Yth. Peserta ZOA-BIOTEK,

Kami sampaikan komentar Dr. Zeily Nurachman tentang Kristalisasi 
Protein, menanggapi pertanyaan Dr. Jaka Widada dan tanggapan Dr. 
Arief Witarto.

Moderator Pembantu

Dedy H.B. Wicaksono


At Monday, 12 February 2001, "Zeily Nurachman" <[EMAIL PROTECTED]
id> wrote:

>Peserat ZoA Yth.
>
>Ada dua hal penting yang sangat menunjang perkembangan bioteknologi 
yaitu
>
>1. Protein engineering (diarahkan ke modifikasi makromolekul dalam 
hal ini
>protein/enzim, reseptor sel, dll): sangat didukung oleh interdiplin 
ilmu
>a.l. biokimia, biologi molekul, mikrobiologi, biologi sel, dan biologi
>struktur.
>2. Molecular design (diarahkan pada modifikasi small molecules dalam 
hal ini
>substrate, aktitivator atau inhibitor yang mempunyai massa kecil):
didukung
>ilmu-ilmu  kimia organik, natural product chemistry, biofisika, dll.
>
>Perkembangan bioteknologi  saat ini makin lebih lagi dengan tersedianya
>informasi struktur molekul karena dari struktur ini segala informasi
>mengenai fungsi-fungsi atom-atom pembentuk molekul mulai terkuak.
Ibaratkan
>enzim/protein itu seperti mobil maka strukturnya tersusun ada bagian-
bagian
>rangka, mesin, roda,  jok, dll. Kalau ingin menggunakan mobil untuk 
off road
>misalnya maka yang bagian struktur yang perlu diubah adalah roda. Kalau
>untuk keperluan balapan, mungkin volum (cc) mesin perlu diganti.
Dst. Dst.
>Demikian juga dalam protein engineering, untuk mengubah fungsi protein
>tertentu maka  harus tahu bagain residu asam amino apa  harus diganti.
Saat
>ini sekitar 14 ribu lebih struktur protein telah berhasil diselesaikan,
>untuk informasi lengkapnya silahkan buka data base pada http://www.
rcsb.org.
>Teknik-teknik yang digunakan untuk menentukan struktur adalah difraksi
>sinar-X (80%) dan NMR (20%) untuk makromolekul, dan sebaliknya NMR 
lebih
>banyak dipakai untuk menentukan molekul kecil.
>
>Khusus untuk difraksi sinar-X, hambatan utamanya terletak pada penyiapan
>sampel protein (kemurnian harus diatas 95%) dan pembuatan kristal.
Sampai
>saat ini tidak ada satu teoripun yang bisa menjamin pasti penumbuhan
>kristal. Yang ada hanyalah coba-coba (isilah halusnya menurut pak Arief
>"more art rather than
>science"). Jangankan protein satu dengan variannya, protein yang sama
>kondisi kristalisasinya bisa berbeda-beda. Kristalisasi adalah proses
>pengendapan yang berlangsung sangat-sangat lambat sehingga molekul-
molekul
>dapat tersusun dalam kisi-kisi kristal. Sekali inti kristal terbentuk
>pertumbuhan kristal selanjutnya akan lebih mudah dan lebih cepat.
Kondisi
>umum yang mempengaruhi pembentukan inti kristal adalah
>a. konsentrasi protein
>b. jenis larutan pengendap
>c. konsentrasi larutan pengendap
>d. kekuatan ion
>e. pH larutan
>f. suhu
>Untuk mendapatkan kristal yang baik dan dengan keteraturan tinggi (high
>mosaicity) kini telah dikembangkan teknik kristalisasi dalam medan 
magnit
>tinggi dan microgravity (ruang angkasa). Jika berminat untuk membaca 
teknik
>kristalisasi makromolekul silahkan membaca buku "Method In Enzymology"
>(1997) Vol. 276, hal 1 - 179. Dan juga kepada peneliti-peneliti 
bioteknologi
>di Indonesia yang berhasrat riset sampai ke struktur makromolekul, saya
>bersedia untuk berkolaborasi.
>
>Zeily Nurachman
>Department of Chemistry
>Bandung Institute of Technology
>Jl. Ganesha 10, Bandung 40132
>Indonesia
>Tel. +62 22 250 2103 ext 139
>Fax. +62 22 250 4154
>


>================================================
>
>Dr. Jaka Widada:
>-----------------
>
>--------- omitted part ---------------
>>>hasilnya hampir sama. Akan tetapi pada proses pemurnian dan kristalisasi
>>
>>>ternyata mempunyai karakter yang berlainan. Ada yang dengan mudah
>>dimurnikan
>>>dan dikristalkan, tetapi ada yang sangat sulit meskipun hanya beda
>>satu
>>>asam amino. Kira-kira faktor-faktor apakah yang berperan penting
>dalam
>>>perbedaan tersebut ?
>
>Dr. Arief Witarto:
>--------------------
>
>Pak Jaka Widada yth,
>Proses kristalisasi protein sering dibilang "more art rather than
>science" artinya masih banyak yang tidak diketahui dalam proses 
kristalisasi
>itu sehingga peran kesabaran dan pengalaman sangat penting. Mungkin
>itu yang bisa jawab. Selanjutnya, kalau tidak keberatan mungkin Dr.
>Zeily Nurachman (ITB) yang pengalaman membuat kristal, bisa cerita
>lebih jauh mengenai bidang ini. Saya lihat, Pak Zeily ada di forum
>ini juga.
>
>Wassalamualaikum wrwb
>
>Arief B. WITARTO
>







Reply via email to