Hola Tei

No sé si te he entendido bien:

1º ¿El problema es que la extracción del texto del PDF no es la esperada?
Quizás algo de esto te de alguna idea:
http://office.microsoft.com/es-es/help/HA101212493082.aspx
Selección de codificación

2º ¿Mostrar ese texto en la -web?

De cualquier modo ¡suerte!
Asela
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