Sem divergir do Maurício Sangiogo, adiciono que se o teste *post hoc* proposto por Scott-Knott parecer-lhe adequado (após examinar os pressupostos e exigências para que ele seja aplicável), que veja a aplicação da extensão dele para tamanhos de efeito (embora ele vá para o lado dos efeitos "padronizados") o ScottKnotESD: The ScottKnott Effect Size Difference (ESD) test HTH -- Cesar Rabak
On Sun, Mar 30, 2025 at 1:34 AM Maurício Sangiogo por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > Emerson, estude a possibilidade de uso de teste mais adequado, talvez o > teste de agrupamento de médias de Skot Knott. Terá mais objetividade já > separação dos grupos. > > Atenciosamente, > > Maurício Sangiogo > > Obter o Outlook para Android <https://aka.ms/AAb9ysg> > ------------------------------ > *From:* R-br <r-br-boun...@listas.c3sl.ufpr.br> on behalf of > r-br-requ...@listas.c3sl.ufpr.br <r-br-requ...@listas.c3sl.ufpr.br> > *Sent:* Saturday, March 29, 2025 12:00:02 PM > *To:* r-br@listas.c3sl.ufpr.br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > *Subject:* Digest R-br, volume 160, assunto 2 > > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br@listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > > https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf.ufpr.br%2Fcgi-bin%2Fmailman%2Flistinfo%2Fr-br&data=05%7C02%7C%7Cd53889822bd340c03db608dd6ed266fe%7C84df9e7fe9f640afb435aaaaaaaaaaaa%7C1%7C0%7C638788572198528281%7CUnknown%7CTWFpbGZsb3d8eyJFbXB0eU1hcGkiOnRydWUsIlYiOiIwLjAuMDAwMCIsIlAiOiJXaW4zMiIsIkFOIjoiTWFpbCIsIldUIjoyfQ%3D%3D%7C0%7C%7C%7C&sdata=3mYSBG46TRoe6ZB1Bsptm3BXCzWDIbABtfQTvyHZU9A%3D&reserved=0 > <https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-requ...@listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-ow...@listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Re: TukeyHSD (Cesar Rabak) > 2. Re: TukeyHSD (Cesar Rabak) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Fri, 28 Mar 2025 13:13:15 -0300 > From: Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com> > To: Emerson Cotta Bodevan <bodevan...@gmail.com> > Cc: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. > <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] TukeyHSD > Message-ID: > <CAKrF98=K6E0MCv_mYZiMLagQHvUXDxH3_gOdNXD3AX=N2F2= > 2...@mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > @Emerson: > > Considere adicionar às suas análises uma medida e discussão sobre os > tamanhos dos efeitos observados. > > Ademais, além da diferença mínima detectável dada pelo teste *post > hoc* utilizado, > aconselho a verificar qual a acurácia (ou pensando estatisticamente, o > intervalo de confiança) das medidas da variável resposta, que tendo sido > feito a ANOVA, pressuponho seja contínua, pelo menos intervalar. > > HTH > > -- > Cesar Rabak > > > > On Fri, Mar 28, 2025 at 8:49?AM Emerson Cotta Bodevan < > bodevan...@gmail.com> > wrote: > > > Prezados, bom dia. > > > > Primeiramente, obrigado a todos pelo rápido retorno. > > > > Marcelo e Fernando... todas as soluções apresentadas funcionaram > > direitinho. Obrigado. > > > > Luiz e Cesar... obrigado pelas considerações. São 24 tratamentos, o que > > nos leva a 276 comparações dois a dois. Mas consigo separar em blocos de > 8 > > tratamentos. Acredito que as discussões serão mais ricas e o teste mais > > adequado. Obrigado mais uma vez. > > > > Abraços. > > > > *Emerson* > > > > > > Em qui., 27 de mar. de 2025 às 23:50, Cesar Rabak por (R-br) < > > r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > > > >> Pegando carona na resposta do Luiz Alexandre sobre a inadequação do > >> número de tratamentos, que eu concordo, gostaria de acrescentar que > >> parece-me que há poucos casos para o número de tratamentos (a divisão > do nº > >> de casos pelo dos tratamentos não dá nem inteiro, o que me leva a pensar > >> que ANOVA pode