Invoke ffmpeg. Or avconv, whatever Trisquel has.
ffmpeg -i /path/to/input/file -c:v copy -c:a copy -c:s copy -map_metadata:g -1:g -map_metadata:s:v -1:g -map_metadata:s:a -1:g -map_metadata:s:s -1:g /path/to/output/file
Invoke ffmpeg. Or avconv, whatever Trisquel has.
ffmpeg -i /path/to/input/file -c:v copy -c:a copy -c:s copy -map_metadata:g -1:g -map_metadata:s:v -1:g -map_metadata:s:a -1:g -map_metadata:s:s -1:g /path/to/output/file