找到原因了。 谢谢Robin。 我检查了httpd的error_log,上面显示是没发现我需要运行的程序-dialign。 我估计还是环境变量没有设置好。 CGI在调用外部命令的时候没有调用apache运行用户的设置。这一点我不知道是否理解的对。 所以我重新指定环境变量PATH和DIALIGN2_DIR(如果在本地执行,这些变量设置当然是对的,所以一开始并没有找到错误点!)
谢谢大家! 一松 2011/10/16 Robin Lee <[email protected]>: > 那就是没有错误。 > 你确定system里的命令没有被执行? > 试一下 system("echo 'xxx'") ? > > 另外,应该判断 system 返回值是否为0来判断命令是否正确执行: > system("xxx") == 0 or die; > 而不是: > system("xxx") or die; > > 另外,system的返回值并不是命令结束返回值,返回值是 ($? >> 8)。详见 perldoc -v '$?' 以及 perldoc -f > system。 > > 2011/10/15 Yisong Zhen <[email protected]>: >> 没有什么额外的信息,只是说程序的第9行: >> die cannot excute the proram: at temp.pl line 9. >> >> 一松 >> >> 2011/10/15 Robin Lee <[email protected]>: >>> 改用 >>> die "cannot excute the proram: $!" >>> 看看有什么系统错误信息 >>> >>> 2011/10/15 Yisong Zhen <[email protected]>: >>>> 诸位,一个小问题: >>>> >>>> 该脚本运行在Fedora15上面:但是无法执行system里面的程序。但是,程序不用借助perl外部调用可以正确执行。 >>>> 即,我直接在linux命令行敲入:dialign2-2 -fn promoter.out -n promoter.seq >>>> 可以执行程序。 >>>> >>>> 起初我觉得是路径不对,我输出了路径,发现是正确的,而且所需的DIALIGN2_DIR变量也设置正确。 >>>> 代码如下: >>>> >>>> #!/usr/bin/perl >>>> >>>> #my $dir = $ENV{'DIALIGN2_DIR'}; >>>> #my $path = $ENV{'PATH'}; >>>> >>>> >>>> my $commandLine = "dialign2-2 -fn promoter.out -n promoter.seq"; >>>> my $returnValue = system($commandLine) || die "cannot excute the >>>> proram"; >>>> >>>> 非常感谢能有人出手帮助。 >>>> >>>> 甄一松 >> >> -- -- 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的“PerlChina Mongers 讨论组”论坛。 要向此网上论坛发帖,请发送电子邮件至 [email protected]。 要取消订阅此网上论坛,请发送电子邮件至 [email protected]。 若有更多问题,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。
