没看明白你的问题,可能有一些你的domain知识。能不能解释详细一点,别人才能帮你。
比如你说的重复序列具体特征是什么?是某些列的值相等吗? Regards! Andy Chen Date: Tue, 25 Jan 2011 11:24:03 +0800 Subject: Re: [PerlChina] 去除重复序列的问题? From: [email protected] To: [email protected] 多谢指导,不过我没怎么看明白。我是需要把全部行放到一起来做还是逐行匹配阿? 在 2011年1月25日 上午11:14,DXX <[email protected]>写道: 写一个正则的匹配表达式,比如现在要修改第2种的,根据4写出一个正则,然后让所有的事件来和这条正则进行匹配,匹配的就去掉,不匹配的留下即可。 2011/1/25 Fei Ni <[email protected]> 本地BLAST之后的结果: ce_TREP251 ce_TREP251 100.00 200 0 0 1 200 1 200 1e-113 396 ce_TREP200 ce_TREP200 100.00 200 0 0 1 200 1 200 3e-99 349 ce_TREP1528 ce_TREP1528 100.00 200 0 0 1 200 1 200 1e-113 396 ce_TREP821 ce_TREP1438 93.00 200 13 1 1 200 1 199 9e-78 278 ce_TREP1438 ce_TREP821 93.00 200 13 1 1 199 1 200 9e-78 278 ce_TREP821 cs_TREP3162 85.23 149 22 0 1 149 1 149 1e-30 121cs_TREP3162 ce_TREP821 85.23 149 22 0 1 149 1 149 1e-30 121 我想去掉其中的两种重复序列(1:1-3行,序列本身的BLAST结果;2:4-5行、6-7行,4和5 | 6和7是一样的结果,只保留一个就可以), 第一种很好去掉,但是第二种该如何去掉那(我在尝试着修改我的perl script,但到目前为止一直没有成功。。。)? 非常感谢! -- Feiny Achieving dream takes time and patience.Great careers don't happen overnight ,and take years of hardwork.But every step along the road can get you closer to your dream. -- 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。 要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。 要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 [email protected]。 若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。 -- nothing is impossible to a willing heart -- 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。 要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。 要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 [email protected]。 若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。 -- Feiny Achieving dream takes time and patience.Great careers don't happen overnight ,and take years of hardwork.But every step along the road can get you closer to your dream. -- 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。 要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。 要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 [email protected]。 若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。 -- 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。 要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。 要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 [email protected]。 若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。
