Чем смотреть файлы DICOM под Debian
Доброго всем вечера, Столкнулся для себя с нестандартной проблемой - надо посмотреть файлы DICOM. Дали CD-диск с файлами AUTORUN.INF CDVIEWER.EXE CDVIEWER.JAR DICOMDIR в корне, дирами A и вложенной в нее дирой B в которой находятся собственно DICOM-файлы. Это все дело прислали мне эл. почтой. $ file AUTORUN.INF AUTORUN.INF: Microsoft Windows Autorun file. $ file CDVIEWER.EXE CDVIEWER.EXE: PE32 executable for MS Windows (GUI) Intel 80386 32-bit $ file DICOMDIR DICOMDIR: DICOM medical imaging data file A00 A00: DICOM medical imaging data Нашел в дистре сквизи такие пакеты: ~$ aptitude search dicom i dicom3tools - DICOM medical image files manipulation and i dicomnifti - конвертирует файлы DICOM в формат NIfTI i dicomscope - The OFFIS DICOM Viewer i python-dicom- DICOM medical file reading and writing Установил их. Пытаюсь открыть файлы в dicomscope - ничего не открывает, пишет - Load Failed. Не совсем правда понимаю, что грузить, пытался грузить и сами dicom-файлы, и файл DICOMDIR - без толку. В Process Log в окошке дикомдира никакого лога при этом не вижу. Пытаюсь исполнить strace dicomscope, лается на то, что: open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli/tls/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli/tls/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli/tls/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli/tls, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../lib/amd64/jli, {st_mode=S_IFDIR|0755, st_size=4096, ...}) = 0 open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli/tls/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli/tls/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli/tls/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli/tls, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/../jre/lib/amd64/jli, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server/tls/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server/tls/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server/tls/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server/tls, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/server, {st_mode=S_IFDIR|0755, st_size=4096, ...}) = 0 open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/tls/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/tls/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/tls/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/tls, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/x86_64/libz.so.1, O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory) stat(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/x86_64, 0x7fff6f258be0) = -1 ENOENT (No such file or directory) open(/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/lib/amd64/libz.so.1,
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian
,-[Ivan Zavarzin, 6 March 2013 18:01]: Доброго всем вечера, Столкнулся для себя с нестандартной проблемой - надо посмотреть файлы DICOM. Дали CD-диск с файлами AUTORUN.INF CDVIEWER.EXE CDVIEWER.JAR DICOMDIR в корне, дирами A и вложенной в нее дирой B в которой находятся собственно DICOM-файлы. Это все дело прислали мне эл. почтой. $ file AUTORUN.INF AUTORUN.INF: Microsoft Windows Autorun file. При употреблении указанной опции -s ругается, что не может открыть файл -s, воспринимая ее не как опцию, а как файл (в man нет вообще опций никаких). Что за NIfTI format и как его читать, если в него конвертнуть, я честно не совсем понимаю. Пытался wine'ом открыть CDVIEWER.EXE - ругается, что нужна java 1.5 или выше, видимо пойду в виртмашину открывать в винде, хотя эта идея мне особо не нравиться... а что написано в autorun.inf ? -=-=-=- man java: java(1) Name java - the Java application launcher SYNOPSIS java [ options ] class [ argument ... ] java [ options ] -jar file.jar [ argument ... ] -=-=-=- попробуйте заюзать java -jar CDVIEWER.JAR -- __ mpd status: [stopped] ** * jabber: devil_ins...@jabber.ru * * Registered linux user #450844* ** -- To UNSUBSCRIBE, email to debian-russian-requ...@lists.debian.org with a subject of unsubscribe. Trouble? Contact listmas...@lists.debian.org Archive: http://lists.debian.org/kh7tum$t39$1...@ger.gmane.org
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian
