Eu já uso o CI 2.0. Segundo o próprio Phil, o 2.0 já está estável e pode ser usado em ambiente de produção. ( http://philsturgeon.co.uk/news/2010/10/codeigniter-2.0-is-stable)
Se vc observar no bitbucket (http://bitbucket.org/ellislab/codeigniter/), as últimas correções foram mínimas e o core não deve sofrer alterações. O título ficou meio exagerado. Não acredito que o CI irá morrer, mas acho devemos manter uma segunda opção em stand by.
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