Y así es como cada vez te debo más cervezas o cafés!
Mil gracias.
Me faltaba invocar *python*
*system(*
* paste0('python script.py ', paste0(ar[i], '1 '),
ar[i], paste0(' ', ar[i], '3') ) )*
Entiendo que el comando shell() es para que funcione en windows; en Linux
con el original system() es suficiente. Veo que tengo que hacer algo
también para que el sistema espere a que se termine de ejecutar el comando,
porque necesito que lea los ficheros que genera. Pero de eso me desasno
leyendo.
Gracias
Hau idatzi du Marcelino De La Cruz Rot ([email protected])
erabiltzaileak (2019 eka. 14, or. (12:52)):
> Hola Juan:
>
> en vez de system(), quería decir shell(), es decir:
>
> shell(
> paste0('script.py ',
>
> paste0(ar[i], '1 '),
> ar[i],
> paste0(' ', ar[i], '3')
> )
>
> )
>
> Si el script está en el working directory [getwd()], te debería
> funcionar sin problemas.
>
> Tanto system() como shell() te permiten interactuar con el sistema
> fácilmente. Cada una tiene sus peculiaridades. Consulta ?system y ?shell
>
>
>
>
>
> El 14/06/2019 a las 12:14, Juan Abasolo escribió:
> > Ni idea de eso; te lo agradezco. Seguramente lo voy a terminar usando
> > bastante.
> > Pregunto: ahí debería hacer todas las operaciones propias del sistema?
> > No me encuentra el script, y se me hace raro. Capaz que pasa al
> > sistema desde la carpeta en la que está el script de R, no desde el wd
> > de R.
> > Ahora me toca salir y después intentar probar y que funcione.
> > Gracis de vuelta
> >
> >
> >
> > Hau idatzi du Marcelino De La Cruz Rot ([email protected]
> > <mailto:[email protected]>) erabiltzaileak (2019 eka. 14, or.
> > (11:46)):
> >
> > ¿Has probado esto?
> >
> > system(
> > > paste0('script.py ',
> >
> > paste0(ar[i], '1 '),
> > ar[i],
> > paste0(' ', ar[i], '3')
> > )
> >
> > )
> >
> >
> >
> >
> > El 14/06/2019 a las 11:36, Juan Abasolo escribió:
> > > Hola, amigos
> > > Se me acabo la sapienza. A ver:
> > > tengo un sript de Python script.py que neesita sus argumentos
> > arg1 arg2
> > > arg3, si desde la consola del sistema me pongo en la carpeta en
> > la que lo
> > > tengo y hago:
> > > $ script.py arg1 arg arg3
> > > Funciona perfecto.
> > >
> > > Pero desde R no lo consigo (entiendo que por no saber)
> > >
> > > Lo hago así (copio y pego):
> > >
> > > dir <- getwd()
> > > setwd('data/row/directoriocondatos/')
> > >
> > > py_run_string(
> > > paste0('script.py ',
> > > paste0(ar[i], '1 '),
> > > ar[i],
> > > paste0(' ', ar[i], '3')
> > > ))
> > > setwd(dir)
> > >
> > > El resultado del paste0() ese lo pego en la consola del sistema y
> > > perfecto... pero olvidate del for. Yo quiero que el script quede
> > integrado
> > > para hacer todo de un solo paso, pero no sé.
> > >> paste0('script.py ',
> > > paste0(ar[i], '1 '),
> > > ar[i],
> > > paste0(' ', ar[i], '3')
> > > )
> > > [1] "script.py arg1 arg arg3" # Si eso lo pego en la consola,
> > todo bien.
> > >
> > > Eso significa que tengo que corregir algo de la orden, o
> > cambiarla o...
> > > manden
> > > Alguien que me desasne?
> > >
> > >
> >
> > --
> > Marcelino de la Cruz Rot
> > Depto. de Biología y Geología
> > Física y Química Inorgánica
> > Universidad Rey Juan Carlos
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> > Juan Abasolo
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> > Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA ikerketa taldea
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> > Euskal Herriko Unibertsitatea
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Juan Abasolo
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