-=Devil_InSide=-: ,-[Ivan Zavarzin, 6 March 2013 18:01]: Доброго всем вечера, Столкнулся для себя с нестандартной проблемой - надо посмотреть файлы DICOM. Дали CD-диск с файлами AUTORUN.INF CDVIEWER.EXE CDVIEWER.JAR DICOMDIR в корне, дирами A и вложенной в нее дирой B в которой находятся собственно DICOM-файлы. Это все дело прислали мне эл. почтой. $ file AUTORUN.INF AUTORUN.INF: Microsoft Windows Autorun file. При употреблении указанной опции -s ругается, что не может открыть файл -s, воспринимая ее не как опцию, а как файл (в man нет вообще опций никаких). Что за NIfTI format и как его читать, если в него конвертнуть, я честно не совсем понимаю. Пытался wine'ом открыть CDVIEWER.EXE - ругается, что нужна java 1.5 или выше, видимо пойду в виртмашину открывать в винде, хотя эта идея мне особо не нравиться... а что написано в autorun.inf ? [autorun] OPEN=CDViewer.exe -=-=-=- man java: java(1) Name java - the Java application launcher SYNOPSIS java [ options ] class [ argument ... ] java [ options ] -jar file.jar [ argument ... ] -=-=-=- попробуйте заюзать java -jar CDVIEWER.JAR $ java -jar CDVIEWER.JAR com.ge.med.cse.apps.cdviewer.RedirectedStream Started redirecting the error stream Mount = /home/ivan/документы_от_врача DICOM Dir = null Session File = /home/ivan/документы_от_врача/DICOMDIR На этом заканчивается с кодом окончания 1 (кажет echo $?) P.S. Под виндой с какой-то виндовой прогой (http://www.radiantviewer.com/ru/) запустил, но работать через виртмашину не особо удобно. -- To UNSUBSCRIBE, email to debian-russian-requ...@lists.debian.org with a subject of unsubscribe. Trouble? Contact listmas...@lists.debian.org Archive: http://lists.debian.org/513787ea.2090...@lavabit.com
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian (resolved)
-=Devil_InSide=-: ,-[Ivan Zavarzin, 6 March 2013 18:01]: Доброго всем вечера, Столкнулся для себя с нестандартной проблемой - надо посмотреть файлы DICOM. Дали CD-диск с файлами AUTORUN.INF CDVIEWER.EXE CDVIEWER.JAR DICOMDIR в корне, дирами A и вложенной в нее дирой B в которой находятся собственно DICOM-файлы. Это все дело прислали мне эл. почтой. $ file AUTORUN.INF AUTORUN.INF: Microsoft Windows Autorun file. При употреблении указанной опции -s ругается, что не может открыть файл -s, воспринимая ее не как опцию, а как файл (в man нет вообще опций никаких). Что за NIfTI format и как его читать, если в него конвертнуть, я честно не совсем понимаю. Пытался wine'ом открыть CDVIEWER.EXE - ругается, что нужна java 1.5 или выше, видимо пойду в виртмашину открывать в винде, хотя эта идея мне особо не нравиться... а что написано в autorun.inf ? -=-=-=- man java: java(1) Name java - the Java application launcher SYNOPSIS java [ options ] class [ argument ... ] java [ options ] -jar file.jar [ argument ... ] -=-=-=- попробуйте заюзать java -jar CDVIEWER.JAR dicomscope из wheezy открывает. -- To UNSUBSCRIBE, email to debian-russian-requ...@lists.debian.org with a subject of unsubscribe. Trouble? Contact listmas...@lists.debian.org Archive: http://lists.debian.org/51378c39.2010...@lavabit.com
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian
6 марта 2013 г., 22:16 пользователь Ivan Zavarzin ivan_zavar...@lavabit.com написал: http://www.radiantviewer.com/ru/ Нашлось такое: https://code.google.com/p/dicompyler/ http://www.dcm4che.org/ Надеюсь поможет
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian
06.03.13, Ivan Zavarzinivan_zavar...@lavabit.com написал(а): -=Devil_InSide=-: ,-[Ivan Zavarzin, 6 March 2013 18:01]: Доброго всем вечера, Столкнулся для себя с нестандартной проблемой - надо посмотреть файлы DICOM. Дали CD-диск с файлами AUTORUN.INF CDVIEWER.EXE CDVIEWER.JAR DICOMDIR в корне, дирами A и вложенной в нее дирой B в которой находятся собственно DICOM-файлы. Это все дело прислали мне эл. почтой. $ file AUTORUN.INF AUTORUN.INF: Microsoft Windows Autorun file. При употреблении указанной опции -s ругается, что не может открыть файл -s, воспринимая ее не как опцию, а как файл (в man нет вообще опций никаких). Что за NIfTI format и как его читать, если в него конвертнуть, я честно не совсем понимаю. Пытался wine'ом открыть CDVIEWER.EXE - ругается, что нужна java 1.5 или выше, видимо пойду в виртмашину открывать в винде, хотя эта идея мне особо не нравиться... а что написано в autorun.inf ? [autorun] OPEN=CDViewer.exe -=-=-=- man java: java(1) Name java - the Java application launcher SYNOPSIS java [ options ] class [ argument ... ] java [ options ] -jar file.jar [ argument ... ] -=-=-=- попробуйте заюзать java -jar CDVIEWER.JAR $ java -jar CDVIEWER.JAR com.ge.med.cse.apps.cdviewer.RedirectedStream Started redirecting the error stream Mount = /home/ivan/документы_от_врача DICOM Dir = null Session File = /home/ivan/документы_от_врача/DICOMDIR На этом заканчивается с кодом окончания 1 (кажет echo $?) P.S. Под виндой с какой-то виндовой прогой (http://www.radiantviewer.com/ru/) запустил, но работать через виртмашину не особо удобно. -- To UNSUBSCRIBE, email to debian-russian-requ...