Bruno,
 
para você acessar as portas seriais, paralelas, usb e outras, você deve usar o pacote "javax.comm".
Este pacote pode ser adquirido na própria sun: http://java.sun.com/webapps/download/Display
 
Quando descompactar o arquivo javacomm20-win32.zip , haverá a criação de um diretório chamado "commapi". Dentro deste diretório haverá a classe necessária para o suporte de acesso as portas seriais, paralelas, etc... . Encontrará neste arquivo também as documentações e exemplos necessários para a utilização do pacote. 
 
Provavelmente encontrarás algumas dúvidas em relação a utilização do pacote. Se tiver alguma dúvida na qual eu possa ajudar, pode mandar e-mail.
 
Bom divertimento e sucesso.
 
Atsunori Akimura
Engenheiro Eletricista
Megaflex Tecnologia Eletrônica LTDA
Megaflex Sul Tecnologia Industrial LTDA

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