Re: [R-es] DUDA LLENAR MATRIZ CREADA

2015-02-26 Por tema rubenfcasal

Hola David,

Puedes hacer como ya comentaron en las otras respuestas. Pero por 
si sirve de utilidad, pego  al final parte de un código que empleo para 
ilustrar la repetición de contrastes en simulación.


Está con un bucle y guardando en vectores, si se quisiera modificar 
para obtener una matriz y emplear lapply (o sapply), tendrías que crear 
una función del tipo:
fun.test - function(muestra) 
unlist(test(muestra)[c('statistic','p.value')])
reemplazando test por el contraste que te interesa (y suponiendo que 
devuelve el objeto estándar de clase htest).
sapply(muestras, fun.test) podría ser lo que buscas (suponiendo que 
muestras es una lista con los datos en cada componente). Para que 
conste, para ciertas cosas yo no soy reacio a emplear bucles en lugar de 
applies...


Un saludo, Rubén.


# --
# Repetición de contrastes
# --

# --
# Valores iniciales
set.seed(1) # Fijar semilla para reproductibilidad
n - 500
nsim - 1000
estadistico - numeric(nsim)
pvalor - numeric(nsim)


# --
# Realizar contrastes
for(isim in 1:nsim) {
  u - runif(n)
  tmp - ks.test(u, punif,  min=0, max=1)
  estadistico[isim] - tmp$statistic
  pvalor[isim] - tmp$p.value
}
#Probar a cambiar por u - rnorm(n) y tmp - ks.test(u, pnorm,  mean = 
mean(u), sd = sd(u))



# Mantengo algo del resto del código por si resulta de interés...

# --
# Proporción de rechazos
cat(\nProporción de rechazos al 1% =, mean(pvalor  0.01), \n)
cat(Proporción de rechazos al 5% =, mean(pvalor  0.01), \n)
cat(Proporción de rechazos al 10% =, mean(pvalor  0.01), \n)


# --
# Análisis del estadístico contraste

# Histograma
hist(estadistico, freq=FALSE)

#...

# --
# Análisis de los p-valores
# (si todo 'correcto' con distribución uniforme)

# Histograma
hist(pvalor, freq=FALSE)
curve(dunif(x,0,1), add=TRUE)   #abline(h=1)

# Test de Kolmogorov-Smirnov
ks.test(pvalor, punif,  min=0, max=1)

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[R-es] DUDA LLENAR MATRIZ CREADA

2015-02-25 Por tema David Contreras
Buena tarde,

Estoy llevando a cabo un trabajo y no encuentro la forma de llenar una
matriz con el p_value y un estadístico calculado.
Un poco mas detallado, tengo muestras aleatorias, calculo por ejemplo la
prueba t, wilcoxon, etc y requiero llevar por una parte los p_value de k
muestras a una matriz creada anteriormente y por otro lado el valor del
estadístico de las mismas k muestras a otra matriz creada anteriormente.
Las k muetras estarían determinadas por un ciclo.

Agradezco me puedan ayudar con el tema que es de mucha urgencia.

Saludos,

David C.

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Re: [R-es] DUDA LLENAR MATRIZ CREADA

2015-02-25 Por tema Javier Marcuzzi
Estimado David Contreras

Mi respuesta es genérica, primero no se si usted se refiere a matriz o un
data.frame, no por confusión pero si por como se trabaja en R (donde
prefiere almacenar los resultados de).

La segunda parte es sobre los resultados que desea almacenar en lo que
usted dice matriz, en forma genérica puede usar $ y el nombre
correspondiente, coloco un pequeño ejemplo según yo pienso que podría serle
útil.

x - c(1,2,3,4,5,6)
y - c(3,4,5,3,2,5)
datos - data.frame(x,y)
modelo -lm(datos)
# para ver que puedo pedir
str(modelo)
# del modelo pido coefficients
modelo$coefficients

El 25 de febrero de 2015, 16:14, David Contreras davidcontrera...@gmail.com
 escribió:

 Buena tarde,

 Estoy llevando a cabo un trabajo y no encuentro la forma de llenar una
 matriz con el p_value y un estadístico calculado.
 Un poco mas detallado, tengo muestras aleatorias, calculo por ejemplo la
 prueba t, wilcoxon, etc y requiero llevar por una parte los p_value de k
 muestras a una matriz creada anteriormente y por otro lado el valor del
 estadístico de las mismas k muestras a otra matriz creada anteriormente.
 Las k muetras estarían determinadas por un ciclo.

