Prezados, Como Tura, uso os dados do DATASUS há muitos anos. Não encontrei nada melhor do que manter uma cópia dos dados em sua máquina e extrair os dados de interesse direto dos DBC. Isso porque as bases não são muito uniformes e as correções nos scripts são relativamente frequentes. Apesar do trabalho maravilhoso que o DATASUS faz nas bases, pois seria um verdadeiro pesadelo usar os dados verdadeiramente crus.
Já os dados individualizados não são exatamente o problema, os arquivos DBC fornecem dados individualizados por ficha de registro em cada sistema. Então, se o objetivo for a identificação dos pacientes, isso já não será possível pelos dados públicos. Por fim, minha experiência pessoal (que é maior no caso das AIH) me levou a trabalhar com data.table por razão de performance. Embora não seja uma recomendação definitiva, fica a sugestão. Pedro Paulo Chrispim Inst. Alicerce > On 10 Jul 2024, at 11:00, r-br-requ...@listas.c3sl.ufpr.br wrote: > > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br@listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-requ...@listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-ow...@listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Re: Extração de Dados do SUS (Cesar Rabak) > 2. Re: Extração de Dados do SUS (Bernardo Rangel Tura) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Tue, 9 Jul 2024 23:49:28 -0300 > From: Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com> > To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. > <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS > Message-ID: > <CAKrF98kbYG82aR9nF_qB4crhJMm9x2xJ6BG2cuzjNUTV4-=o...@mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Se o formato do SISAB for documentada certamente é factível gerar um código > para extrair os dados e colocá-los nas estruturas de dados convenientes > para uso no R, provavelmente dataframes ou os mais modernos tibles. > > On Tue, Jul 9, 2024 at 9:07?PM Hidelbrando Rodrigues por (R-br) < > r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > >> Olá a todos. >> >> Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório >> de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do >> Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ. >> >> Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será >> hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e >> gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis >> para baixar. >> >> Diante do exposto, seguem as questões: >> >> * Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do >> site?? >> >> * Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado >> nesta conversa? >> >> Att. >> >> Hidelbrando >> >> >> >> >> Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) < >> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >> >>> Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente >>> Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital >>> universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, >>> atende mais de 100 municípios ao redor. >>> Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não >>> exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). >>> Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento >>> ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma >>> analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar >>> gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe >>> desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. >>> Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma >>> tentativa seria extraí-los pelo R. >>> >>> Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) < >>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>> >>>> Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas >>>> usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque >>>> as bases são muito mal feitas. >>>> Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver >>>> esse tipo de encrenca. >>>> Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você? >>>> >>>> Bernardo Tura >>>> NBB - INC/MS >>>> On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >>>> >>>> Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção >>>> Ambulatorial ? Individualizado*) ? >>>> >>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho <ecaca...@gmail.com> >>>> escreveu: >>>> >>>>> Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados >>>>> de um CNES específico Rafael ? >>>>> >>>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha < >>>>> rfsalda...@gmail.com> escreveu: >>>>> >>>>>> Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber >>>>>> o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: >>>>>> cnes.datasus.gov.br >>>>>> On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote: >>>>>> >>>>>> Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. >>>>>> Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um >>>>>> hospital público específico >>>>>> >>>>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) < >>>>>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>>>>> >>>>>>> Olá Elias, >>>>>>> >>>>>>> Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são >>>>>>> registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de >>>>>>> Informações Ambulatoriais. >>>>>>> >>>>>>> Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote >>>>>>> {microdatasus} >>>>>>> >>>>>>> https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/ >>>>>>> >>>>>>> Posso te ajudar com mais detalhes se precisar. >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> Abraços, >>>>>>> >>>>>>> Raphael Saldanha >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >>>>>>> >>>>>>> Bom dia pessoal >>>>>>> Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos >>>>>>> do SUS ? >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> -- >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> *In Jesu et Maria * >>>>>>> >>>>>>> *Obrigado / Thank you * >>>>>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>>>>> >>>>>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >>>>>>> is he who has been able to understand the cause of things" * >>>>>>> >>>>>>> _______________________________________________ >>>>>>> R-br mailing >>>>>>> listr...@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>>>>> código mínimo reproduzível. >>>>>>> >>>>>>> _______________________________________________ >>>>>>> R-br mailing list >>>>>>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >>>>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>>>>> código mínimo reproduzível. >>>>>>> >>>>>> >>>>>> >>>>>> -- >>>>>> >>>>>> >>>>>> *In Jesu et Maria * >>>>>> >>>>>> *Obrigado / Thank you * >>>>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>>>> >>>>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >>>>>> is he who has been able to understand the cause of things" * >>>>>> >>>>>> >>>>> >>>>> -- >>>>> >>>>> >>>>> *In Jesu et Maria * >>>>> >>>>> *Obrigado / Thank you * >>>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>>> >>>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >>>>> is he who has been able to understand the cause of things" * >>>>> >>>> >>>> >>>> -- >>>> >>>> >>>> *In Jesu et Maria * >>>> >>>> *Obrigado / Thank you * >>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>> >>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is >>>> he who has been able to understand the cause of things" * >>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing >>>> listr...