in the name of god hi i am new user When Siesta calculates the DM, in the output file the following warnings appears :
siesta: WARNING: Atoms 1 431 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 4 432 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 5 433 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 6 135 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 9 136 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 10 137 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 11 141 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 12 144 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 13 145 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 14 444 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 17 445 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 18 446 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 19 23 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 24 154 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 25 157 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 26 158 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 27 36 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 28 39 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 29 40 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 30 41 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 31 44 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 32 45 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 33 46 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 34 47 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 35 48 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 36 466 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 39 467 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 40 468 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 41 45 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 46 176 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 47 179 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 48 180 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 49 479 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 52 480 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 53 481 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 54 58 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 59 189 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 60 192 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 61 193 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 62 71 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 63 74 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 64 75 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 65 76 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 66 79 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 67 80 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 68 81 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 69 82 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 70 83 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 71 501 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 74 502 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 75 503 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 76 80 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 81 202 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 82 203 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 83 204 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 84 514 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 87 515 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 88 516 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 89 93 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 94 224 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 95 227 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 96 228 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 97 106 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 98 109 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 99 110 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 100 111 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 101 114 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 102 115 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 103 116 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 104 117 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 105 118 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 106 536 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 109 537 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 110 538 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 111 115 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 116 246 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 117 249 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 118 250 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 119 549 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 122 550 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 123 551 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 124 128 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 129 259 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 130 262 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 131 263 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 132 558 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 133 559 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 134 560 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 135 137 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 138 272 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 139 273 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 140 274 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 141 272 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 144 273 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 145 274 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 146 275 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 149 276 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 150 277 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 151 281 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 152 284 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 153 285 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 154 158 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 159 163 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 164 294 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 165 297 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 166 298 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 167 176 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 168 179 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 169 180 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 170 181 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 171 184 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 172 185 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 173 186 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 174 187 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 175 188 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 176 180 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 181 185 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 186 307 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 187 308 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 188 309 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 189 193 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 194 198 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 199 329 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 200 332 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 201 333 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 202 211 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 203 214 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 204 215 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 205 216 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 206 219 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 207 220 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 208 221 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 209 222 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 210 223 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 211 215 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 216 220 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 221 351 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 222 354 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 223 355 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 224 228 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 229 233 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 234 364 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 235 367 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 236 368 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 237 246 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 238 249 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 239 250 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 240 251 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 241 254 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 242 255 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 243 256 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 244 257 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 245 258 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 246 250 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 251 255 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 256 386 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 257 389 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 258 390 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 259 263 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 264 268 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 269 399 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 270 402 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 271 403 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 272 274 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 275 277 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 278 412 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 279 413 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 280 414 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 281 412 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 284 413 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 285 414 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 286 415 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 289 416 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 290 417 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 291 421 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 292 424 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 293 425 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 294 298 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 299 303 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 304 434 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 305 437 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 306 438 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 307 316 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 308 319 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 309 320 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 310 321 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 311 324 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 312 325 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 313 447 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 314 448 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 315 449 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 316 320 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 321 325 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 326 447 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 327 448 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 328 449 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 329 333 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 334 338 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 339 469 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 340 472 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 341 473 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 342 351 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 343 354 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 344 355 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 345 356 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 346 359 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 347 360 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 348 491 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 349 494 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 350 495 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 351 355 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 356 360 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 361 491 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 362 494 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 363 495 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 364 368 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 369 373 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 374 504 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 375 507 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 376 508 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 377 386 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 378 389 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 379 390 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 380 391 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 381 394 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 382 395 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 383 517 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 384 518 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 385 519 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 386 390 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 391 395 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 396 526 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 397 529 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 398 530 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 399 403 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 404 408 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 409 539 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 410 542 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 411 543 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 412 414 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 415 417 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 418 552 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 419 553 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 420 554 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 421 552 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 424 553 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 425 554 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 426 555 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 429 556 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 430 557 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 431 558 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 432 559 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 433 560 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 434 438 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 439 443 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 444 446 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 447 456 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 448 459 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 449 460 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 450 461 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 451 464 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 452 465 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 453 466 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 454 467 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 455 468 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 456 460 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 461 465 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 466 468 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 469 473 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 474 478 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 479 481 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 482 491 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 483 494 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 484 495 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 485 496 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 486 499 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 487 500 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 488 501 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 489 502 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 490 503 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 491 495 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 496 500 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 501 503 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 504 508 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 509 513 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 514 516 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 517 526 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 518 529 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 519 530 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 520 531 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 521 534 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 522 535 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 523 536 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 524 537 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 525 538 too close: rij = 0.000000 Ang siesta: WARNING: Atoms 526 530 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 531 535 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 536 538 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 539 543 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 544 548 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 549 551 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 552 554 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 555 557 too close: rij = 0.000001 Ang siesta: WARNING: Atoms 558 560 too close: rij = 0.000001 Ang
surface15.fdf
Description: Binary data
