I am feeding the sparse matrix m to the cocluster function and I receive the following message. Do you know how I can feed this sparse matrix to the cocluster function or are there any other type of coclustering function in igraph?
> out<-cocluster(m,datatype="binary",nbcocluster=c(2,3)) Error in cocluster(m, datatype = "binary", nbcocluster = c(2, 3)) : Data should be matrix. 73 x 15 sparse Matrix of class "dgCMatrix" [1,] 1 1 . . . . . . . . . . . . . [2,] . 1 1 . . . . . . . . . . . . [3,] 1 . . . 1 . . . . . . . . . . [4,] . 1 . . 1 . . . . . . . . . . [5,] . . 1 . 1 . . . . . . . . . . [6,] . . . 1 1 . . . . . . . . . . [7,] 1 . . . . 1 . . . . . . . . . [8,] . . . 1 . 1 . . . . . . . . . [9,] 1 . . . . . 1 . . . . . . . . [10,] . 1 . . . . 1 . . . . . . . . [11,] . . 1 . . . 1 . . . . . . . . [12,] . . . . . 1 1 . . . . . . . . [13,] 1 . . . . . . 1 . . . . . . . [14,] . . 1 . . . . 1 . . . . . . . [15,] . . . 1 . . . 1 . . . . . . . [16,] . . . . 1 . . 1 . . . . . . . [17,] . . . . . 1 . 1 . . . . . . . [18,] . . . . . . 1 1 . . . . . . . [19,] 1 . . . . . . . 1 . . . . . . [20,] . . . 1 . . . . 1 . . . . . . [21,] . . . . 1 . . . 1 . . . . . . [22,] . . . . . 1 . . 1 . . . . . . [23,] . . . . . . 1 . 1 . . . . . . [24,] . . . . . . . 1 1 . . . . . . [25,] 1 . . . . . . . . 1 . . . . . [26,] . 1 . . . . . . . 1 . . . . . [27,] . . 1 . . . . . . 1 . . . . . [28,] . . . . 1 . . . . 1 . . . . . [29,] . . . . . . 1 . . 1 . . . . . [30,] . . . . . . . 1 . 1 . . . . . [31,] . . . . . . . . 1 1 . . . . . [32,] . . 1 . . . . . . . 1 . . . . [33,] . . . 1 . . . . . . 1 . . . . [34,] . . . . 1 . . . . . 1 . . . . [35,] . . . . . 1 . . . . 1 . . . . [36,] . . . . . . . 1 . . 1 . . . . [37,] . . . . . . . . 1 . 1 . . . . [38,] . 1 . . . . . . . . . 1 . . . [39,] . . 1 . . . . . . . . 1 . . . [40,] . . . 1 . . . . . . . 1 . . . [41,] . . . . 1 . . . . . . 1 . . . [42,] . . . . . 1 . . . . . 1 . . . [43,] . . . . . . 1 . . . . 1 . . . [44,] . . . . . . . 1 . . . 1 . . . [45,] . . . . . . . . 1 . . 1 . . . [46,] . . . . . . . . . . 1 1 . . . [47,] 1 . . . . . . . . . . . 1 . . [48,] . 1 . . . . . . . . . . 1 . . [49,] . . 1 . . . . . . . . . 1 . . [50,] . . . 1 . . . . . . . . 1 . . [51,] . . . . . 1 . . . . . . 1 . . [52,] . . . . . . 1 . . . . . 1 . . [53,] . . . . . . . . 1 . . . 1 . . [54,] . . . . . . . . . 1 . . 1 . . [55,] . . . . . . . . . . 1 . 1 . . [56,] 1 . . . . . . . . . . . . 1 . [57,] . 1 . . . . . . . . . . . 1 . [58,] . . 1 . . . . . . . . . . 1 . [59,] . . . 1 . . . . . . . . . 1 . [60,] . . . . . 1 . . . . . . . 1 . [61,] . . . . . . . 1 . . . . . 1 . [62,] . . . . . . . . . 1 . . . 1 . [63,] . . . . . . . . . . 1 . . 1 . [64,] . . . . . . . . . . . . 1 1 . [65,] . 1 . . . . . . . . . . . . 1 [66,] . . . 1 . . . . . . . . . . 1 [67,] . . . . 1 . . . . . . . . . 1 [68,] . . . . . 1 . . . . . . . . 1 [69,] . . . . . . 1 . . . . . . . 1 [70,] . . . . . . . 1 . . . . . . 1 [71,] . . . . . . . . . . 1 . . . 1 [72,] . . . . . . . . . . . . 1 . 1 [73,] . . . . . . . . . . . . . 1 1 You can visit the following post for more info: http://stackoverflow.com/questions/21689734/creating-the-node-edge-triangle-adjacency-graph-in-python-r Thanks a lot, Mona. _______________________________________________ igraph-help mailing list [email protected] https://lists.nongnu.org/mailman/listinfo/igraph-help
