Pessoal,

Estou tentando ajustar a Estimativa de Máxima Máxima Penalizada de Firth
para a regressão logística implementada no pacote logistf para um conjunto
de rasters (imagens), mas estou com problemas para implementá-lo usando
rasters e vetores numéricos. Para ilustrar o problema:

library(raster)
library(logistf)

# Criando 2 rasters para reproduzir o que estou enfrentando
r <- raster(nrow=10, ncol=10)

# Variável-raster resposta (binária) com 9 bandas/layers
s1 <- lapply(1:9, function(i) setValues(r, sample(0:1,ncell(r),replace =
T)))
s1 <- stack(s1)

# um raster-variável preditora
val <- sample(0:60,ncell(r),replace = T)
s2 <- raster(nrow=10, ncol=10,vals=val)

plot(s1)
plot(s2)

# Uma segunda variável preditora armazenada como vetor numérico: 9 valores
assim como existem 9 bandas/layres em s1 (não é coincidência)
exp_2 <- c(27.00,30.02,31.07,32.72,33.73,35.12,35.65,36.06,38.32)

Agora, eu quero ajustar o modelo usando o logistf (eu tenho motivos
estatísticos para isso, não reproduzido aqui) usando a função calc do
pacote raster. É aí que o mistério mora.

O raciocínio na formulação do problema é que cada célula/pixel seguiria a
segunite fórmula glm:

s1/layer1 ~ 27.00 + pixel correspondente em s2 + 27.00:pixel correspondente
em s2
s1/layer2 ~ 30.02 + pixel correspondente em s2 + 30.02:pixel correspondente
em s2
s1/layer3 ~ 31.07 + pixel correspondente em s2 + 31.07:pixel correspondente
em s2

... e assim por diante para todas as 9 bandas/layers do meu raster-variável
resposta s1, que são pareadas com valores de exp_2.

Eu tentei algo assim:

fun <- function (x) { logistf (x ~ exp_2 + s2 + exp_2:s2)$coeficients }
coefs <- calc(s1, fun)

Mas estava claro que não funcionaria. A parte complicada é infomar ao
script que eu quero que cada valor de exp_2 seja usado com cada camada
raster de s1 para este modelo.

Qualquer idéia será muito útil. Idéias?

Obrigado e abraços.

*Jefferson Ferreira-Ferreira, **PhD (abd)*

*Geographer*



*Ecosystem Dynamics Observatory <http://tscanada.wix.com/ecodyn> -
EcoDyn/UNESP*
*Department of **Geography *
*Institute of Geosciences and Exact Sciences** (IGCE)*
*São Paulo State University (UNESP)*
*Rio Claro, SP - Brazil*
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