[Freesurfer] [Tracula] ERRORS when using trac-all -prep

h21ms-utsumi Thu, 01 Dec 2022 02:36:48 -0800

        External Email - Use Caution        

Dear Freesurfer experts


I'm attempting to running TRACULA in a two subjects(one visit per 
subject and multiple deffusion scans per visit), as described on the 
TRACULA tutorial 
(https://secure-web.cisco.com/1YZplCc8ElxyKpvsfXb9OH_SNhToXmmPHixjCRlcZ51VHS12nUQQG4rMQybDPmP5RRwTYpZXLYBDCgi-aVwgAkIbD7f1nuv3qCRerbwqiEFE3PYEbp8GmUG0QZj8fv0kGh0sKwEI4r8ULPKz8OVdmWBr0me7wibJF1a8l5S74YstX_dkTB88f-aX5wFUKO798aWohHBR8zND-FMrt7oygYVYxsL29Q_PPvrSO9pY3WzpuLzpxcRYLe5zFQCaLJXJBW7T8VmIUQnJULc6AZpBWEUkPcavsBb5sLnWOQo8mARajKxbGYJ0zVdvJ3F9BgYZk/https%3A%2F%2Fsurfer.nmr.mgh.harvard.edu%2Ffswiki%2FFsTutorial%2FTracula,
 
https://secure-web.cisco.com/1nYtHW48eZdU7uUKv6TSjlFm9HP9CHGRmfSeoCOA7uunK3kIdhbSPNPcLfk5dxLcxWFiX2iHtjYsKFFHkoFhohA_CBpmhn00TFI7dj_A6_Ysx-lUshF_hf_8PUjxAdpehn-lqUTRnrPxgpYcsx8A0aJH2TTRWCAIqy17bdWBFVgQAQXbJRvtSUG4WJIHGUl8JnW7AvLKo8ViJ0qpfJKeQBkqJjtDD6vV1cJ-eyupl192QAfm_n0WbMnvunlfpzAz7Gt1ah6Mj6aSc5x3uQJeB0H0geYTLMZzvPA2AGFf8b1ADynWtOKW4a5-jHY9CyqkY/https%3A%2F%2Fsurfer.nmr.mgh.harvard.edu%2Ffswiki%2Fdmrirc,
 and 
https://secure-web.cisco.com/1i1x3WraESWH3k6zfmnPSieIq0qc66z7vq-nTTa6dKs81QaXyWb6SELvy3WVyD4G2zXOxWyMoa9XtbxMRvjRsZ8tCmHNGXEDfM3VvK19JRnw0BNx6bRO_1uIqy-6a2bcwHFYJ8Wpsym4MKm4wLCe8sqjV1P1uLv0rPNiOI771Wzr84BYMrpjzpwRR71UoYzZtPxhIN-6WqahEpeiW4OVNDbAMgz1WtV3OkZCxRKIR2CiF8R5TgCo6YpME4qVk5AgiEQFOpb86ElM97aPZcBORWVC4QR_7uCE_2Wrn1yTXf-9xfT2DGJhaCR9NpAzjOaVZ/https%3A%2F%2Fsurfer.nmr.mgh.harvard.edu%2Ffswiki%2FFsTutorial%2FRunningTracula),
 
but for my subjects I get the following error when I run the trac-all -
prep:

cp dwi.nii.gz /media/sf_share\freesurfer\7.3.2/subjects/diffusion_
tutorial/trc/subject1/dmri/data.nii.gz 
cp: cannot stat 'dwi.nii.gz': No such file or directory.

I checked the "dmri" directory and found that "data.nii.gz" was missing 
and "dwi.nii.gz " was there.

I've searched the archive list and I found the following two things;
 the dwi.nii.gz file is the DWI after all corrections have been made 
and the data.nii.gz file is a symbolic link to the other, so they should 
be the exact same file.
(https://secure-web.cisco.com/1qq_o3GFIoLx7Luv5Fgj2ZN5KBHCJCZzPPrZqzLzT3BdzI8z8iY0s3aw9ZiV1ZqrrmxTI8XTA7nXUIB1qpFj5LqqBdPnBFaZ7iS_mKC527GAIGxaf0Xr1d2hXyykfiJOg9la8SZsvG8hbRNzs9LKMucBEe_Qsq-Te92e_afgT0lgv8YjlwRCN8x4bLchbzgTax5xSIp36ImbKD-ULL5sKdOAT5Pt0iuy9S3llRWzxBj7k662wVU597F1GBdua-M2DqRsS_Ma2-VjUuqnpz_xJdR-CTlUc7ijJhoRDUMxdkCoZUzK06Oqx9Idmes9tVreb/https%3A%2F%2Fwww.mail-archive.com%2Ffreesurfer%40nmr.mgh.harvard.edu%2Fmsg39432.html)

 the data.nii.gz file is necessary for the process of "trac-all -bedp", 
not "trac-all -prep." 
(https://secure-web.cisco.com/1pjKE3HFIeU-FqIoHgU1xkoI3rom-BBboaeTQQ7MDiNVT78circo6cATHKBmSd6J0ggcrbRvJqQf9IqYLORohmBgZdmcnpjU0riT_Om05ORgE8YJiCXCAmGSQgA6bQw4ha8P5_aKiMWMMgVUnzTTyI4H1y9WPnVdAAGVvbf1a7xYUQHr4BKvE2zHSekVxYMsuHjf7wzvKK8F5QBedOY7m2_gAJA1y5HMgkJegAV_UG7qtaryWKAw2h2YWsWvJaig4iDNnu3bIRvxRxdg57lv8ZdiG6JgvjMwo1IsofvAdHvq9F47TrXAwtRnT8bgoBDMu/https%3A%2F%2Fwww.mail-archive.com%2Ffreesurfer%40nmr.mgh.harvard.edu%2Fmsg24254.html).


However, no similar errors have been reported. Does anyone have any 
thoughts on how to trouble-shoot this one? Also, Ive attached the dmrirc.
tutorial, trac-all.log, pre-diffusion_tutorial_tree.text, and post-
diffusion_tutorial_tree.text in case it's of any use. 

Best regards, 

Tomohiro Utsumi.

