Voce já tentou usar a ferramenta fsck usando um live cd ??
Caso não tenha tenta o seguinte, da o boot com um cd live do ubuntu, abra um
terminal e execute
sudo fdisk -l
veja se ele consegue achar o hd, no seu caso o sda, que é onde o boot esta,
se ele conseguir tente usar o fsck com os seguintes parametros caso o sistema
de arquivos seja ext3
sudo fsck.ext3 -fpv /dev/sda2 (que é a sua partição de boot), ve se ele
encontra algum erro e corrige
apos isso reinicie o servidor e poste o resultado.
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