@lists.debian.org with a subject of unsubscribe. Trouble? Contact listmas...@lists.debian.org Archive: http://lists.debian.org/513787ea.2090...@lavabit.com aeskulap, dicomscope, ginkgocadx Или что нибудь ещё, найденное по запросу apt-cache search dicom
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian
Добавлю: сам когда-то смотрел через aeskulap 06.03.13, Руслан Зиганшинziganshinrus...@gmail.com написал(а): 06.03.13, Ivan Zavarzinivan_zavar...@lavabit.com написал(а): -=Devil_InSide=-: ,-[Ivan Zavarzin, 6 March 2013 18:01]: Доброго всем вечера, Столкнулся для себя с нестандартной проблемой - надо посмотреть файлы DICOM. Дали CD-диск с файлами AUTORUN.INF CDVIEWER.EXE CDVIEWER.JAR DICOMDIR в корне, дирами A и вложенной в нее дирой B в которой находятся собственно DICOM-файлы. Это все дело прислали мне эл. почтой. $ file AUTORUN.INF AUTORUN.INF: Microsoft Windows Autorun file. При употреблении указанной опции -s ругается, что не может открыть файл -s, воспринимая ее не как опцию, а как файл (в man нет вообще опций никаких). Что за NIfTI format и как его читать, если в него конвертнуть, я честно не совсем понимаю. Пытался wine'ом открыть CDVIEWER.EXE - ругается, что нужна java 1.5 или выше, видимо пойду в виртмашину открывать в винде, хотя эта идея мне особо не нравиться... а что написано в autorun.inf ? [autorun] OPEN=CDViewer.exe -=-=-=- man java: java(1) Name java - the Java application launcher SYNOPSIS java [ options ] class [ argument ... ] java [ options ] -jar file.jar [ argument ... ] -=-=-=- попробуйте заюзать java -jar CDVIEWER.JAR $ java -jar CDVIEWER.JAR com.ge.med.cse.apps.cdviewer.RedirectedStream Started redirecting the error stream Mount = /home/ivan/документы_от_врача DICOM Dir = null Session File = /home/ivan/документы_от_врача/DICOMDIR На этом заканчивается с кодом окончания 1 (кажет echo $?) P.S. Под виндой с какой-то виндовой прогой (http://www.radiantviewer.com/ru/) запустил, но работать через виртмашину не особо удобно. -- To UNSUBSCRIBE, email to debian-russian-requ...@lists.debian.org with a subject of unsubscribe. Trouble? Contact listmas...@lists.debian.org Archive: http://lists.debian.org/513787ea.2090...@lavabit.com aeskulap, dicomscope, ginkgocadx Или что нибудь ещё, найденное по запросу apt-cache search dicom
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian (resolved)
Ivan Zavarzin: dicomscope из wheezy открывает. Голова кругом идет (от того, что приходится смотреть), но такое ощущение, что в сквизе проблема не с версией dicomscope, а с его зависимостями. По крайней мере, версия практически та же - в сквизе 3.6.0-2, в визи 3.6.0-10, т.е. как я понимаю это одна версия апстрима, в разных допилах Debian Team? Зависимости в визи установились немного другие. P.S. Все равно виндовая прога лучше изображение выдает, и управляется лучше. Видимо, не допилили dicomscope таки. -- To UNSUBSCRIBE, email to debian-russian-requ...@lists.debian.org with a subject of unsubscribe. Trouble? Contact listmas...@lists.debian.org Archive: http://lists.debian.org/5137918b.9020...@lavabit.com
Re: Чем смотреть файлы DICOM под Debian
Руслан Зиганшин: Добавлю: сам когда-то смотрел через aeskulap Премного благодарен. Самое оно! Лучше чем под dicomscope (который на нетубке под визи у меня заработал, но как-то странно - пляшет картинка, самопроизвольно уменьшается изображение, и хуже картинка, чем под аэскулапом). Единстенный минус - в отличие от виндовой программы, надо каждый файл руками открывать (когда я DICOMDIR файл открываю, вижу только заголовки), листать изображения из одной диком-диры не получается. Или я что-то не так делаю? -- To UNSUBSCRIBE, email to debian-russian-requ...@lists.debian.org with a subject of unsubscribe. Trouble? Contact listmas...@lists.debian.org Archive: http://lists.debian.org/5137a364.4020...@lavabit.com