estar desbalanceada, também...). > >> > >> Uma outra questão mais prática é por que a ANOVA precisa de tantas > >> linhas, a menos que sua formulação inclua interações entre os > tratamentos. > >> > >> HTH > >> > >> On Thu, Mar 27, 2025 at 6:01?PM Luiz Peternelli por (R-br) < > >> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > >> > >>> Olá. > >>> Você precisa fazer isso no R? Fará essa análise comparativa de maneira > >>> recorrente, ou somente uma vez e apresentará os resultados num paper? > >>> Se fará somente uma vez e se todos os tratamentos tiverem o mesmo > número > >>> de repetições, fazer à mão é extremamente simples, já q o delta da > >>> diferença mínima significativa será único. > >>> > >>> Outro ponto importante: na prática usar esse teste quando se tem muito > >>> tratamentos é inadequado. Só vai trazer mais confusão interpretativa > do que > >>> auxílio em tomada de decisão. > >>> > >>> Abraços > >>> > >>> ?Luiz Alexandre Peternelli > >>> > >>> > >>> > >>> > >>> > >>> On Thu, Mar 27, 2025 at 16:06 Marcelo Laia por (R-br) < > >>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > >>> > >>>> Oi Emerson, você já testou uma das três opções abaixo? > >>>> > >>>> Opção 1: Aumentar o limite de impressão > >>>> > >>>> options(max.print = 10000) # ou qualquer valor maior que o número de > >>>> linhas > >>>> print(resultado) > >>>> > >>>> Opção 2: Acessar diretamente os resultados > >>>> > >>>> resultado$`nome_do_fator` # substitua pelo nome real do fator > >>>> > >>>> Exemplo: > >>>> > >>>> resultado <- TukeyHSD(aov(valor ~ tratamento, data = dados)) > >>>> View(resultado$tratamento) # abrir em visualização tabular > >>>> > >>>> Opção 3: Exportar para Excel ou CSV > >>>> > >>>> write.csv(resultado$tratamento, "tukey_resultados.csv") > >>>> > >>>> Teoricamente, essas abordagens permitirão acessar todas as > comparações, > >>>> inclusive as omitidas. > >>>> > >>>> Marcelo > >>>> > >>>> Enviado a partir de dispositivo móvel > >>>> > https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flinktr.ee%2Fmarcelolaia&data=05%7C02%7C%7Cd53889822bd340c03db608dd6ed266fe%7C84df9e7fe9f640afb435aaaaaaaaaaaa%7C1%7C0%7C638788572198568510%7CUnknown%7CTWFpbGZsb3d8eyJFbXB0eU1hcGkiOnRydWUsIlYiOiIwLjAuMDAwMCIsIlAiOiJXaW4zMiIsIkFOIjoiTWFpbCIsIldUIjoyfQ%3D%3D%7C0%7C%7C%7C&sdata=L13gSj%2FOXCh%2BB1G2hYQ7XO0kzWB0%2Fhb7LmLwTrGwe2A%3D&reserved=0 > <https://linktr.ee/marcelolaia> > >>>> > >>>> Em qui., 27 de mar. de 2025, 15:08, Emerson Cotta Bodevan por (R-br) < > >>>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > >>>> > >>>>> Prezados, boa tarde. > >>>>> > >>>>> Fiz um teste de Tukey, usando o comando > >>>>> > >>>>> resultado<-TukeyHSD(resultado de uma anova) > >>>>> > >>>>> O arquivo tem 276 linhas (24 tratamentos diferentes). > >>>>> > >>>>> Como faço para ver todas as comparações? > >>>>> > >>>>> Pergunto porque o R da a mensagem > >>>>> > >>>>> [ reached getOption("max.print") -- omitted 26 rows ] > >>>>> > >>>>> > >>>>> Entendo que ele omitiu 26 linhas. > >>>>> > >>>>> OBS.: Preciso dos resultados para preencher as letras que diferenciam > >>>>> as linhas na tabela de resultados. > >>>>> > >>>>> > >>>>> > >>>>> Agradeço qualquer ajuda. > >>>>> > >>>>> *Emerson* > >>>>> _______________________________________________ > >>>>> R-br mailing list > >>>>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br > >>>>> > https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf.ufpr.br%2Fcgi-bin%2Fmailman%2Flistinfo%2Fr-br&data=05%7C02%7C%7Cd53889822bd340c03db608dd6ed266fe%7C84df9e7fe9f640afb435aaaaaaaaaaaa%7C1%7C0%7C638788572198588277%7CUnknown%7CTWFpbGZsb3d8eyJFbXB0eU1hcGkiOnRydWUsIlYiOiIwLjAuMDAwMCIsIlAiOiJXaW4zMiIsIkFOIjoiTWFpbCIsIldUIjoyfQ%3D%3D%7C0%7C%7C%7C&sdata=p5CtDgDDxVzbtt9FZRUHH56RduPaNKr6dqwP7WwL1Ug%3D&reserved=0 > <https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> > >>>>> Leia