Hola, Fernando,

El tema de optimizaci�n de puntos de corte es un cl�sico del diagn�stico 
(enfermo / no enfermo), objetivo que es directamente aplicable a cualquier otro 
criterio dicot�mico, con s�lo dos valores. En tu caso, en el que tienes 3, me 
pregunto si son estrictamente diferentes (p ej 3 tipos de algo) o tienen alguna 
ordenaci�n. Pero en cualquier caso puedes plantear 3 diagn�sticos: A contra 
(A,B), A contra (A,C), B contra (A,C). (Expresado un poco patatero, la verdad). 
Si hubiese una graduaci�n, por ejemplo gravedad, desde nada grave hasta muy 
grave, a lo mejor se puede proponer algo m�s sofisticado.

Un m�todo que se ha convertido en un est�ndar tanto para elegir puntos de corte 
�ptimo como para comparar modelos es la curva ROC. Pero para objetivos binarios 
(aunque hay evoluciones hacia varios tipos, no te puedo recomendar nada 
concreto). Hay montones de tutoriales y por supuesto librer�as R para hacer 
este tipo de an�lisis (ROCR y pROC), pero se suele obviar algo que en 
diagn�stico es esencial para determinar el punto de corte en una prueba (esto 
es b�sico en pruebas de detecci�n r�pida o screening): la tasa base o 
"prevalencia".

Aun a fuer de resultar un pedante, me gustar�a recomendar dos partes de mi 
tesis doctoral:
en 
http://concejero.wdfiles.com/local--files/tesis/04-comparacion%20curvas%20ROC.pdf
    (apartado 4.2.5) sobre tasa de prevalencia
y  
http://concejero.wdfiles.com/local--files/tesis/05-medidas%20de%20eficacia.pdf  
(apartado 5.4) con un ejemplo cl�sico sobre detecci�n de VIH (la base sobre la 
que se elabor� la prueba ELISA)

Lo malo es que en aquel tiempo (2004) yo no conoc�a R as� que no encontrar�s 
ah� nada sobre c�mo aplicarlo en un contexto R. Estoy en ello, aunque por si te 
resulta �til hay una charla did�ctica en el grupo R madrid del 27 febrero de 
2014 (http://madrid.r-es.org/page/3/), con c�digo y de hecho la charla est� 
grabada, usando un ejemplo del detecc. c�ncer de pr�stata con PSA (un marcador 
que se obtiene con una simple prueba de sangre).

Perd�n por el rollo, se nota que me gusta el tema, �no? Si alguna de estas 
cosas te valen y necesitas ayuda d�melo.

Saludos!
Pedro


El 26/01/2016 a las 21:59, 
[email protected]<mailto:[email protected]> 
escribi�:

Determinaci�n del punto de corte �ptimo (Fernando Sanchez)


--
Pedro Concejero
E-mail: 
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skype: pedro.concejero
twitter @ConcejeroPedro<https://twitter.com/ConcejeroPedro>
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Entusiasta R, me encontrar�is aqu� gRupo R madRid <http://madrid.r-es.org/>

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