Lo de que las particiones sean idénticas es porque se copió la
información (la tabla de particiones es más parecido a un archivo
normal que a una medicion del disco).

Con respecto a la solución, si no te molesta perder todo, podrías
probar achicar la nueva partición con parted a un tamaño que entre
físicamente en el disco, si te molesta perder todo, podés hacer lo
mismo en la partición original y luego copiarla nuevamente, todo esto
suponiendo que hay espacio libre en la misma.

No se como funciona el fsck para ext3, pero lo peor que puede pasar es
que de un error al controlar los archivos que supuestamente están en
esos cilindros (o el espacio libre), y hasta con un poco de suerte lo
corrige.

Saludos. Lucas.

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