------------------------------------------------------------------------
-------- 
Tomohiro Utsumi, PhD Student.
Department of Psychiatry, The Jikei University School of Medicine, Tokyo,
 Japan.
------------------------------------------------------------------------
--------

dmrirc.tutorial
Description: Binary data

brain@l4n:/media/sf_share/freesurfer/7.3.2/subjects/diffusion_tutorial$ tree
.
|-- diffusion_tutorial_tree.txt
|-- fs
|   |-- subject1
|   |   |-- label
|   |   |   |-- BA_exvivo.ctab
|   |   |   |-- BA_exvivo.thresh.ctab
|   |   |   |-- aparc.annot.DKTatlas.ctab
|   |   |   |-- aparc.annot.a2009s.ctab
|   |   |   |-- aparc.annot.ctab
|   |   |   |-- lh.BA1_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA2_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA3a_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA3a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA3b_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA3b_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA44_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA44_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA45_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA45_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA4a_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA4a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA4p_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA4p_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA6_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA6_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.annot
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.thresh.annot
|   |   |   |-- lh.FG1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.FG2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.FG3.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.FG4.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.MT_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.MT_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.V1_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.V1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.V2_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.V2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.aparc.DKTatlas.annot
|   |   |   |-- lh.aparc.a2009s.annot
|   |   |   |-- lh.aparc.annot
|   |   |   |-- lh.cortex+hipamyg.label
|   |   |   |-- lh.cortex.label
|   |   |   |-- lh.entorhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.entorhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.hOc1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc3v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc4v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.mpm.vpnl.annot
|   |   |   |-- lh.nofix.cortex.label
|   |   |   |-- lh.perirhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.perirhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA1_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA2_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA3a_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA3a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA3b_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA3b_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA44_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA44_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA45_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA45_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA4a_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA4a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA4p_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA4p_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA6_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA6_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.annot
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.thresh.annot
|   |   |   |-- rh.FG1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.FG2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.FG3.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.FG4.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.MT_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.MT_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.V1_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.V1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.V2_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.V2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.aparc.DKTatlas.annot
|   |   |   |-- rh.aparc.a2009s.annot
|   |   |   |-- rh.aparc.annot
|   |   |   |-- rh.cortex+hipamyg.label
|   |   |   |-- rh.cortex.label
|   |   |   |-- rh.entorhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.entorhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.hOc1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc3v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc4v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.mpm.vpnl.annot
|   |   |   |-- rh.nofix.cortex.label
|   |   |   |-- rh.perirhinal_exvivo.label
|   |   |   `-- rh.perirhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |-- mri
|   |   |   |-- T1.mgz
|   |   |   |-- antsdn.brain.mgz
|   |   |   |-- aparc+aseg.mgz
|   |   |   |-- aparc.DKTatlas+aseg.mgz
|   |   |   |-- aparc.a2009s+aseg.mgz
|   |   |   |-- aseg.auto.mgz
|   |   |   |-- aseg.auto_noCCseg.label_intensities.txt
|   |   |   |-- aseg.auto_noCCseg.mgz
|   |   |   |-- aseg.mgz
|   |   |   |-- aseg.presurf.hypos.mgz
|   |   |   |-- aseg.presurf.mgz
|   |   |   |-- brain.finalsurfs.mgz
|   |   |   |-- brain.mgz
|   |   |   |-- brainmask.auto.mgz
|   |   |   |-- brainmask.mgz
|   |   |   |-- ctrl_pts.mgz
|   |   |   |-- filled.auto.mgz
|   |   |   |-- filled.mgz
|   |   |   |-- lh.ribbon.mgz
|   |   |   |-- mri_nu_correct.mni.log
|   |   |   |-- mri_nu_correct.mni.log.bak
|   |   |   |-- norm.mgz
|   |   |   |-- nu.mgz
|   |   |   |-- orig
|   |   |   |   `-- 001.mgz
|   |   |   |-- orig.mgz
|   |   |   |-- orig_nu.mgz
|   |   |   |-- rawavg.mgz
|   |   |   |-- rh.ribbon.mgz
|   |   |   |-- ribbon.mgz
