2008/8/26 Mariano Absatz - El Baby <[EMAIL PROTECTED]>:
> no sé nada (o casi) de Python, pero... el "shell=True" de Popen() ¿te
> asegura que eso llama a un shell que entiende el "#!/usr/bin/perl" de tu
> programa?
> p = Popen("/usr/bin/perl seqclean %s -l %s"%(fasta_in_name,l_param),
> shell=True)
> y fijate si anda...El seqclean es ejecutado porque tengo un output que es claramente producto del seqclean. Per vos sospechas (y con razón) de que no se ejecuta, asi que lo que debe ser es el el seqclean ejecuta a su vez otro programa y ese provoca el error. si yo grepeo la cadena "WAITING for all children to finish before starting last child!", aparece en un binario: /var/www/lau/seqclean.psx' Lo que significa el script Perl se ejecutó. Para confirmar esto mira el log que mande que dice esto: Launching actual cleaning process: psx -p 1 -n 1000 -i /var/www/lau/4sc/sc_sV_SB_.txt -d cleaning -C '/var/www/lau/4sc/sc_sV_SB_.txt:ANLMS100:::11:0' -c '/var/www/lau/seqclean.psx' La primera parte (Launching...) está en el seqclean (linea 164 de seqclean: http://www.pastecode.com.ar/f4e25d184). Luego imprime el comando que ejecuta. En ese comando se ve que llama el binario "psx" que es el que emite el "WAITING for all children to finish before starting last child!", lo que veo es que cuando anda bien (sin el cgi) eso no se emite. Cuando anda bien se retoma el flujo de ejecucion en seqclean. Pero debe ser algo que estoy haciendo mal al llamarlo desde Python asi que voy a transladar el problema para la lista correspondiente. -- Para desuscribirte tenés que visitar la página https://listas.linux.org.ar/mailman/listinfo/lugar-gral/ /* Publica y encontra trabajo relacionado con softlibre en http://www.usla.org.ar/modules/jobs/ */ Si tenés algún inconveniente o consulta escribí a mailto:[EMAIL PROTECTED]
