Dear all, I hope this can be of use to somebody...
We were having problems with the Summary Statistics Tools /galaxy/tools/stats/gsummary.py As indicated there is a dependency on rpy2 (Version 2.7.8), which requires python 3.5 and comes into conflict with the qsummary.py which uses 2.* Change Line 63: tmp_file = tempfile.NamedTemporaryFile( 'w+b' ) to tmp_file = tempfile.NamedTemporaryFile( 'w+' ) Then it'll work. Cheers, Christopher -- *Dr. Christopher Previti* Genomics and Proteomics Core Facility High Throughput Sequencing (W190) Bioinformatician German Cancer Research Center (DKFZ) Foundation under Public Law Im Neuenheimer Feld 580 69120 Heidelberg Germany Room: B2.102 (INF580/TP3) Phone: +49 6221 42-4434 christopher.prev...@dkfz.de <http://www.dkfz.de/> www.dkfz.de <http://www.dkfz.de/> Management Board: Prof. Dr. Michael Baumann, Prof. Dr. Josef Puchta VAT-ID No.: DE143293537 Vertraulichkeitshinweis: Diese Nachricht ist ausschließlich für die Personen bestimmt, an die sie adressiert ist. Sie kann vertrauliche und/oder nur für den/die Empfänger bestimmte Informationen enthalten. Sollten Sie nicht der bestimmungsgemäße Empfänger sein, kontaktieren Sie bitte den Absender und löschen Sie die Mitteilung. Jegliche unbefugte Verwendung der Informationen in dieser Nachricht ist untersagt.
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