Re: [R-es] Error al cargar el paquete tidyr

[Manuel Mendoza]

Solucionado, aunque no estoy seguro de cómo. Sé que finalmente lo pude
instalar de nuevo, y ya funciona.
Gracias a todos,
Manuel

El sáb, 23 ene 2021 a las 22:27, Marcelino de la Cruz Rot (<
marcelino.delac...@urjc.es>) escribió:

> Si da *el mismo* error, entonces, es que no se ha actualizado.
>
> Probablemente tengas que desconectarlo primero, es decir:
>
> detach("package:vctrs")
> install.packages("vctrs")
>
>
>
> El 23/01/2021 a las 21:59, Manuel Mendoza escribió:
> > Lo he actualizado, pero me sigue dando el mismo error.
> >
> > El sáb, 23 ene 2021 a las 14:48, Jesús Para Fernández (<
> > j.para.fernan...@hotmail.com>) escribió:
> >
> >> Te pide actializar el paquete vctrs. Desde rstudio puedes hacerlo sin
> >> problema
> >>
> >> Obtener Outlook para Android 
> >> --
> >> *From:* R-help-es  on behalf of Manuel
> >> Mendoza 
> >> *Sent:* Saturday, January 23, 2021 2:45:40 PM
> >> *To:* Lista R 
> >> *Subject:* [R-es] Error al cargar el paquete tidyr
> >>
> >> Lo había utilizado hasta ahora sin problemas.
> >>
> >> Error: package or namespace load failed for ‘tidyr’ in loadNamespace(i,
> >> c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
> >>   namespace ‘vctrs’ 0.2.4 is already loaded, but >= 0.3.0 is required.
> >>
> >> Gracias,
> >> Manuel
> >>
> >>  [[alternative HTML version deleted]]
> >>
> >> ___
> >> R-help-es mailing list
> >> R-help-es@r-project.org
> >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> >>
> >   [[alternative HTML version deleted]]
> >
> > ___
> > R-help-es mailing list
> > R-help-es@r-project.org
> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> > .
>
>
> --
> Marcelino de la Cruz Rot
> Depto. de Biología y Geología
> Física y Química Inorgánica
> Universidad Rey Juan Carlos
> Móstoles España
>
> ___
> R-help-es mailing list
> R-help-es@r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>

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Re: [R-es] Error al cargar el paquete tidyr

[Marcelino de la Cruz Rot]

Si da *el mismo* error, entonces, es que no se ha actualizado.

Probablemente tengas que desconectarlo primero, es decir:

detach("package:vctrs")
install.packages("vctrs")



El 23/01/2021 a las 21:59, Manuel Mendoza escribió:

Lo he actualizado, pero me sigue dando el mismo error.

El sáb, 23 ene 2021 a las 14:48, Jesús Para Fernández (<
j.para.fernan...@hotmail.com>) escribió:


Te pide actializar el paquete vctrs. Desde rstudio puedes hacerlo sin
problema

Obtener Outlook para Android 
--
*From:* R-help-es  on behalf of Manuel
Mendoza 
*Sent:* Saturday, January 23, 2021 2:45:40 PM
*To:* Lista R 
*Subject:* [R-es] Error al cargar el paquete tidyr

Lo había utilizado hasta ahora sin problemas.

Error: package or namespace load failed for ‘tidyr’ in loadNamespace(i,
c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
  namespace ‘vctrs’ 0.2.4 is already loaded, but >= 0.3.0 is required.

Gracias,
Manuel

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R-help-es@r-project.org
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.



--
Marcelino de la Cruz Rot
Depto. de Biología y Geología
Física y Química Inorgánica
Universidad Rey Juan Carlos
Móstoles España

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https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

Re: [R-es] Error al cargar el paquete tidyr

[Manuel Mendoza]

Lo he actualizado, pero me sigue dando el mismo error.

El sáb, 23 ene 2021 a las 14:48, Jesús Para Fernández (<
j.para.fernan...@hotmail.com>) escribió:

> Te pide actializar el paquete vctrs. Desde rstudio puedes hacerlo sin
> problema
>
> Obtener Outlook para Android 
> --
> *From:* R-help-es  on behalf of Manuel
> Mendoza 
> *Sent:* Saturday, January 23, 2021 2:45:40 PM
> *To:* Lista R 
> *Subject:* [R-es] Error al cargar el paquete tidyr
>
> Lo había utilizado hasta ahora sin problemas.
>
> Error: package or namespace load failed for ‘tidyr’ in loadNamespace(i,
> c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
>  namespace ‘vctrs’ 0.2.4 is already loaded, but >= 0.3.0 is required.
>
> Gracias,
> Manuel
>
> [[alternative HTML version deleted]]
>
> ___
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[R-es] predict.gbm

[Manuel Mendoza]

Muy buenas, utilizo el comando gbm.step (paquete dismo) para entrenar un
gradient boosting, directamente con el nº óptimo de árboles obtenido
mediante validación cruzada.

gbm.predict me permite obtener las predicciones para nuevos datos, pero yo
querría las que se obtuvieron en la VC (para las muestras test).