|   |   |   |-- segment.dat
|   |   |   |-- surface.defects.mgz
|   |   |   |-- talairach.label_intensities.txt
|   |   |   |-- talairach.log
|   |   |   |-- talairach_with_skull.log
|   |   |   |-- transforms
|   |   |   |   |-- bak
|   |   |   |   |-- cc_up.lta
|   |   |   |   |-- talairach.auto.xfm
|   |   |   |   |-- talairach.auto.xfm.lta
|   |   |   |   |-- talairach.lta
|   |   |   |   |-- talairach.m3z
|   |   |   |   |-- talairach.xfm
|   |   |   |   |-- talairach.xfm.lta
|   |   |   |   |-- talairach_avi.log
|   |   |   |   |-- talairach_avi_QA.log
|   |   |   |   |-- talairach_with_skull.lta
|   |   |   |   `-- talsrcimg_to_711-2C_as_mni_average_305_t4_vox2vox.txt
|   |   |   |-- wm.asegedit.mgz
|   |   |   |-- wm.mgz
|   |   |   |-- wm.seg.mgz
|   |   |   `-- wmparc.mgz
|   |   |-- scripts
|   |   |   |-- IsRunning.trac
|   |   |   |-- build-stamp.txt
|   |   |   |-- csurfdir
|   |   |   |-- defect2seg.log
|   |   |   |-- dmrirc.local
|   |   |   |-- dmrirc.local.orig
|   |   |   |-- lastcall.build-stamp.txt
|   |   |   |-- patchdir.txt
|   |   |   |-- pctsurfcon.log
|   |   |   |-- pctsurfcon.log.old
|   |   |   |-- ponscc.cut.log
|   |   |   |-- recon-all-status.log
|   |   |   |-- recon-all.cmd
|   |   |   |-- recon-all.done
|   |   |   |-- recon-all.env
|   |   |   |-- recon-all.local-copy
|   |   |   |-- recon-all.log
|   |   |   |-- recon-config.yaml
|   |   |   |-- trac-all.local-copy
|   |   |   |-- trac-all.log
|   |   |   |-- trac-preproc.local-copy
|   |   |   `-- unknown-args.txt
|   |   |-- stats
|   |   |   |-- aseg.stats
|   |   |   |-- brainvol.stats
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.stats
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.thresh.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.DKTatlas.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.a2009s.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.pial.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.stats
|   |   |   |-- lh.curv.stats
|   |   |   |-- lh.w-g.pct.stats
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.stats
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.thresh.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.DKTatlas.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.a2009s.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.pial.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.stats
|   |   |   |-- rh.curv.stats
|   |   |   |-- rh.w-g.pct.stats
|   |   |   `-- wmparc.stats
|   |   |-- surf
|   |   |   |-- autodet.gw.stats.lh.dat
|   |   |   |-- autodet.gw.stats.rh.dat
|   |   |   |-- lh.area
|   |   |   |-- lh.area.mid
|   |   |   |-- lh.area.pial
|   |   |   |-- lh.avg_curv
|   |   |   |-- lh.curv
|   |   |   |-- lh.curv.pial
|   |   |   |-- lh.defect_borders
|   |   |   |-- lh.defect_chull
|   |   |   |-- lh.defect_labels
|   |   |   |-- lh.defects.pointset
|   |   |   |-- lh.fsaverage.sphere.reg
|   |   |   |-- lh.inflated
|   |   |   |-- lh.inflated.H
|   |   |   |-- lh.inflated.K
|   |   |   |-- lh.inflated.nofix
|   |   |   |-- lh.jacobian_white
|   |   |   |-- lh.orig
|   |   |   |-- lh.orig.nofix
|   |   |   |-- lh.orig.premesh
|   |   |   |-- lh.pial
|   |   |   |-- lh.pial.T1
|   |   |   |-- lh.qsphere.nofix
|   |   |   |-- lh.smoothwm
|   |   |   |-- lh.smoothwm.BE.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.C.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.FI.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.H.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.K.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.K1.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.K2.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.S.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.nofix
|   |   |   |-- lh.sphere
|   |   |   |-- lh.sphere.reg
|   |   |   |-- lh.sulc
|   |   |   |-- lh.thickness
|   |   |   |-- lh.volume
|   |   |   |-- lh.w-g.pct.mgh
|   |   |   |-- lh.white
|   |   |   |-- lh.white.H
|   |   |   |-- lh.white.K
|   |   |   |-- lh.white.preaparc
|   |   |   |-- lh.white.preaparc.H
|   |   |   |-- lh.white.preaparc.K
|   |   |   |-- rh.area
|   |   |   |-- rh.area.mid
|   |   |   |-- rh.area.pial
|   |   |   |-- rh.avg_curv
|   |   |   |-- rh.curv
|   |   |   |-- rh.curv.pial
|   |   |   |-- rh.defect_borders
|   |   |   |-- rh.defect_chull
|   |   |   |-- rh.defect_labels
|   |   |   |-- rh.defects.pointset
|   |   |   |-- rh.fsaverage.sphere.reg
|   |   |   |-- rh.inflated
|   |   |   |-- rh.inflated.H
|   |   |   |-- rh.inflated.K
|   |   |   |-- rh.inflated.nofix
|   |   |   |-- rh.jacobian_white
|   |   |   |-- rh.orig
|   |   |   |-- rh.orig.nofix
|   |   |   |-- rh.orig.premesh
|   |   |   |-- rh.pial
|   |   |   |-- rh.pial.T1
|   |   |   |-- rh.qsphere.nofix
|   |   |   |-- rh.smoothwm
|   |   |   |-- rh.smoothwm.BE.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.C.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.FI.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.H.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.K.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.K1.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.K2.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.S.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.nofix
|   |   |   |-- rh.sphere
|   |   |   |-- rh.sphere.reg
|   |   |   |-- rh.sulc
|   |   |   |-- rh.thickness
|   |   |   |-- rh.volume
|   |   |   |-- rh.w-g.pct.mgh
|   |   |   |-- rh.white
|   |   |   |-- rh.white.H
|   |   |   |-- rh.white.K
|   |   |   |-- rh.white.preaparc
|   |   |   |-- rh.white.preaparc.H
|   |   |   `-- rh.white.preaparc.K
|   |   |-- tmp
|   |   |-- touch
|   |   |   |-- apas2aseg.touch
|   |   |   |-- asegmerge.touch
|   |   |   |-- ca_label.touch
|   |   |   |-- ca_normalize.touch
|   |   |   |-- ca_register.touch
|   |   |   |-- conform.touch
|   |   |   |-- cortical_ribbon.touch
|   |   |   |-- em_register.touch
|   |   |   |-- fill.touch
|   |   |   |-- inorm1.touch
|   |   |   |-- inorm2.touch
|   |   |   |-- lh.aparc.touch
|   |   |   |-- lh.aparc2.touch
