Si eso no te va prueba esto
df2 <- data.frame(lapply(df[,c(1,2)], as.factor))
farms.mca <- mca(df2)farms.mcaSaludos    En domingo, 10 de mayo de 2020 
18:49:13 CEST, Emilio L. Cano <[email protected]> escribió:  
 
 

> El 10 may 2020, a las 13:26, Jose Betancourt B. <[email protected]> 
> escribió:
> 
> df %<>% mutate_if(is.character, as.factor)

Esto seguro que está mal, primero por el operador, y segundo que si lo pones 
así, sin asignar a nada, no sirve. Prueba:

df <- df %>% mutate_if(is.character, as.factor)

Y luego el resto
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