga Díaz, QF., PhD. Profesor Asistente Pontificia Universidad Javeriana Facultad de Ciencias Instituto de Errores Innatos del Metabolismo Tel: 57-1-3208320 Ext 4140-4099 Fax: 57-1-3208320 Ext 4099 Bogotá. D.C. - COLOMBIA cjalmec...@javeriana.edu.co http://www.javeriana.edu.co/ieim AVISO LEGAL: El presente correo electronico no representa la opinion o el consentimiento oficial de la PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA. Este mensaje es confidencial y puede contener informacion privilegiada la cual no puede ser usada ni divulgada a personas distintas de su destinatario. Esta prohibida la retencion, grabacion, utilizacion, aprovechamiento o divulgacion con cualquier proposito. Si por error recibe este mensaje, por favor destruya su contenido y avise a su remitente. En este aviso legal se omiten intencionalmente las tildes. Este mensaje ha sido revisado por un sistema antivirus, por lo que su contenido esta libre de virus. This e-mail has been scanned by an antivirus system, so its contents is virus free. -- gmx-users mailing list gmx-users@gromacs.org http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users * Please search the archive at http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search before posting! * Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to gmx-users-requ...@gromacs.org. * Can't post? Read http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists
