Hola, ygne0
> Trabajo en una web que posse un administrador que permite al usuario
> subir banners y asociarlos a unas noticias, para que al pinchar en el
> banner se acceda a la noticia. [...]
>
> El problema es que alguno de esos banners son SWF, mostrados en la web
> usando <object> y no consigo que al pinchar en ellos el navegador se
> vaya al enlace. [...]

Tan simple como meter el enlace en el fichero flash, no en el html...
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