Re: [R-es] Leer archivos con read.csv

2017-07-14 Por tema eric

  
  
Hola Wilmer, diariamente tengo que hacer lo que indicas, y lo mas
  simple que he encontrado es:
filenames <- list.files(path ="/tu/path/", pattern="*.csv")
i <- 1
  for (i in 1:length(filenames)) 
  {
      tmp <- fread(filenames[i], header=FALSE) 

}

Asi se pueden leer selectivamente los archivos .csv del
  directorio que indicas en /tu/path/, aunque hayan otros tipos de
  archivos dentro.
fread() lee bastante mas rapido que otras opciones como
  read.csv(), es bastante inteligente para seleccionar el tipo de
  dato correcto en cada columna y el archivo resultante es
  directamente del tipo data.table.
Espero que te ayude,
Saludos, Eric.




On 07/13/2017 01:00 PM, WILMER
  CONTRERAS SEPULVEDA wrote:


  Buen día para todos.

Tengo un pequeño problema en el quisiera que me colaboraran.

Estos días estoy trabajando en la lectura de una gran cantidad de archivos
de extención .csv, se trata de una lista de documentos de 11 estaciones
meteorologicas. Cada estación esta clasificada por meses y cada mes por
dias, asi que tengo un archivo cada día. Por ejemplo tengo un archivo .csv
para el día uno del mes de enero, otro archivo para el día dos del mes de
enero, otro para el día tres del mes de enero y así sucesivamente hasta
completar todos los meses.

Mi problema es, que hay algunos archivos faltantes. Me refiero a que por
ejemplo el día 5 del mes de febrero hace falta.

Al tratar de leer los archivos FALTANTES con read.csv() me arroja el
siguiente error:

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "rt") :
  cannot open file 'C:/R/Zonas rurales/Corponor/2017/7. PUNTO DE
CONTROL/Febrero/27-02-2017.csv': No such file or directory

Lo que es logico, debido a que no estan.

Sin embargo al arrojarme este error se rompe el ciclo for y no me permite
continuar trabajando.

Mi pregunta es:

*¿Existe alguna forma de indicarle al comando read.csv() que evite los
archivos faltantes? *

Muchas Gracias de antemano.

*Wilmer Contreras Sepulveda.*

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Forest Engineer
Master in Environmental and Natural Resource Economics
Ph.D. student in Sciences of Natural Resources at La Frontera University
Member in AguaDeTemu2030, citizen movement for Temuco with green city standards for living

Nota: Las tildes se han omitido para asegurar compatibilidad con algunos lectores de correo.

  


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Re: [R-es] Leer archivos con read.csv

2017-07-14 Por tema Freddy Omar López Quintero
> La idea de Javier Nieto me parece buena, try cath es muy útil, a esto le
> sumaría print, como para ver en pantalla el nombre del archivo y un Si o
> No, mientras se cargan los datos, aunque esto es solo gusto personal.
>

​De eso se trata ¿no?: que la persona que consulta obtenga una o varias
respuestas con posibles soluciones para que pueda experimentar con ellas y
adecuarlas a su situación.​


Saludos.

-- 
«Pídeles sus títulos a los que te persiguen, pregúntales
cuándo nacieron, diles que te demuestren su existencia.»

Rafael Cadenas

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Re: [R-es] Leer archivos con read.csv

2017-07-13 Por tema Javier Marcuzzi
Estimado Freddy Omar López Quintero

La idea de Javier Nieto me parece buena, try cath es muy útil, a esto le 
sumaría print, como para ver en pantalla el nombre del archivo y un Si o No, 
mientras se cargan los datos, aunque esto es solo gusto personal.

Javier Rubén Marcuzzi

De: Freddy Omar López Quintero
Enviado: jueves, 13 de julio de 2017 15:47
Para: Javier Nieto
CC: r-help-es@r-project.org
Asunto: Re: [R-es] Leer archivos con read.csv

Hola.

Una manera puede ser tomar una lista de todos los archivos de un directorio
y trabajar con ellos, puesto que ciertamente existen. ¿Cómo? Supongamos que
tienes una carpeta llena de archivos csv. Entonces, puedes guardar el
nombre de tus archivos en un objeto con

lista_archivos<-dir()
>

y esto te dará todos los csv de esa carpeta (si tienes otros archivos
también estarán allí, pero insistamos por ahora en suponer que son solo
csvs...).

Luego puedes hacer algo como

read.csv(lista_archivos[s])
>

dentro del bucle que ya estabas utilizando, para s entre 1 y el tamaño de
lista_archivos.

Finalmente, si en tu carpeta no hay solo csvs sino otros archivos, puedes
usar alguna variante de

grepl('.csv', lista_archivos[s])
>

para quedarte solo con aquellos archivos que cumplan con ser csv, por
ejemplo. Esto ya depende mucho de la entropía que haya en tus carpetas jeje.

Ojala sirva.

¡Salud!

