So, meine virtuelle Maschine hat mir leider noch ein paar Probleme bereitet und
so habe ich es mal auf meinem Gentoo getestet. Das sollte aber keinen
Unterschied machen.

Ich komme aber leider zu dem gleichen Resultat, wie du.
make ARCH=i386 menuconfig
make ARCH=i386 -j9 -l8
make ARCH=i386 deb-pkg

Bei dpkg-gencontrol bricht er natuerlich ab.
Aber ein kurzer Test ergibt:
file ./debian/hdrtmp/usr/src/linux-headers-4.4.52/scripts/basic/fixdep
> ./debian/hdrtmp/usr/src/linux-headers-4.4.52/scripts/basic/fixdep: ELF 64-bit 
> LSB executable, x86-64, version 1 (SYSV), dynamically linked, interpreter 
> /lib64/ld-linux-x86-64.so.2, for GNU/Linux 2.6.32, not stripped

Also das Problem scheint nicht bei dir zu liegen.

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