Dear Junjun and Arek,
In my opinion the problem is similar to "connection timeout" or to too many
connection (problem with too many users who are sending request in same time).
This is a code from my Java application:
private static String requestREST(String query){
Client rc = new Client();
rc.setConnectTimeout(0);
WebResource r =
rc.resource("http://www.biomart.org/biomart/martservice/results";).queryParam("query",
query);
return r.get(String.class);
}
where rc is jersey.api.client.Client
Is it ok?
Last week everything was fine. Results I received immediately for each request.
This week I wait 2-5 minutes to answer or did not get an answer. This is my IP:
77.255.186.15 (but at home I have dynamic IP so it can be hard to check...).
Right now (20 minutes ago) I have results after 8-10 minutes.
Really I don't know what's going on.
Arek: I noticed that you are from Poland so the first mail I sent in Polish. Of
course we can write in English. It will be easier to everyone :)
Best regards,
Adam Skowron
Wiadomość napisana przez Arek Kasprzyk w dniu 21 wrz 2011, o godz. 17:17:
> Junjun:
> Adam is having problems with this seemingly simple query since the beginning
> of the week. It all worked fine before. Can you investigate and restore the
> service to its former glory asap please? :)
>
> cheers,
> a
>
> Adam:
> Jak sie masz?
>
> Ja przekazalem twoja email do users mailing list. Powiedzialem to do faceta
> ktory prowadzi ten service dla mnie. Powinni to zreperowac szybko.
>
> Pozdrowienia,
> a
>
>
>
>
>
> 2011/9/21 Adam Skowron <[email protected]>
> Dzień dobry,
>
> Używam BioMarta do wyciągania miejsc występowania SNPów na konkretnym
> chromosomie w określonych pozycjach. Wysyłam następujące zapytanie z
> wykorzystaniem protokołu REST:
>
> http://www.biomart.org/biomart/martservice/results?query=<Query
> virtualSchemaName = "default" formatter = "CSV" header = "0" uniqueRows = "0"
> count = "" datasetConfigVersion = "0.6" ><Dataset name = "hsapiens_snp"
> interface = "default" ><Filter name = "chrom_start" value =
> "117120016"/><Filter name = "chrom_end" value = "117308718" /><Filter name =
> "chr_name" value = "7"/><Attribute name = "chrom_start" /></Dataset></Query>
>
> Ostatnimi czasy wszystko świetnie chodziło i odpowiedź (wyłącznie pozycje)
> dostawałem praktycznie od razu.
> Teraz jednak (od początku tygodnia) na odpowiedź albo czekam bardzo długo..
> albo nie dostaję jej wcale (coś się zacina?).
>
> Czy mógłbym prosić o sprawdzenie tego?
> Czy trwają może jakieś prace modernizacyjne?
>
> Z góry dziękuję za odpowiedź.
>
> Pozdrawiam,
> Adam Skowron
>
_______________________________________________
Users mailing list
[email protected]
https://lists.biomart.org/mailman/listinfo/users