2017-07-13 13:18 GMT-04:00 Javier Nieto <mac_j...@hotmail.com>:

> Hola, no he visto tu código pero puedes utilizar la función try.
>
>
> Saludos
>
> 
> De: R-help-es <r-help-es-boun...@r-project.org> en nombre de WILMER
> CONTRERAS SEPULVEDA <wilme...@ufps.edu.co>
> Enviado: jueves, 13 de julio de 2017 12:00:59 p. m.
> Para: r-help-es@r-project.org
> Asunto: [R-es] Leer archivos con read.csv
>
> Buen día para todos.
>
> Tengo un pequeño problema en el quisiera que me colaboraran.
>
> Estos días estoy trabajando en la lectura de una gran cantidad de archivos
> de extención .csv, se trata de una lista de documentos de 11 estaciones
> meteorologicas. Cada estación esta clasificada por meses y cada mes por
> dias, asi que tengo un archivo cada día. Por ejemplo tengo un archivo .csv
> para el día uno del mes de enero, otro archivo para el día dos del mes de
> enero, otro para el día tres del mes de enero y así sucesivamente hasta
> completar todos los meses.
>
> Mi problema es, que hay algunos archivos faltantes. Me refiero a que por
> ejemplo el día 5 del mes de febrero hace falta.
>
> Al tratar de leer los archivos FALTANTES con read.csv() me arroja el
> siguiente error:
>
> Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
> In addition: Warning message:
> In file(file, "rt") :
>   cannot open file 'C:/R/Zonas rurales/Corponor/2017/7. PUNTO DE
> CONTROL/Febrero/27-02-2017.csv': No such file or directory
>
> Lo que es logico, debido a que no estan.
>
> Sin embargo al arrojarme este error se rompe el ciclo for y no me permite
> continuar trabajando.
>
> Mi pregunta es:
>
> *¿Existe alguna forma de indicarle al comando read.csv() que evite los
> archivos faltantes? *
>
> Muchas Gracias de antemano.
>
> *Wilmer Contreras Sepulveda.*
>
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Re: [R-es] Leer archivos con read.csv

2017-07-13 Por tema Freddy Omar López Quintero
Hola.

Una manera puede ser tomar una lista de todos los archivos de un directorio
y trabajar con ellos, puesto que ciertamente existen. ¿Cómo? Supongamos que
tienes una carpeta llena de archivos csv. Entonces, puedes guardar el
nombre de tus archivos en un objeto con

lista_archivos<-dir()
>

y esto te dará todos los csv de esa carpeta (si tienes otros archivos
también estarán allí, pero insistamos por ahora en suponer que son solo
csvs...).

Luego puedes hacer algo como

read.csv(lista_archivos[s])
>

dentro del bucle que ya estabas utilizando, para s entre 1 y el tamaño de
lista_archivos.

Finalmente, si en tu carpeta no hay solo csvs sino otros archivos, puedes
usar alguna variante de

grepl('.csv', lista_archivos[s])
>

para quedarte solo con aquellos archivos que cumplan con ser csv, por
ejemplo. Esto ya depende mucho de la entropía que haya en tus carpetas jeje.

Ojala sirva.

¡Salud!

2017-07-13 13:18 GMT-04:00 Javier Nieto :

> Hola, no he visto tu código pero puedes utilizar la función try.
>
>
> Saludos
>
> 
> De: R-help-es  en nombre de WILMER
> CONTRERAS SEPULVEDA 
> Enviado: jueves, 13 de julio de 2017 12:00:59 p. m.
> Para: r-help-es@r-project.org
> Asunto: [R-es] Leer archivos con read.csv
>
> Buen día para todos.
>
> Tengo un pequeño problema en el quisiera que me colaboraran.
>
> Estos días estoy trabajando en la lectura de una gran cantidad de archivos
> de extención .csv, se trata de una lista de documentos de 11 estaciones
> meteorologicas. Cada estación esta clasificada por meses y cada mes por
> dias, asi que tengo un archivo cada día. Por ejemplo tengo un archivo .csv
> para el día uno del mes de enero, otro archivo para el día dos del mes de
> enero, otro para el día tres del mes de enero y así sucesivamente hasta
> completar todos los meses.
>
> Mi problema es, que hay algunos archivos faltantes. Me refiero a que por
> ejemplo el día 5 del mes de febrero hace falta.
>
> Al tratar de leer los archivos FALTANTES con read.csv() me arroja el
> siguiente error:
>
> Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
> In addition: Warning message:
> In file(file, "rt") :
>   cannot open file 'C:/R/Zonas rurales/Corponor/2017/7. PUNTO DE
> CONTROL/Febrero/27-02-2017.csv': No such file or directory
>
> Lo que es logico, debido a que no estan.
>
> Sin embargo al arrojarme este error se rompe el ciclo for y no me permite
> continuar trabajando.
>
> Mi pregunta es:
>
> *¿Existe alguna forma de indicarle al comando read.csv() que evite los
> archivos faltantes? *
>
> Muchas Gracias de antemano.
>
> *Wilmer Contreras Sepulveda.*
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