по твоему совету мы решили создать новую базу и перезалить данные.Вопрос - sync tables отключает триггера/внешние_ключи ?
Да. Потом после переливки делает сравнение и восстанавливает структуру (в вашем случае по убитой базе). Если в убитой базе чего-то нет - можете просто потом сравнить с нормальной структурой.

