岸田と申します。

> 現在は一旦ローカルでtar ファイルを作成して scp でリモートUSBハード
> ディスクにコピーし、コピー後、ローカルの tar ファイルを rm していま
> す。

一時ファイルを作るを避けたいのでしたら、
リモート側で以下のようにしてみてはどうでしょうか?
ssh LOCAL 'tar zcfp - LOCAL_DIR' > LOCAL_backup.tar.gz

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