|   |   |   |-- lh.aparcstats.touch
|   |   |   |-- lh.aparcstats2.touch
|   |   |   |-- lh.aparcstats3.touch
|   |   |   |-- lh.autodet.gw.stats.touch
|   |   |   |-- lh.avgcurv.touch
|   |   |   |-- lh.cortex+hipamyg.touch
|   |   |   |-- lh.cortex.touch
|   |   |   |-- lh.curvstats.touch
|   |   |   |-- lh.inflate.H.K.touch
|   |   |   |-- lh.inflate1.touch
|   |   |   |-- lh.inflate2.touch
|   |   |   |-- lh.jacobian_white.touch
|   |   |   |-- lh.pctsurfcon.touch
|   |   |   |-- lh.pial.touch
|   |   |   |-- lh.qsphere.touch
|   |   |   |-- lh.smoothwm1.touch
|   |   |   |-- lh.smoothwm2.touch
|   |   |   |-- lh.sphmorph.touch
|   |   |   |-- lh.sphreg.touch
|   |   |   |-- lh.tessellate.touch
|   |   |   |-- lh.topofix.touch
|   |   |   |-- lh.white.H.K.touch
|   |   |   |-- lh.white.preaparc.touch
|   |   |   |-- lh.white.touch
|   |   |   |-- nu.touch
|   |   |   |-- relabelhypos.touch
|   |   |   |-- rh.aparc.touch
|   |   |   |-- rh.aparc2.touch
|   |   |   |-- rh.aparcstats.touch
|   |   |   |-- rh.aparcstats2.touch
|   |   |   |-- rh.aparcstats3.touch
|   |   |   |-- rh.autodet.gw.stats.touch
|   |   |   |-- rh.avgcurv.touch
|   |   |   |-- rh.cortex+hipamyg.touch
|   |   |   |-- rh.cortex.touch
|   |   |   |-- rh.curvstats.touch
|   |   |   |-- rh.inflate.H.K.touch
|   |   |   |-- rh.inflate1.touch
|   |   |   |-- rh.inflate2.touch
|   |   |   |-- rh.jacobian_white.touch
|   |   |   |-- rh.pctsurfcon.touch
|   |   |   |-- rh.pial.touch
|   |   |   |-- rh.qsphere.touch
|   |   |   |-- rh.smoothwm1.touch
|   |   |   |-- rh.smoothwm2.touch
|   |   |   |-- rh.sphmorph.touch
|   |   |   |-- rh.sphreg.touch
|   |   |   |-- rh.tessellate.touch
|   |   |   |-- rh.topofix.touch
|   |   |   |-- rh.white.H.K.touch
|   |   |   |-- rh.white.preaparc.touch
|   |   |   |-- rh.white.touch
|   |   |   |-- segstats.touch
|   |   |   |-- skull.lta.touch
|   |   |   |-- skull_strip.touch
|   |   |   |-- talairach.touch
|   |   |   |-- wmaparc.stats.touch
|   |   |   `-- wmsegment.touch
|   |   `-- trash
|   |-- subject1.nii.gz
|   |-- subject2
|   |   |-- label
|   |   |   |-- BA_exvivo.ctab
|   |   |   |-- BA_exvivo.thresh.ctab
|   |   |   |-- aparc.annot.DKTatlas.ctab
|   |   |   |-- aparc.annot.a2009s.ctab
|   |   |   |-- aparc.annot.ctab
|   |   |   |-- lh.BA1_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA2_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA3a_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA3a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA3b_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA3b_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA44_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA44_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA45_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA45_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA4a_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA4a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA4p_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA4p_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA6_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.BA6_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.annot
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.thresh.annot
|   |   |   |-- lh.FG1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.FG2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.FG3.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.FG4.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.MT_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.MT_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.V1_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.V1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.V2_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.V2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.aparc.DKTatlas.annot
|   |   |   |-- lh.aparc.a2009s.annot
|   |   |   |-- lh.aparc.annot
|   |   |   |-- lh.cortex+hipamyg.label
|   |   |   |-- lh.cortex.label
|   |   |   |-- lh.entorhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.entorhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.hOc1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc3v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc4v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.mpm.vpnl.annot
|   |   |   |-- lh.nofix.cortex.label
|   |   |   |-- lh.perirhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.perirhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA1_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA2_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA3a_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA3a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA3b_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA3b_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA44_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA44_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA45_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA45_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA4a_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA4a_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA4p_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA4p_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA6_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA6_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.annot
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.thresh.annot
|   |   |   |-- rh.FG1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.FG2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.FG3.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.FG4.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.MT_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.MT_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.V1_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.V1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.V2_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.V2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.aparc.DKTatlas.annot
