你这是GenBank的格式吧。
去CPAN上搜索一下bioperl中读取GenBank的包,看一下说明文档就可以用了。
对于处理公认格式的工具,别人早就写好了。

在 2011年1月13日 下午12:40,徐香�| <[email protected]>写道:

>  >gnl(.*$)
>
>
> 2011-01-13
> ------------------------------
>  徐香�|
> ------------------------------
> *发件人:* Fei Ni
> *发送时间:* 2011-01-13  12:21:01
> *收件人:* perlchina
> *抄送:*
> *主题:* [PerlChina] 求助一个正则表达式的问题
>   有一段文字:
>
>> <html>
>>
>> <bodybgcolor=white>
>>
>> <pre>
>>
>> SSOURCE=<ahref="
>>> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Search&db=Nucleotide&doptcmdl=GenBank&term=AY013246
>>> ">AY013246</a>
>>
>> RELDATE=01-OCT-2002
>>
>> ANN_TSD=1-5,5178-5182
>>
>> ANN_LTR=6-208,4976-5177
>>
>> PROTEIN=
>>
>>
>>> >gnl|TREP|TREP22Retrotransposon,LTR,Copia,"RLC_Inav_AY013246-1";completeelement(5bpTSD)
>>
>> CAACCTGTTAGACGAAATATCTCTTTGTATTATACGTGACTTGTATAACA
>>
>> CGTATAGGTTAGGATCTCTTTCTATCTCCTTGTGTTTAAACCGTAGATAA
>>
>> GATAGATTGATCTTAAACCTCTCCTCATGTATATCTCTTCGGCTTATGCT
>>
>> GCCTATATAAATATGCACGCGTCCCTGCTAAGAGCATACGCTTCCAGCCT
>>
>> TTCTCACATGGTATAAGAGCCACCTCTTCCATCGACATGTCATCTTCCTC
>>
>> CTCAAGCTCCACCATGGCTGCCTCCCTCGCTGCGCTAGGTCACACCATAA
>>
>> 我想只拿到  >gnl 后面一直到文件结尾的文字(红色部分,结尾的文字不固定,可能是AGCT里的任意一个),用正则表达式该怎么去写呢?
> 非常感谢大家的热心帮助!!
>
> PS1:本人刚接触Perl,正在看小骆驼书,是新手。
> PS2:我花了至少一天的时间来写这个正则表达式,但一直没成功。
>
> --
> Feiny
>
> Achieving dream takes time and patience.Great careers don't happen
> overnight ,and take years of hardwork.But every step along the road can get
> you closer to your dream.
>
> --
> 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。
> 要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。
> 要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 
> [email protected]<perlchina%[email protected]>
> 。
> 若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。
>
> --
> 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。
> 要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。
> 要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 
> [email protected]<perlchina%[email protected]>
> 。
> 若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。
>

-- 
您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。
要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。
要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 [email protected]。
若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。

回复