@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing list >>>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>> >>> >>> -- >>> >>> >>> *In Jesu et Maria* >>> >>> *Obrigado / Thank you* >>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>> >>> *"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he >>> who has been able to understand the cause of things"* >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>> código mínimo reproduzível. >>> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: > <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20240709/94c49b96/attachment-0001.htm> > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Wed, 10 Jul 2024 08:39:58 -0300 > From: Bernardo Rangel Tura <listasrt...@gmail.com> > To: "Hidelbrando Rodrigues por (R-br)" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS > Message-ID: <65425f85-4744-43e2-854e-04a8b521e...@gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed" > > Bom dia Hidelbrando > > Eu nunca trabalhei com dados do SISAB mas acredito qeu seja possivel > fazer sim e tipo de rotina, teria que ver o formato dos dados, um > pacote que pode ser interessante para você é o SIDRA > > Abraços > > Bernardo Tura > > NBB - INC/MS > > > On 7/9/24 21:06, Hidelbrando Rodrigues por (R-br) wrote: >> Olá a todos. >> >> Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP >> (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui >> da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos >> Estratégicos do FIOCRUZ. >> >> Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será >> hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e >> gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão >> amigáveis para baixar. >> >> Diante do exposto, seguem as questões: >> >> * Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do >> site?? >> >> * Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do >> mencionado nesta conversa? >> >> Att. >> >> Hidelbrando >> >> >> >> >> Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) >> <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >> >> Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente >> Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso >> hospital universitário que atende muita gente, se não me engano >> além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. >> Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e >> este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). >> Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento >> ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de >> forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria >> de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para >> minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas >> informações. >> Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma >> tentativa seria extraí-los pelo R. >> >> Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por >> (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >> >> Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as >> pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, >> quase sempre porque as bases são muito mal feitas. >> Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a >> resolver esse tipo de encrenca. >> Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você? >> >> Bernardo Tura >> NBB - INC/MS >> >> On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >>> Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de >>> Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ? >>> >>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho >>> <ecaca...@gmail.com> escreveu: >>> >>> Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para >>> extrair dados de um CNES específico Rafael ? >>> >>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha >>> <rfsalda...@gmail.com> escreveu: >>> >>> Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, >>> você precisa saber o código CNES da unidade de saúde. >>> Você pode procurar o código aqui: cnes.datasus.gov.br >>> <http://cnes.datasus.gov.br> >>> >>> On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote: >>>> Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. >>>> Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair >>>> informações de um hospital público específico >>>> >>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael >>>> Saldanha por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>>> >>>> Olá Elias, >>>> >>>> Os dados de atendimentos ambulatoriais da >>>> dimensão pública do SUS são registrados em um >>>> sistema de informações em saúde denominado >>>> Sistema de Informações Ambulatoriais. >>>> >>>> Você consegue acessar esses dados com o R usando >>>> o pacote {microdatasus} >>>> >>>> https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/ >>>> >>>> Posso te ajudar com mais detalhes se precisar. >>>> >>>> >>>> Abraços, >>>> >>>> Raphael Saldanha >>>> >>>> >>>> On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) >>>> wrote: >>>>> Bom dia pessoal >>>>> Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia >>>>> dados de atendimentos do SUS ? >>>>> >>>>> >>>>> >>>>> -- >>>>> /In Jesu et Maria >>>>> >>>>> / >>>>> /Obrigado / Thank you >>>>> / >>>>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>>>> / >>>>> / >>>>> / >>>>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" >>>>> (Virgil 29 BC) >>>>> "Blessed is he who has been able to understand >>>>> the cause of things" >>>>> / >>>>> >>>>> _______________________________________________ >>>>> R-br mailing list >>>>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >>>>> >>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>>> Leia o guia de postagem >>>>> (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing list >>>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>> Leia o guia de postagem >>>> (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>>> >>>> >>>> -- >>>> /In Jesu et Maria >>>> >>>> / >>>> /Obrigado / Thank you >>>> / >>>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>>> / >>>> / >>>> / >>>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil >>>> 29 BC) >>>> "Blessed is he who has been able to understand the >>>> cause of things" >>>> / >>> >>> >>> >>> -- >>> /In Jesu et Maria >>> >>> / >>> /Obrigado / Thank you >>> / >>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>> / >>> / >>> / >>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) >>> "Blessed is he who has been able to understand the cause >>> of things" >>> / >>> >>> >>> >>> -- >>> /In Jesu et Maria >>> >>> / >>> /Obrigado / Thank you >>> / >>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>> / >>> / >>> / >>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) >>> "Blessed is he who has been able to understand the cause of >>> things" >>> / >>> >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>> código mínimo reproduzível. >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e >> forneça código mínimo reproduzível. >> >> >> >> -- >> /In Jesu et Maria >> >> / >> /Obrigado / Thank you >> / >> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >> / >> / >> / >> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) >> "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" >> / >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e >> forneça código mínimo reproduzível. >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código >> mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: > <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20240710/5629f82b/attachment-0001.htm> > > ------------------------------ > > Subject: Legenda do Digest > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br@listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > ------------------------------ > > Fim da Digest R-br, volume 155, assunto 3 > ***************************************** _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
