Hola gracias por la respuesta, 

if($colores%2==0){
> $color="COLOR_UNO_AQUI";
> }else{
> $color="COLOR_DOS_AQUI";
> }



le puse asi:

while ($r = $rs->FetchRow ()) {
 if($colores%2==0){
 $color="#ff0000";
 }else{
 $color="808080";
 }
$summary["Comments"][$i]["id"] = $r["id"];
$summary["Comments"][$i]["title"] = $r["title"];
$summary["Comments"][$i]["name"] = $r["name"];
$summary["Comments"][$i]["parent"] = $r["parent_id"];
$summary["Comments"][$i]["createtime"] = $r["createtime"];
$i++;
 $colores++;
} 

y justo antes del cierra de la llave pones :
> 
> $colores++;


lo malo es q' no sé que mas hacer para ponerle el color de fondo.. mejor 
dicho para que use los estilos de un CSS, asi como dijeron. 

.PAR{ estilo 1}
.IMPAR {estilo 2}

espero su comentario,

gracias por vuestro tiempo
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