Bom dia, sou novo na lista e não tenho muita experiencia mas o erro não pode 
estar ocorrendo por algum problema de permissão, tente agendar no cron da 
seguinte forma para testar:
*/5 * * * * root php /usr/local/apache/htdocs/system/pipe/pop.php               
                          
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Você sabia que seu navegador te ajuda a ficar longe de vírus? Leia mais sobre 
isso.
http://www.microsoft.com/brasil/windows/internet-explorer/?WT.mc_id=1500
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