大津です。
ベンチマークではサーバに対し多数（0〜1000）接続 し、disconnectやconnect
を繰り返し
Nodeのメモリ使用量を監視していますが、
定期的に使用量がグッと下がる（恐らくGC）ことはありますが、長いスパンで見
ると全体として増え続けています。
※どこかのタイミングで接続数を0（ゼロ）にしてしばらく経過すると、メモリ使
用量はNode起動時の状態に戻りますが、実運用ではあり得ない状態だと思います。
この状態であれば、例えばメモリを2GB積んだサーバの場合、
２〜３日でメモリが枯渇してしまうのではないかと危惧しています。
ちょっと使用量が大きいですね。
ちなみにベンチマークするクライアントでは socket.io-client がちゃんと動作
していますでしょうか？ (1000接続をどうシミュレートしたのか気になります。）
socket.io の heartbeat はサーバから送信する時に毎回 setTimeout() でタイ
マーを登録するので heartbeat が返ってこないとタイムアウト時間(default 60
秒)までタイマーが登録されたままです。デバッグ出力に
debug - got heartbeat packet
debug - cleared heartbeat timeout for client XXXXXX
とか出力されていますか？