|   |   |   |-- rh.aparc.a2009s.annot
|   |   |   |-- rh.aparc.annot
|   |   |   |-- rh.cortex+hipamyg.label
|   |   |   |-- rh.cortex.label
|   |   |   |-- rh.entorhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.entorhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.hOc1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc3v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc4v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.mpm.vpnl.annot
|   |   |   |-- rh.nofix.cortex.label
|   |   |   |-- rh.perirhinal_exvivo.label
|   |   |   `-- rh.perirhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |-- mri
|   |   |   |-- T1.mgz
|   |   |   |-- antsdn.brain.mgz
|   |   |   |-- aparc+aseg.mgz
|   |   |   |-- aparc.DKTatlas+aseg.mgz
|   |   |   |-- aparc.a2009s+aseg.mgz
|   |   |   |-- aseg.auto.mgz
|   |   |   |-- aseg.auto_noCCseg.label_intensities.txt
|   |   |   |-- aseg.auto_noCCseg.mgz
|   |   |   |-- aseg.mgz
|   |   |   |-- aseg.presurf.hypos.mgz
|   |   |   |-- aseg.presurf.mgz
|   |   |   |-- brain.finalsurfs.mgz
|   |   |   |-- brain.mgz
|   |   |   |-- brainmask.auto.mgz
|   |   |   |-- brainmask.mgz
|   |   |   |-- ctrl_pts.mgz
|   |   |   |-- filled.auto.mgz
|   |   |   |-- filled.mgz
|   |   |   |-- lh.ribbon.mgz
|   |   |   |-- mri_nu_correct.mni.log
|   |   |   |-- mri_nu_correct.mni.log.bak
|   |   |   |-- norm.mgz
|   |   |   |-- nu.mgz
|   |   |   |-- orig
|   |   |   |   `-- 001.mgz
|   |   |   |-- orig.mgz
|   |   |   |-- orig_nu.mgz
|   |   |   |-- rawavg.mgz
|   |   |   |-- rh.ribbon.mgz
|   |   |   |-- ribbon.mgz
|   |   |   |-- segment.dat
|   |   |   |-- surface.defects.mgz
|   |   |   |-- talairach.label_intensities.txt
|   |   |   |-- talairach.log
|   |   |   |-- talairach_with_skull.log
|   |   |   |-- transforms
|   |   |   |   |-- bak
|   |   |   |   |-- cc_up.lta
|   |   |   |   |-- talairach.auto.xfm
|   |   |   |   |-- talairach.auto.xfm.lta
|   |   |   |   |-- talairach.lta
|   |   |   |   |-- talairach.m3z
|   |   |   |   |-- talairach.xfm
|   |   |   |   |-- talairach.xfm.lta
|   |   |   |   |-- talairach_avi.log
|   |   |   |   |-- talairach_avi_QA.log
|   |   |   |   |-- talairach_with_skull.lta
|   |   |   |   `-- talsrcimg_to_711-2C_as_mni_average_305_t4_vox2vox.txt
|   |   |   |-- wm.asegedit.mgz
|   |   |   |-- wm.mgz
|   |   |   |-- wm.seg.mgz
|   |   |   `-- wmparc.mgz
|   |   |-- scripts
|   |   |   |-- build-stamp.txt
|   |   |   |-- defect2seg.log
|   |   |   |-- lastcall.build-stamp.txt
|   |   |   |-- patchdir.txt
|   |   |   |-- pctsurfcon.log
|   |   |   |-- pctsurfcon.log.old
|   |   |   |-- ponscc.cut.log
|   |   |   |-- recon-all-status.log
|   |   |   |-- recon-all.cmd
|   |   |   |-- recon-all.done
|   |   |   |-- recon-all.env
|   |   |   |-- recon-all.local-copy
|   |   |   |-- recon-all.log
|   |   |   |-- recon-config.yaml
|   |   |   `-- unknown-args.txt
|   |   |-- stats
|   |   |   |-- aseg.stats
|   |   |   |-- brainvol.stats
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.stats
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.thresh.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.DKTatlas.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.a2009s.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.pial.stats
|   |   |   |-- lh.aparc.stats
|   |   |   |-- lh.curv.stats
|   |   |   |-- lh.w-g.pct.stats
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.stats
|   |   |   |-- rh.BA_exvivo.thresh.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.DKTatlas.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.a2009s.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.pial.stats
|   |   |   |-- rh.aparc.stats
|   |   |   |-- rh.curv.stats
|   |   |   |-- rh.w-g.pct.stats
|   |   |   `-- wmparc.stats
|   |   |-- surf
|   |   |   |-- autodet.gw.stats.lh.dat
|   |   |   |-- autodet.gw.stats.rh.dat
|   |   |   |-- lh.area
|   |   |   |-- lh.area.mid
|   |   |   |-- lh.area.pial
|   |   |   |-- lh.avg_curv
|   |   |   |-- lh.curv
|   |   |   |-- lh.curv.pial
|   |   |   |-- lh.defect_borders
|   |   |   |-- lh.defect_chull
|   |   |   |-- lh.defect_labels
|   |   |   |-- lh.defects.pointset
|   |   |   |-- lh.fsaverage.sphere.reg
|   |   |   |-- lh.inflated
|   |   |   |-- lh.inflated.H
|   |   |   |-- lh.inflated.K
|   |   |   |-- lh.inflated.nofix
|   |   |   |-- lh.jacobian_white
|   |   |   |-- lh.orig
|   |   |   |-- lh.orig.nofix
|   |   |   |-- lh.orig.premesh
|   |   |   |-- lh.pial
|   |   |   |-- lh.pial.T1
|   |   |   |-- lh.qsphere.nofix
|   |   |   |-- lh.smoothwm
|   |   |   |-- lh.smoothwm.BE.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.C.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.FI.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.H.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.K.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.K1.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.K2.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.S.crv
|   |   |   |-- lh.smoothwm.nofix
|   |   |   |-- lh.sphere
|   |   |   |-- lh.sphere.reg
|   |   |   |-- lh.sulc
|   |   |   |-- lh.thickness
|   |   |   |-- lh.volume
|   |   |   |-- lh.w-g.pct.mgh
|   |   |   |-- lh.white
|   |   |   |-- lh.white.H
|   |   |   |-- lh.white.K
|   |   |   |-- lh.white.preaparc
|   |   |   |-- lh.white.preaparc.H
|   |   |   |-- lh.white.preaparc.K
|   |   |   |-- rh.area
|   |   |   |-- rh.area.mid
|   |   |   |-- rh.area.pial
|   |   |   |-- rh.avg_curv
|   |   |   |-- rh.curv
|   |   |   |-- rh.curv.pial
|   |   |   |-- rh.defect_borders
|   |   |   |-- rh.defect_chull
|   |   |   |-- rh.defect_labels
|   |   |   |-- rh.defects.pointset
|   |   |   |-- rh.fsaverage.sphere.reg
|   |   |   |-- rh.inflated
|   |   |   |-- rh.inflated.H
|   |   |   |-- rh.inflated.K
|   |   |   |-- rh.inflated.nofix
|   |   |   |-- rh.jacobian_white
|   |   |   |-- rh.orig
|   |   |   |-- rh.orig.nofix
|   |   |   |-- rh.orig.premesh
|   |   |   |-- rh.pial
|   |   |   |-- rh.pial.T1
