Te recomiendo Quantum GIS y el plugin para mapserver ,armas tu mapa con el origen que quieras(un shape,una tabla postgis, o en mysql) y este te genera el .map con todo los colores y extends , pero siempre hay que hacerle unos arreglos, es decir, las proyecciones y demas, yo aprendi mucho mas rapido a configurar los mapfiles a partir de estos archivos generados con qgis, tambien quantum gis tiene su mapserver para qgis, donde creas un mapa con qgis y guardas el proyecto en un direcorio especifico y este mapserver lee el proyecto de qgis, nunca los probe, esta en los repositorio de Fedora si queres probar.
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