 Agradezco me puedan ayudar con el tema que es de mucha urgencia.

 Saludos,

 David C.

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Re: [R-es] DUDA LLENAR MATRIZ CREADA

2015-02-25 Por tema Carlos Ortega
Hola,

A falta de que puedas dar más detalles con un ejemplo con el que podríamos
entender mejor el caso, si te he entendido bien el pseudo-código sería algo
así como esto.

#-
# Entiendo que el ciclo que comentas es con un bucle for.
# Vamos a guardar en cada iteración un p-value y el valor de Wilcoxon-test

matrizConestadisticos - 0
for(i in ...) {

# Guardo la iteración
matrizConestadisticos[ i,1] - i

#... a) aquí estaría tu cálculo del que extraes el p-value que guardamos en
matrizConestadisticos
matrizConestadisticos[ i, 2] - valor.p.value

#... b) aquí estaría tu cálculo del wilcoxon-test... que también
guardamos...
 matrizConestadisticos[ i, 3] - varlos.wilcoxon

} #fin del bucle for
#---

Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es


El 25 de febrero de 2015, 20:14, David Contreras davidcontrera...@gmail.com
 escribió:

 Buena tarde,

 Estoy llevando a cabo un trabajo y no encuentro la forma de llenar una
 matriz con el p_value y un estadístico calculado.
 Un poco mas detallado, tengo muestras aleatorias, calculo por ejemplo la
 prueba t, wilcoxon, etc y requiero llevar por una parte los p_value de k
 muestras a una matriz creada anteriormente y por otro lado el valor del
 estadístico de las mismas k muestras a otra matriz creada anteriormente.
 Las k muetras estarían determinadas por un ciclo.

 Agradezco me puedan ayudar con el tema que es de mucha urgencia.

 Saludos,

 David C.

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Saludos,
Carlos Ortega
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Re: [R-es] DUDA LLENAR MATRIZ CREADA

2015-02-25 Por tema Jorge I Velez
David,

No hay mucho detalle, pero aqui van algunas ideas:

1.  Construye una funcion que tome como argumentos los parametros con
los que generas tus muestras y construye una lista con los resultados.
Cada componente de la lista contendra las *B *muestras sobre las cuales
vas a realizar los analisis.

2.  Utiliza lapply() para tomar cada entrada de la lista creada en 1. y
aplica las pruebas que necesitas.  Esta
funcion debe tomar como argumentos (posiblemente) un data.frame() y
realizar las pruebas.  Por supuesto dentro de esa funcion solo extraerias
los estadisticos de prueba y los valores p asociados a t.test(),
wilcox.test, etc...

3.  Usa do.call(rbind, L) para organizar los resultados.

4.  Usa write.table() para exportarlos.

Espero sea de ayuda.

Saludos,
Jorge.-


2015-02-26 6:14 GMT+11:00 David Contreras davidcontrera...@gmail.com:

 Buena tarde,

 Estoy llevando a cabo un trabajo y no encuentro la forma de llenar una
 matriz con el p_value y un estad�stico calculado.
 Un poco mas detallado, tengo muestras aleatorias, calculo por ejemplo la
 prueba t, wilcoxon, etc y requiero llevar por una parte los p_value de k
 muestras a una matriz creada anteriormente y por otro lado el valor del
 estad�stico de las mismas k muestras a otra matriz creada anteriormente.
 Las k muetras estar�an determinadas por un ciclo.

 Agradezco me puedan ayudar con el tema que es de mucha urgencia.

 Saludos,

 David C.

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