o guia de postagem ( > https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufpr.br%2Fr-br-guia&data=05%7C02%7C%7Cd53889822bd340c03db608dd6ed266fe%7C84df9e7fe9f640afb435aaaaaaaaaaaa%7C1%7C0%7C638788572198603572%7CUnknown%7CTWFpbGZsb3d8eyJFbXB0eU1hcGkiOnRydWUsIlYiOiIwLjAuMDAwMCIsIlAiOiJXaW4zMiIsIkFOIjoiTWFpbCIsIldUIjoyfQ%3D%3D%7C0%7C%7C%7C&sdata=BNX2JsoEvVvziyYTqARpqC5%2BV1Fr%2FNO3inYy%2FtyWGZA%3D&reserved=0 > <http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça > >>>>> código mínimo reproduzível. > >>>>> > >>>> _______________________________________________ > >>>> R-br mailing list > >>>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br > >>>> > 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reproduzível. > >> > > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Flistas.inf.ufpr.br%2Fpipermail%2Fr-br%2Fattachments%2F20250328%2F353d2be8%2Fattachment-0001.htm&data=05%7C02%7C%7Cd53889822bd340c03db608dd6ed266fe%7C84df9e7fe9f640afb435aaaaaaaaaaaa%7C1%7C0%7C638788572198686930%7CUnknown%7CTWFpbGZsb3d8eyJFbXB0eU1hcGkiOnRydWUsIlYiOiIwLjAuMDAwMCIsIlAiOiJXaW4zMiIsIkFOIjoiTWFpbCIsIldUIjoyfQ%3D%3D%7C0%7C%7C%7C&sdata=vaDJxbnaEY%2BiTFf1qnA1eaEPoy%2BhJpRlWVcLnOUVPMw%3D&reserved=0 > <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20250328/353d2be8/attachment-0001.htm> > > > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Fri, 28 Mar 2025 13:37:14 -0300 > From: Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com> > To: Emerson Cotta Bodevan <bodevan...@gmail.com> > Cc: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. > <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] TukeyHSD > Message-ID: > <CAKrF98= > 5mspvf215ppjeey+qrf820r+vbte4wyvhazwkdms...@mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Como apoio à minha última observação cito dois autores, que eu coloco nos > meus relatórios quando é feita uma análise estatística: HTH > > ?*Always present effect sizes for primary outcomes ? If the units of > measurement are meaningful on a practical level ?, then we usually prefer > an unstardardized measurement to a standardized measure*.? > > ? *(Wilkison, L., 1999)**.* > > ?*In the post p <0.05 era, scientific argumentation is not based on > whether a p-value is small enough or not. Attention is paid to effect sizes > and confidence intervals. Evidence is thought of as being continuous rather > than some sort of dichotomy*.? > > ? *Ron Wasserstein, executive director of the American Statistical > Association**, 2016.* > > > HTH > > -- > > Cesar Rabak > > On Fri, Mar 28, 2025 at 1:13?PM Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com> wrote: > > > @Emerson: > > > > Considere adicionar às suas análises uma medida e discussão sobre os > > tamanhos dos efeitos observados. > > > > Ademais, além da diferença mínima detectável dada pelo teste *post hoc* > utilizado, > > aconselho a verificar qual a acurácia (ou pensando estatisticamente, o > > intervalo de confiança) das medidas da variável resposta, que tendo sido > > feito a ANOVA, pressuponho seja contínua, pelo menos intervalar. > > > > HTH > > > > -- > > Cesar Rabak > > > > > > > > On Fri, Mar 28, 2025 at 8:49?AM Emerson Cotta Bodevan < > > bodevan...@gmail.com> wrote: > > > >> Prezados, bom dia. > >> > >> Primeiramente, obrigado a todos pelo rápido retorno. > >> > >> Marcelo e Fernando... todas as soluções apresentadas funcionaram > >> direitinho. Obrigado. > >> > >> Luiz e Cesar... obrigado pelas considerações. São 24 tratamentos, o que > >> nos leva a 276 comparações dois a dois. Mas consigo separar em blocos > de 8 > >> tratamentos. Acredito que as discussões serão mais ricas e o teste mais > >> adequado. Obrigado mais uma vez. > >> > >> Abraços. > >> > >> *Emerson* > >> > >> > >> Em qui., 27 de mar. de 2025 às 23:50, Cesar Rabak por (R-br) < > >> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > >> > >>> Pegando