Gracias Javier Rub�n y Freddy por las respuestas. Efectivamente probablemente se deba a que el modelo es muy complicado, aunque comparando diferentes modelos con la funci�n anova, el modelo que mejor se ajusta a los datos es el m�s complejo, incluyendo todos los factores random. Un saludo.
> Date: Mon, 20 Oct 2014 00:55:51 -0300 > Subject: Re: [R-es] Warnings en GLMM (lme4) > From: [email protected] > To: [email protected] > CC: [email protected] > > Hola Javier. Talvez peque de obvio, pero tu problema no es exactamente > del software sino del modelo. El mensaje es claro: casi no es > identificable. Puedes aumentar el n�mero de iteraciones para ver si > este modelo espec�fico converge felizmente (no s� si tenga esta opci�n > la funci�n). > > Lo que yo, externamente, sospecho, es que el modelo tiene muchos > efectos aleatorios (a�o, nido, hembra, macho) y posiblemente una gran > cantidad de interacciones. Considera correr un modelo con un > intercepto aleatorio primero y observa si obtienes warnings por > convergencia. Eso te dar� ideas del problema. > > �Salud! > > On 10/19/14, javier bueno enciso <[email protected]> wrote: > > Hola, > > Soy nuevo manejando R y no tengo mucha experiencia. Estoy intentando modelar > > una funci�n que me relacione el n� de cebas (n� de presas que los padres > > traen a los pollos) con el tama�o de parche de un bosque (factor categ�rico; > > 2 niveles= grande y peque�o). Al ser un conteo (n� de cebas) he pensado > > utilizar familia= poisson con link= logar�tmico. He construido un GLMM con: > > N� de cebas (variable respuesta), Duraci�n del video (esfuerzo de muestreo: > > 60, 50 y 45 minutos) como una offset en el modelo (transform�ndola > > previamente por el logaritmo). Tama�o de parche, factor explicativo, N� de > > pollos y fecha de puesta covariables. Adem�s he incluido como random el a�o > > de estudio (3 a�os), el ID del nido anidado dentro del ID de cada parche > > (tengo varios parches, grandes y peque�os) y la identidad del padre y de la > > madre tambi�n como r�ndom, puesto que se pueden repetir entre a�os. La > > estructura de mi modelo es la siguiente: > > #paquete(lme4), mi versi�n de R es la 3.1.1. > > > > m1<- glmer(ncebas~offset(LogDur_video)+ Tama�oParche*Ldate*Csize+(1|YEAR) + > > (1|Bosque/nideo)+ (1|Hembra) + (1|Macho), data=Cebas, > > family=poisson(link=log)) #con todas las variables e interacciones posibles > > para que sirva como referencia a la hora de la selecci�n del modelo final. > > > > El modelo me funciona, sin embargo me aparecen unos warnings que no s� a que > > se deben ni la importancia real en el c�culo de mi modelo. Mi pregunta es si > > alguien en el foro sabe porqu� aparecen y como solucionarlos. Los warnings > > son: > > > > Warning messages: > > 1: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : > > Model failed to converge with max|grad| = 0.00431561 (tol = 0.001, > > component 7) > > 2: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : > > Model is nearly unidentifiable: very large eigenvalue > > - Rescale variables?;Model is nearly unidentifiable: large eigenvalue > > ratio > > - Rescale variables? > > Muchas gracias, atentamente, > > Javier > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > > -- > �No soy aquellas sombras tutelares > que honr� con versos que no olvida el tiempo.� > > JL Borges [[alternative HTML version deleted]]
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