Olha só, se entendi direito o que quer é persistir objetos seus.
Continue vendo da mesma forma que está.
O Zope (ZMI) traz uma visão do ZODB que ele trabalha. Assim na verdade os objetos que vê na ZMI, estão no ZODB de nome Data.fs que está no var da sua instancia.
Se desejar trabalhar com esse ZODB basta acessá-lo via Python colocando os seus objetos onde quiser no seu ZODB que ele refletirá a estrutura que você na ZMI.
Terá que controlar o acesso, pois e o zope estiver rodando ele tranca o acesso ao arquivo Data.fs(se não me engano).
Claro que recomendo o uso das api do ZOPE para persistência de objetos que ele já implementou, mas suas classes também podem ser construídas para usarem o mecanismo do Zope.
Espero ter ajudado.
Abraços
TOM



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Att,
Wilton Souza Alencar
www.tom.pro.br


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