carona na resposta do Luiz Alexandre sobre a inadequação do > >>> número de tratamentos, que eu concordo, gostaria de acrescentar que > >>> parece-me que há poucos casos para o número de tratamentos (a divisão > do nº > >>> de casos pelo dos tratamentos não dá nem inteiro, o que me leva a > pensar > >>> que ANOVA pode estar desbalanceada, também...). > >>> > >>> Uma outra questão mais prática é por que a ANOVA precisa de tantas > >>> linhas, a menos que sua formulação inclua interações entre os > tratamentos. > >>> > >>> HTH > >>> > >>> On Thu, Mar 27, 2025 at 6:01?PM Luiz Peternelli por (R-br) < > >>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > >>> > >>>> Olá. > >>>> Você precisa fazer isso no R? Fará essa análise comparativa de maneira > >>>> recorrente, ou somente uma vez e apresentará os resultados num paper? > >>>> Se fará somente uma vez e se todos os tratamentos tiverem o mesmo > >>>> número de repetições, fazer à mão é extremamente simples, já q o > delta da > >>>> diferença mínima significativa será único. > >>>> > >>>> Outro ponto importante: na prática usar esse teste quando se tem muito > >>>> tratamentos é inadequado. Só vai trazer mais confusão interpretativa > do que > >>>> auxílio em tomada de decisão. > >>>> > >>>> Abraços > >>>> > >>>> ?Luiz Alexandre Peternelli > >>>> > >>>> > >>>> > >>>> > >>>> > >>>> On Thu, Mar 27, 2025 at 16:06 Marcelo Laia por (R-br) < > >>>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > >>>> > >>>>> Oi Emerson, você já testou uma das três opções abaixo? > >>>>> > >>>>> Opção 1: Aumentar o limite de impressão > >>>>> > >>>>> options(max.print = 10000) # ou qualquer valor maior que o número de > >>>>> linhas > >>>>> print(resultado) > >>>>> > >>>>> Opção 2: Acessar diretamente os resultados > >>>>> > >>>>> resultado$`nome_do_fator` # substitua pelo nome real do fator > >>>>> > >>>>> Exemplo: > >>>>> > >>>>> resultado <- TukeyHSD(aov(valor ~ tratamento, data = dados)) > >>>>> View(resultado$tratamento) # abrir em visualização tabular > >>>>> > >>>>> Opção 3: Exportar para Excel ou CSV > >>>>> > >>>>> write.csv(resultado$tratamento, "tukey_resultados.csv") > >>>>> > >>>>> Teoricamente, essas abordagens permitirão acessar todas as > >>>>> comparações, inclusive as omitidas. > >>>>> > >>>>> Marcelo > >>>>> > >>>>> Enviado a partir de dispositivo móvel > >>>>> > https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flinktr.ee%2Fmarcelolaia&data=05%7C02%7C%7Cd53889822bd340c03db608dd6ed266fe%7C84df9e7fe9f640afb435aaaaaaaaaaaa%7C1%7C0%7C638788572198699516%7CUnknown%7CTWFpbGZsb3d8eyJFbXB0eU1hcGkiOnRydWUsIlYiOiIwLjAuMDAwMCIsIlAiOiJXaW4zMiIsIkFOIjoiTWFpbCIsIldUIjoyfQ%3D%3D%7C0%7C%7C%7C&sdata=aQEGdKskupy%2BHtfg5Av6DEz47CaF29C3DGxhHGtGnYo%3D&reserved=0 > <https://linktr.ee/marcelolaia> > >>>>> > >>>>> Em qui., 27 de mar. de 2025, 15:08, Emerson Cotta Bodevan por (R-br) > < > >>>>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > >>>>> > >>>>>> Prezados, boa tarde. > >>>>>> > >>>>>> Fiz um teste de Tukey, usando o comando > >>>>>> > >>>>>> resultado<-TukeyHSD(resultado de uma anova) > >>>>>> > >>>>>> O arquivo tem 276 linhas (24 tratamentos diferentes). > >>>>>> > >>>>>> Como faço para ver todas as comparações? > >>>>>> > >>>>>> Pergunto porque o R da a mensagem > >>>>>> > >>>>>> [ reached getOption("max.print") -- omitted 26 rows ] > >>>>>> > >>>>>> > >>>>>> Entendo que ele omitiu 26 linhas. > >>>>>> > >>>>>> OBS.: Preciso dos resultados para preencher as letras que > diferenciam > >>>>>> as linhas na tabela de resultados. > >>>>>> > >>>>>> > >>>>>> > >>>>>> Agradeço qualquer ajuda. > >>>>>> > >>>>>> *Emerson* > >>>>>> _______________________________________________ > >>>>>> R-br mailing list > >>>>>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br > >>>>>> > 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