|   |   |   |-- rh.qsphere.nofix
|   |   |   |-- rh.smoothwm
|   |   |   |-- rh.smoothwm.BE.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.C.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.FI.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.H.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.K.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.K1.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.K2.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.S.crv
|   |   |   |-- rh.smoothwm.nofix
|   |   |   |-- rh.sphere
|   |   |   |-- rh.sphere.reg
|   |   |   |-- rh.sulc
|   |   |   |-- rh.thickness
|   |   |   |-- rh.volume
|   |   |   |-- rh.w-g.pct.mgh
|   |   |   |-- rh.white
|   |   |   |-- rh.white.H
|   |   |   |-- rh.white.K
|   |   |   |-- rh.white.preaparc
|   |   |   |-- rh.white.preaparc.H
|   |   |   `-- rh.white.preaparc.K
|   |   |-- tmp
|   |   |-- touch
|   |   |   |-- apas2aseg.touch
|   |   |   |-- asegmerge.touch
|   |   |   |-- ca_label.touch
|   |   |   |-- ca_normalize.touch
|   |   |   |-- ca_register.touch
|   |   |   |-- conform.touch
|   |   |   |-- cortical_ribbon.touch
|   |   |   |-- em_register.touch
|   |   |   |-- fill.touch
|   |   |   |-- inorm1.touch
|   |   |   |-- inorm2.touch
|   |   |   |-- lh.aparc.touch
|   |   |   |-- lh.aparc2.touch
|   |   |   |-- lh.aparcstats.touch
|   |   |   |-- lh.aparcstats2.touch
|   |   |   |-- lh.aparcstats3.touch
|   |   |   |-- lh.autodet.gw.stats.touch
|   |   |   |-- lh.avgcurv.touch
|   |   |   |-- lh.cortex+hipamyg.touch
|   |   |   |-- lh.cortex.touch
|   |   |   |-- lh.curvstats.touch
|   |   |   |-- lh.inflate.H.K.touch
|   |   |   |-- lh.inflate1.touch
|   |   |   |-- lh.inflate2.touch
|   |   |   |-- lh.jacobian_white.touch
|   |   |   |-- lh.pctsurfcon.touch
|   |   |   |-- lh.pial.touch
|   |   |   |-- lh.qsphere.touch
|   |   |   |-- lh.smoothwm1.touch
|   |   |   |-- lh.smoothwm2.touch
|   |   |   |-- lh.sphmorph.touch
|   |   |   |-- lh.sphreg.touch
|   |   |   |-- lh.tessellate.touch
|   |   |   |-- lh.topofix.touch
|   |   |   |-- lh.white.H.K.touch
|   |   |   |-- lh.white.preaparc.touch
|   |   |   |-- lh.white.touch
|   |   |   |-- nu.touch
|   |   |   |-- relabelhypos.touch
|   |   |   |-- rh.aparc.touch
|   |   |   |-- rh.aparc2.touch
|   |   |   |-- rh.aparcstats.touch
|   |   |   |-- rh.aparcstats2.touch
|   |   |   |-- rh.aparcstats3.touch
|   |   |   |-- rh.autodet.gw.stats.touch
|   |   |   |-- rh.avgcurv.touch
|   |   |   |-- rh.cortex+hipamyg.touch
|   |   |   |-- rh.cortex.touch
|   |   |   |-- rh.curvstats.touch
|   |   |   |-- rh.inflate.H.K.touch
|   |   |   |-- rh.inflate1.touch
|   |   |   |-- rh.inflate2.touch
|   |   |   |-- rh.jacobian_white.touch
|   |   |   |-- rh.pctsurfcon.touch
|   |   |   |-- rh.pial.touch
|   |   |   |-- rh.qsphere.touch
|   |   |   |-- rh.smoothwm1.touch
|   |   |   |-- rh.smoothwm2.touch
|   |   |   |-- rh.sphmorph.touch
|   |   |   |-- rh.sphreg.touch
|   |   |   |-- rh.tessellate.touch
|   |   |   |-- rh.topofix.touch
|   |   |   |-- rh.white.H.K.touch
|   |   |   |-- rh.white.preaparc.touch
|   |   |   |-- rh.white.touch
|   |   |   |-- segstats.touch
|   |   |   |-- skull.lta.touch
|   |   |   |-- skull_strip.touch
|   |   |   |-- talairach.touch
|   |   |   |-- wmaparc.stats.touch
|   |   |   `-- wmsegment.touch
|   |   `-- trash
|   `-- subject2.nii.gz
|-- raw
|   |-- subject1
|   |   |-- dwi1
|   |   |   |-- subject1.nii
|   |   |   |-- subject1.nii.gz
|   |   |   |-- subject1_bval.txt
|   |   |   `-- subject1_bvec.txt
|   |   `-- dwi2
|   |       |-- subject1.nii
|   |       |-- subject1.nii.gz
|   |       |-- subject1_bval_PA.txt
|   |       `-- subject1_bvec_PA.txt
|   `-- subject2
|       |-- dwi1
|       |   |-- subject2.nii
|       |   |-- subject2.nii.gz
|       |   |-- subject2_bval.txt
|       |   `-- subject2_bvec.txt
|       `-- dwi2
|           |-- subject2.nii.gz
|           |-- subject2_PA.nii
|           |-- subject2_bval_PA.txt
|           `-- subject2_bvec_PA.txt
`-- trc
    `-- subject1
        |-- dlabel
        |   `-- diff
        |       `-- lowb_brain_mask.nii.gz
        |-- dmri
        |   |-- acqp.txt
        |   |-- b02b0.cnf
        |   |-- dwi.bvals
        |   |-- dwi.bvecs
        |   |-- dwi.eddy_command_txt
        |   |-- dwi.eddy_movement_rms
        |   |-- dwi.eddy_outlier_map
        |   |-- dwi.eddy_outlier_n_sqr_stdev_map
        |   |-- dwi.eddy_outlier_n_stdev_map
        |   |-- dwi.eddy_outlier_report
        |   |-- dwi.eddy_parameters
        |   |-- dwi.eddy_post_eddy_shell_PE_translation_parameters
        |   |-- dwi.eddy_post_eddy_shell_alignment_parameters
        |   |-- dwi.eddy_restricted_movement_rms
        |   |-- dwi.eddy_rotated_bvecs
        |   |-- dwi.eddy_values_of_all_input_parameters
        |   |-- dwi.nii.gz
        |   |-- dwi_orig.1.bvals
        |   |-- dwi_orig.1.bvecs
        |   |-- dwi_orig.1.nii.gz
        |   |-- dwi_orig.2.bvals
        |   |-- dwi_orig.2.bvecs
        |   |-- dwi_orig.2.nii.gz
        |   |-- dwi_orig_las.1.bvals
        |   |-- dwi_orig_las.1.bvecs
        |   |-- dwi_orig_las.1.nii.gz
        |   |-- dwi_orig_las.2.bvals
        |   |-- dwi_orig_las.2.bvecs
        |   |-- dwi_orig_las.2.nii.gz
        |   |-- dwi_orig_las.bvals
        |   |-- dwi_orig_las.bvecs
        |   |-- dwi_orig_las.nii.gz
        |   |-- index.txt
        |   |-- lowb.nii.gz
        |   |-- lowb_brain.nii.gz
        |   |-- lowb_orig_las.1.nii.gz
        |   |-- lowb_orig_las.2.nii.gz
        |   |-- lowb_orig_las.nii.gz
        |   |-- lowb_orig_las.topup_log
        |   |-- lowb_topup.nii.gz
        |   |-- lowb_topup_brain.nii.gz
        |   |-- lowb_topup_brain_mask.nii.gz
        |   |-- topup_fieldcoef.nii.gz
        |   |-- topup_movpar.txt
        |   `-- xfms
        `-- scripts
            |-- build-stamp.txt
            |-- csurfdir
            |-- dmrirc.local
            |-- trac-all.cmd
            |-- trac-all.error
            |-- trac-all.local-copy
            |-- trac-all.log
            `-- trac-preproc.local-copy

