Um colega pediu para que rodasse uns dados binarios para obtenção de dissimilaridade e respectivo dendrograma por meio da distância euclidiana. Eu sempre udei Jaccard ou Nei e Li para dados binários.
Mas, o pacote vegan tem a função vegdist que aceita binários para euclidiana. Rodei os dados e a matriz de dissimilaridade tem valores entre 0 e 4! Eu esperava valores entre 0 e 1! Eis o código: library(vegan) library(MASS) lili.dist.euc <- vegdist(lili, method="euclidian", binary=TRUE) lili.clua.euc <- hclust(lili.dist.euc, "average") plot(lili.clua.euc, cex=0.9, hang = -1) Pergunto: Tem algo errado? Euclidiana é aplicada a dados binários? Se não, como argumentar com o colega e demovê-lo da ideia? Jaccard é melhor neste caso? Se desejar, posso disponibilizar o BD. Laia -- Marcelo _______________________________________________ R-br mailing list [email protected] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
