Re: [R-es] simulación1

2021-03-07 Por tema Carlos Ortega
Hola José,
He incluido la línea como ejemplo, con fines didácticos para que veas cómo
se hace. Sin ningún otro objetivo que pudiera estar asociado a tu estudio.

Para añadir una línea/curva o puntos sueltos, tienes primero que conseguir
esos puntos en un data.frame y luego representarles como indico a través de
las funciones "points()", "lines()"...

Gracias,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

El dom, 7 mar 2021 a las 20:54, Jose Betancourt Bethencourt (<
betans...@gmail.com>) escribió:

> El anterior no se veia, esta linea no tiene sentido
>
>
>
>
> El 7/3/21, Carlos Ortega  escribió:
> > Hola,
> >
> > Fíjate que usas "plot()", el sitema gráfico por defecto de "R".
> > Sobre el plot que tienes, puedes usar las funciones "points()", o
> "lines()"
> > para añadir elementos a ese gráfico.
> >
> > En este ejemplo añado una línea horizontal a la altura de y = 100.
> >
> > #--
> > library(EpiModel)
> > # SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
> > param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
> >rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
> >di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
> > init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
> > control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
> > mod2 <- dcm(param, init, control)
> > mod2
> > plot(mod2)
> > *lines( 1:10, rep(100,10))*
> > #-
> >
> > Gracias,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
> >
> > El dom, 7 mar 2021 a las 12:36, Jose Betancourt Bethencourt (<
> > betans...@gmail.com>) escribió:
> >
> >> Estimados
> >> Quisieramos saber como   agregar al modelo que se presenta debajo una
> >> linea  de casos reales a la simulación, la cual ya tiene ya tiene una
> >> linea de susceptibles, una de infecciosos y otra de rcuperados
> >>
> >>
> >> saludos
> >> José
> >>
> >> library(EpiModel)
> >> SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
> >> param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
> >>rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
> >>di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
> >> init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
> >> control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
> >> mod2 <- dcm(param, init, control)
> >> mod2
> >> plot(mod2)
> >>
> >> --
> >> Dr. Jose A. Betancourt Bethencourt
> >> Universidad de Ciencias Medicas Carlos j. Finlay
> >>
> >> ___
> >> R-help-es mailing list
> >> R-help-es@r-project.org
> >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> >>
> >
> >
> > --
> > Saludos,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
> >
>
>
> --
> Dr. Jose A. Betancourt Bethencourt
> Universidad de Ciencias Medicas Carlos j. Finlay
>


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Saludos,
Carlos Ortega
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Re: [R-es] simulación1

2021-03-07 Por tema Jose Betancourt Bethencourt
El anterior no se veia, esta linea no tiene sentido




El 7/3/21, Carlos Ortega  escribió:
> Hola,
>
> Fíjate que usas "plot()", el sitema gráfico por defecto de "R".
> Sobre el plot que tienes, puedes usar las funciones "points()", o "lines()"
> para añadir elementos a ese gráfico.
>
> En este ejemplo añado una línea horizontal a la altura de y = 100.
>
> #--
> library(EpiModel)
> # SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
> param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
>rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
>di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
> init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
> control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
> mod2 <- dcm(param, init, control)
> mod2
> plot(mod2)
> *lines( 1:10, rep(100,10))*
> #-
>
> Gracias,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>
> El dom, 7 mar 2021 a las 12:36, Jose Betancourt Bethencourt (<
> betans...@gmail.com>) escribió:
>
>> Estimados
>> Quisieramos saber como   agregar al modelo que se presenta debajo una
>> linea  de casos reales a la simulación, la cual ya tiene ya tiene una
>> linea de susceptibles, una de infecciosos y otra de rcuperados
>>
>>
>> saludos
>> José
>>
>> library(EpiModel)
>> SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
>> param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
>>rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
>>di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
>> init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
>> control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
>> mod2 <- dcm(param, init, control)
>> mod2
>> plot(mod2)
>>
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Re: [R-es] simulación1

2021-03-07 Por tema Jose Betancourt Bethencourt
Saludos

la linea que genera no tiene sentido para mi, deber ia ser una linea
similar a la linea ascendente de los infectados con crecimiento
exponencial


El 7/3/21, Carlos Ortega  escribió:
> Hola,
>
> Fíjate que usas "plot()", el sitema gráfico por defecto de "R".
> Sobre el plot que tienes, puedes usar las funciones "points()", o "lines()"
> para añadir elementos a ese gráfico.
>
> En este ejemplo añado una línea horizontal a la altura de y = 100.
>
> #--
> library(EpiModel)
> # SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
> param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
>rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
>di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
> init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
> control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
> mod2 <- dcm(param, init, control)
> mod2
> plot(mod2)
> *lines( 1:10, rep(100,10))*
> #-
>
> Gracias,
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> El dom, 7 mar 2021 a las 12:36, Jose Betancourt Bethencourt (<
> betans...@gmail.com>) escribió:
>
>> Estimados
>> Quisieramos saber como   agregar al modelo que se presenta debajo una
>> linea  de casos reales a la simulación, la cual ya tiene ya tiene una
>> linea de susceptibles, una de infecciosos y otra de rcuperados
>>
>>
>> saludos
>> José
>>
>> library(EpiModel)
>> SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
>> param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
>>rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
>>di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
>> init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
>> control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
>> mod2 <- dcm(param, init, control)
>> mod2
>> plot(mod2)
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Re: [R-es] simulación1

2021-03-07 Por tema Carlos Ortega
Hola,

Fíjate que usas "plot()", el sitema gráfico por defecto de "R".
Sobre el plot que tienes, puedes usar las funciones "points()", o "lines()"
para añadir elementos a ese gráfico.

En este ejemplo añado una línea horizontal a la altura de y = 100.

#--
library(EpiModel)
# SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
   rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
   di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
mod2 <- dcm(param, init, control)
mod2
plot(mod2)
*lines( 1:10, rep(100,10))*
#-

Gracias,
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> Estimados
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> linea  de casos reales a la simulación, la cual ya tiene ya tiene una
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>
>
> saludos
> José
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> param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
>rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
>di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
> init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
> control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
> mod2 <- dcm(param, init, control)
> mod2
> plot(mod2)
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Estimados
Quisieramos saber como   agregar al modelo que se presenta debajo una
linea  de casos reales a la simulación, la cual ya tiene ya tiene una
linea de susceptibles, una de infecciosos y otra de rcuperados


saludos
José

library(EpiModel)
SIR Model with Vital Dynamics (One-Group)
param <- param.dcm(inf.prob = 0.2, act.rate = 10,
   rec.rate = 1/3, a.rate = 1/90, ds.rate = 1/100,
   di.rate = 1/35, dr.rate = 1/100)
init <- init.dcm(s.num = 500, i.num = 1, r.num = 0)
control <- control.dcm(type = "SIR", nsteps = 15)
mod2 <- dcm(param, init, control)
mod2
plot(mod2)

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