brain@l4n:/media/sf_share/freesurfer/7.3.2/subjects/diffusion_tutorial$ tree
.
âââ dmrirc.tutorial
âââ fs
âÂ Â  âââ subject1
âÂ Â  âÂ Â  âââ label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ BA_exvivo.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ BA_exvivo.thresh.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.annot.DKTatlas.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.annot.a2009s.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.annot.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3b_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3b_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA44_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA44_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA45_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA45_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4p_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4p_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA6_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA6_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.thresh.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG3.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG4.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.MT_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.MT_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.DKTatlas.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.a2009s.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex+hipamyg.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.entorhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.entorhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc3v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc4v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.mpm.vpnl.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.nofix.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.perirhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.perirhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3b_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3b_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA44_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA44_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA45_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA45_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4p_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4p_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA6_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA6_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.thresh.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG3.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG4.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.MT_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.MT_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.DKTatlas.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.a2009s.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex+hipamyg.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.entorhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.entorhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc3v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc4v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.mpm.vpnl.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.nofix.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.perirhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.perirhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âââ mri
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ T1.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ antsdn.brain.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc+aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.DKTatlas+aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.a2009s+aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.auto.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.auto_noCCseg.label_intensities.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.auto_noCCseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.presurf.hypos.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.presurf.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brain.finalsurfs.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brain.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brainmask.auto.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brainmask.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ctrl_pts.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ filled.auto.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ filled.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.ribbon.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ mri_nu_correct.mni.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ mri_nu_correct.mni.log.bak
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ norm.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ nu.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ orig
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ 001.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ orig.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ orig_nu.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rawavg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.ribbon.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ribbon.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ segment.dat
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ surface.defects.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.label_intensities.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_with_skull.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ transforms
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ bak
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ cc_up.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.auto.xfm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.auto.xfm.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.m3z
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.xfm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.xfm.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_avi.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_avi_QA.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_with_skull.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ 
talsrcimg_to_711-2C_as_mni_average_305_t4_vox2vox.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wm.asegedit.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wm.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wm.seg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmparc.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âââ scripts
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ IsRunning.trac
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ build-stamp.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ csurfdir
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ defect2seg.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ dmrirc.local
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ dmrirc.local.orig
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lastcall.build-stamp.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ patchdir.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ pctsurfcon.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ pctsurfcon.log.old
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ponscc.cut.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all-status.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.cmd
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.done
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.env
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.local-copy
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-config.yaml
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ trac-all.cmd
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ trac-all.local-copy
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ trac-all.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ trac-preproc.local-copy
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ unknown-args.txt
âÂ Â  âÂ Â  âââ stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brainvol.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.thresh.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.DKTatlas.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.a2009s.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.pial.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curv.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.w-g.pct.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.thresh.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.DKTatlas.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.a2009s.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.pial.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curv.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.w-g.pct.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmparc.stats
âÂ Â  âÂ Â  âââ surf
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ autodet.gw.stats.lh.dat
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ autodet.gw.stats.rh.dat
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.area
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.area.mid
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.area.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.avg_curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curv.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defect_borders
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defect_chull
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defect_labels
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defects.pointset
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.fsaverage.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.jacobian_white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.orig
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.orig.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.orig.premesh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pial.T1
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.qsphere.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.BE.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.C.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.FI.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.H.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.K.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.K1.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.K2.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.S.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphere
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sulc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.thickness
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.volume
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.w-g.pct.mgh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.area
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.area.mid
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.area.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.avg_curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curv.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defect_borders
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defect_chull
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defect_labels
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defects.pointset
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.fsaverage.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.jacobian_white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.orig
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.orig.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.orig.premesh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pial.T1
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.qsphere.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.BE.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.C.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.FI.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.H.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.K.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.K1.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.K2.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.S.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphere
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sulc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.thickness
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.volume
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.w-g.pct.mgh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc.K
âÂ Â  âÂ Â  âââ tmp
âÂ Â  âÂ Â  âââ touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ apas2aseg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ asegmerge.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ca_label.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ca_normalize.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ca_register.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ conform.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ cortical_ribbon.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ em_register.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ fill.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ inorm1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ inorm2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparcstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparcstats2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparcstats3.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.autodet.gw.stats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.avgcurv.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex+hipamyg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curvstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflate.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflate1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflate2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.jacobian_white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pctsurfcon.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pial.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.qsphere.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphmorph.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphreg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.tessellate.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.topofix.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ nu.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ relabelhypos.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparcstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparcstats2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparcstats3.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.autodet.gw.stats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.avgcurv.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex+hipamyg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curvstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflate.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflate1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflate2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.jacobian_white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pctsurfcon.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pial.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.qsphere.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphmorph.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphreg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.tessellate.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.topofix.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ segstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ skull.lta.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ skull_strip.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmaparc.stats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmsegment.touch
âÂ Â  âÂ Â  âââ trash
âÂ Â  âââ subject1.nii.gz
âÂ Â  âââ subject2
âÂ Â  âÂ Â  âââ label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ BA_exvivo.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ BA_exvivo.thresh.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.annot.DKTatlas.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.annot.a2009s.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.annot.ctab