Con randomForest es muy fácil. Si yo no le indico los datos
en predict(fit), me da las predicciones sobre los datos OOB. Tenía la
esperanza de que fuera igual con predict.gbm, pero  me hace las
predicciones sobre los datos de entrenamiento.

En la documentación dice “predict.gbm produces predicted values for each
observation in newdata ... “. No encuentro en ningún sitio cómo obtener las
predicciones que se obtuvieron durante la VC. ¿Sabe alguien si es posible?

Gracias,

Manuel

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Re: [R-es] Error al cargar el paquete tidyr

[Carlos J. Gil Bellosta]

Hola, ¿qué tal?

¿Y si pruebas a actualizar R y todos los paquetes? ¿Sigue fallando entonces?

Un saludo,

Carlos J. Gil Bellosta
http://www.datanalytics.com


El sáb, 23 ene 2021 a las 14:46, Manuel Mendoza ()
escribió:

> Lo había utilizado hasta ahora sin problemas.
>
> Error: package or namespace load failed for ‘tidyr’ in loadNamespace(i,
> c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
>  namespace ‘vctrs’ 0.2.4 is already loaded, but >= 0.3.0 is required.
>
> Gracias,
> Manuel
>
> [[alternative HTML version deleted]]
>
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[R-es] Error al cargar el paquete tidyr

[Manuel Mendoza]

Lo había utilizado hasta ahora sin problemas.

Error: package or namespace load failed for ‘tidyr’ in loadNamespace(i,
c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
 namespace ‘vctrs’ 0.2.4 is already loaded, but >= 0.3.0 is required.

Gracias,
Manuel

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Re: [R-es] Fwd: weighted random forest

[Jose Luis Cañadas Reche]

Hola. Si tienes una columna con los pesos. con tidyverse es sencillo
hacer la muestra usando


tam_muestra <- 1000

muestra <- df %>%
  sample_n(size = tam_muestra,
   replace = TRUE,
   weight = pesos)



El 22/1/21 a las 17:58, Manuel Mendoza escribió:
> Gracias Jesús, sí, haré remuestreos. Yo suelo usar una función que me pasó
> un colega:
>
> # A function to generate the equal number of samples (n) for different
> classes
>
> bsample <- function(data,cname,n) {
>   d <- data[-c(1:nrow(data)),]
>   u <- unique(data[,cname])
>   for (uu in u) {
> w <- which(data[,cname] == uu)
> if (length(w) >= n) {
>   s <- sample(w,n)
> } else {
>   s <- sample(w,n,replace=TRUE)
> }
> d <- rbind(d,data[s,])
>   }
>   d
> }
>
> # for your data:
> table(data$Clst)
> mean<-mean(table(data$Clst))
> data <- bsample(data,'Clst',mean) # this takes 100 records for each class
> in your dataset
> table(data$Clst)
>
> Por si le sirve a alguien, Clst sería la variable objetivo.
> En vez de  bsample(data,'Clst',mean) se puede, p.e.,  (data,'Clst', *2**mean)
>
>
> Manuel
>
> El vie, 22 ene 2021 a las 16:10, Jesús Para Fernández (<
> j.para.fernan...@hotmail.com>) escribió:
>
>> Has probado en usar en vez de algoritmos sensibles al coste, usar técnicas
>> de remuestreo? Hay un paquete de la UGR llamado imbalance que funciona muy
>> bien.
>>
>>
>> --
>> *De:* R-help-es  en nombre de Manuel
>> Mendoza 
>> *Enviado:* viernes, 22 de enero de 2021 11:43
>> *Para:* Lista R 
>> *Asunto:* [R-es] weighted random forest
>>
>> Buenos días, tengo una base de datos desequilibrados (unbalanced) en la que
>> las ausencias son 9 veces más abundantes que las presencias (*ratio *= 9).
>> Para árboles de clasificación utilizo una matriz de pérdidas
>> parms=list(loss=matrix(c(0,
>> FP,  *ratio  *,0)))o un vector de ponderación que le da 9 veces más peso a
>> las presencias. Como cabría esperar, la sensibilidad y sensitividad se
>> hacen parecidas. Pasan de ser
>> 89/39 a 79/76 y kappa sube de 0.24 a 0.30.
>>
>> El problema surge cuando intento hacer lo mismo con random forest, y
>> supongo que no lo estoy haciendo bien. Uso  RFfit <- randomForest(Dep ~. ,
>> classwt = c(1, *ratio * ), data=data). La sensibilidad y sensitividad se
>> quedan casi igual 90/40 y kappa también 0.25.
>>
>> Sé que se puede hacer con ranger, pero, por razones que no vienen al caso,
>> no me viene bien cambiar.
>>
>> Gracias, como siempre,
>> Manuel
>>
>> [[alternative HTML version deleted]]
>>
>> ___
>> R-help-es mailing list
>> R-help-es@r-project.org
>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>
>   [[alternative HTML version deleted]]
>
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> R-help-es mailing list
> R-help-es@r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

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