Olá Humberto e André, muito obrigado pelas respostas.

Eu realmente havia instalado para compatibilidade com Windows, mas já não
tenho mais partições NTFS, e pra falar a verdade nem lembrava que tinha 
feito essa mudança por causa disso. 

Então a pergunta agora é, como faço para reverter para UTF-8 - é preciso 
mudar todo o sistema de arquivos (ext3) ou apenas os locales?

Abraços, 
Rafael

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