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3b_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA3b_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA44_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA44_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA45_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA45_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4p_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA4p_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA6_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA6_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.thresh.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG3.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.FG4.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.MT_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.MT_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.V2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.DKTatlas.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.a2009s.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex+hipamyg.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.entorhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.entorhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc3v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.hOc4v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.mpm.vpnl.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.nofix.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.perirhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.perirhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3b_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA3b_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA44_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA44_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA45_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA45_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4a_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4a_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4p_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA4p_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA6_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA6_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.thresh.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG3.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.FG4.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.MT_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.MT_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V1_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V1_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V2_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.V2_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.DKTatlas.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.a2009s.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex+hipamyg.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.entorhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.entorhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc1.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc2.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc3v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.hOc4v.mpm.vpnl.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.mpm.vpnl.annot
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.nofix.cortex.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.perirhinal_exvivo.label
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.perirhinal_exvivo.thresh.label
âÂ Â  âÂ Â  âââ mri
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ T1.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ antsdn.brain.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc+aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.DKTatlas+aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aparc.a2009s+aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.auto.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.auto_noCCseg.label_intensities.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.auto_noCCseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.presurf.hypos.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.presurf.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brain.finalsurfs.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brain.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brainmask.auto.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brainmask.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ctrl_pts.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ filled.auto.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ filled.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.ribbon.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ mri_nu_correct.mni.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ mri_nu_correct.mni.log.bak
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ norm.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ nu.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ orig
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ 001.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ orig.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ orig_nu.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rawavg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.ribbon.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ribbon.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ segment.dat
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ surface.defects.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.label_intensities.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_with_skull.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ transforms
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ bak
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ cc_up.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.auto.xfm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.auto.xfm.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.m3z
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.xfm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.xfm.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_avi.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_avi_QA.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach_with_skull.lta
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ 
talsrcimg_to_711-2C_as_mni_average_305_t4_vox2vox.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wm.asegedit.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wm.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wm.seg.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmparc.mgz
âÂ Â  âÂ Â  âââ scripts
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ build-stamp.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ defect2seg.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lastcall.build-stamp.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ patchdir.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ pctsurfcon.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ pctsurfcon.log.old
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ponscc.cut.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all-status.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.cmd
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.done
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.env
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.local-copy
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-all.log
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ recon-config.yaml
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ unknown-args.txt
âÂ Â  âÂ Â  âââ stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ aseg.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ brainvol.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.BA_exvivo.thresh.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.DKTatlas.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.a2009s.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.pial.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curv.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.w-g.pct.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.BA_exvivo.thresh.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.DKTatlas.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.a2009s.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.pial.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curv.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.w-g.pct.stats
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmparc.stats
âÂ Â  âÂ Â  âââ surf
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ autodet.gw.stats.lh.dat
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ autodet.gw.stats.rh.dat
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.area
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.area.mid
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.area.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.avg_curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curv.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defect_borders
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defect_chull
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defect_labels
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.defects.pointset
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.fsaverage.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflated.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.jacobian_white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.orig
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.orig.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.orig.premesh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pial.T1
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.qsphere.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.BE.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.C.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.FI.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.H.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.K.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.K1.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.K2.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.S.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphere
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sulc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.thickness
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.volume
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.w-g.pct.mgh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.area
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.area.mid
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.area.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.avg_curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curv.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defect_borders
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defect_chull
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defect_labels
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.defects.pointset
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.fsaverage.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflated.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.jacobian_white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.orig
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.orig.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.orig.premesh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pial
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pial.T1
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.qsphere.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.BE.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.C.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.FI.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.H.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.K.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.K1.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.K2.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.S.crv
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm.nofix
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphere
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphere.reg
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sulc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.thickness
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.volume
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.w-g.pct.mgh
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.K
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc.H
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc.K
âÂ Â  âÂ Â  âââ tmp
âÂ Â  âÂ Â  âââ touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ apas2aseg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ asegmerge.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ca_label.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ca_normalize.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ ca_register.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ conform.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ cortical_ribbon.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ em_register.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ fill.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ inorm1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ inorm2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparc2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparcstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparcstats2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.aparcstats3.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.autodet.gw.stats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.avgcurv.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex+hipamyg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.cortex.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.curvstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflate.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflate1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.inflate2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.jacobian_white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pctsurfcon.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.pial.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.qsphere.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.smoothwm2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphmorph.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.sphreg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.tessellate.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.topofix.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.preaparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ lh.white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ nu.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ relabelhypos.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparc2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparcstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparcstats2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.aparcstats3.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.autodet.gw.stats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.avgcurv.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex+hipamyg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.cortex.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.curvstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflate.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflate1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.inflate2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.jacobian_white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pctsurfcon.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.pial.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.qsphere.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm1.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.smoothwm2.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphmorph.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.sphreg.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.tessellate.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.topofix.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.H.K.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.preaparc.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ rh.white.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ segstats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ skull.lta.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ skull_strip.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ talairach.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmaparc.stats.touch
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ wmsegment.touch
âÂ Â  âÂ Â  âââ trash
âÂ Â  âââ subject2.nii.gz
âââ raw
âÂ Â  âââ subject1
âÂ Â  âÂ Â  âââ dwi1
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ subject1.nii
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ subject1.nii.gz
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ subject1_bval.txt
âÂ Â  âÂ Â  âÂ Â  âââ subject1_bvec.txt
âÂ Â  âÂ Â  âââ dwi2
âÂ Â  âÂ Â      âââ subject1.nii
âÂ Â  âÂ Â      âââ subject1.nii.gz
âÂ Â  âÂ Â      âââ subject1_bval_PA.txt
âÂ Â  âÂ Â      âââ subject1_bvec_PA.txt
âÂ Â  âââ subject2
âÂ Â      âââ dwi1
âÂ Â      âÂ Â  âââ subject2.nii
âÂ Â      âÂ Â  âââ subject2.nii.gz
âÂ Â      âÂ Â  âââ subject2_bval.txt
âÂ Â      âÂ Â  âââ subject2_bvec.txt
âÂ Â      âââ dwi2
âÂ Â          âââ subject2.nii.gz
âÂ Â          âââ subject2_PA.nii
âÂ Â          âââ subject2_bval_PA.txt
âÂ Â          âââ subject2_bvec_PA.txt
âââ trc

trac-all.error
Description: Binary data

trac-all.log
Description: Binary data

_______________________________________________
Freesurfer mailing list
[email protected]
https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is 
addressed.  If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail 
contains patient information, please contact the Mass General Brigham 
Compliance HelpLine at https://www.massgeneralbrigham.org/complianceline 
<https://www.massgeneralbrigham.org/complianceline> .
Please note that this e-mail is not secure (encrypted).  If you do not wish to 
continue communication over unencrypted e-mail, please notify the sender of 
this message immediately.  Continuing to send or respond to e-mail after 
receiving this message means you understand and accept this risk and wish to 
continue to communicate over unencrypted e-mail.

[Freesurfer] [Tracula] ERRORS when using trac-all -prep

Reply via email to