If you installed into the base environment, you should rollback it to
the last clean revision. Use /conda list --revisions/ to see which
revision number you need to use. Then use /conda install --revision N/
(where N is the revision number).
You should also make sure that your conda package resolver is up-to-date
before creating a new environment for gdal. Otherwise, it might happen
that conda installs an old gdal version. To update it, run /conda update
conda/ or /conda update --all/ in your base environment. Note hat you
may have to add /-c conda-forge/ to avoid mixing up packages coming from
the /main /channel with those from the /conda-forge/ channel.
Am 07.12.2021 um 12:15 schrieb Paul Harwood:
Results like that are usually caused because there is something
already in the conda environment that is causing a conflict and I
notice that it is installing into /Users/idan.miara/opt/miniconda3
which would usually mean you have installed into the "base" conda
environment - which is not usually the best idea.
If you try ...
conda create --name gdaltest
conda activate gdaltest
conda install -c conda-forge gdal
{noteing that the name "gdaltest" in the first and second lines could
be any name for a conda environment that is not already in use}
... I am reasonably sure it will work.
Then you just need to use the "gdaltest" environment when you want to
use conda.
On Tue, 7 Dec 2021 at 09:03, Idan Miara <[email protected]> wrote:
Hi all,
I'm trying to install gdal on MacOS Big Sur via conda.
For some reason it installs v3.0.2, even though v3.4.0 is available.
Also it doesn't run, and gives the following error:
~ gdalinfo --version
dyld: Library not loaded: @rpath/libpoppler.91.dylib
Thanks!
logs are below.
Kind regards,
Idan
conda install -c conda-forge gdal
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
## Package Plan ##
environment location: /Users/idan.miara/opt/miniconda3
added / updated specs:
- gdal
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
boost-cpp-1.72.0 | hdf9ef73_0 19.1 MB
conda-forge
bzip2-1.0.8 | h0d85af4_4 155 KB conda-forge
c-ares-1.18.1 | h0d85af4_0 100 KB conda-forge
ca-certificates-2021.10.8 | h033912b_0 139 KB conda-forge
cairo-1.16.0 | hec6a9b0_1003 1.3 MB conda-forge
certifi-2021.10.8 | py39h6e9494a_1 145 KB conda-forge
cfitsio-3.470 | h01dc385_7 1.3 MB conda-forge
conda-4.11.0 | py39h6e9494a_0 16.9 MB
conda-forge
curl-7.78.0 | h7bc2e8c_0 133 KB
expat-2.4.1 | he49afe7_0 143 KB conda-forge
fontconfig-2.13.1 | h10f422b_1005 271 KB conda-forge
freetype-2.10.4 | h4cff582_1 890 KB conda-forge
freexl-1.0.6 | h0d85af4_0 42 KB conda-forge
gdal-3.0.2 | py39ha6ec53f_1 1.1 MB
geos-3.8.0 | hb1e8313_0 815 KB
geotiff-1.6.0 | h02c1893_0 120 KB
gettext-0.21.0 | h7535e17_0 2.6 MB
giflib-5.2.1 | hbcb3906_2 71 KB conda-forge
glib-2.69.1 | hdf23fa2_0 2.7 MB
hdf4-4.2.13 | h39711bb_2 682 KB
hdf5-1.10.6 |nompi_hc5d9132_1114 3.1 MB
conda-forge
icu-64.2 | h6de7cb9_1 12.3 MB
conda-forge
jbig-2.1 | h0d85af4_2003 42 KB conda-forge
jpeg-9d | hbcb3906_0 250 KB conda-forge
json-c-0.13.1 | h575e443_1002 66 KB conda-forge
kealib-1.4.14 | h31dd65d_2 156 KB conda-forge
krb5-1.19.2 | hcfbf3a7_0 1.3 MB conda-forge
lerc-2.2.1 | h046ec9c_0 164 KB conda-forge
libblas-3.9.0 |12_osx64_openblas 12 KB conda-forge
libcblas-3.9.0 |12_osx64_openblas 12 KB conda-forge
libcurl-7.78.0 | hb8e4fae_0 311 KB
libcxx-12.0.1 | habf9029_0 1.1 MB conda-forge
libdap4-3.19.1 | h3d3e54a_0 1.1 MB
libdeflate-1.7 | h35c211d_5 67 KB conda-forge
libedit-3.1.20191231 | h0678c8f_2 103 KB conda-forge
libev-4.33 | haf1e3a3_1 99 KB conda-forge
libgdal-3.0.2 | ha1444b2_1 10.4 MB
libgfortran-5.0.0 |9_3_0_h6c81a4c_23 19 KB conda-forge
libgfortran5-9.3.0 | h6c81a4c_23 1.7 MB conda-forge
libiconv-1.16 | haf1e3a3_0 1.3 MB conda-forge
libkml-1.3.0 | h88bc94a_1012 473 KB conda-forge
liblapack-3.9.0 |12_osx64_openblas 12 KB conda-forge
libnetcdf-4.6.1 | hfd9a460_4 782 KB
libnghttp2-1.43.0 | h6f36284_1 867 KB conda-forge
libopenblas-0.3.18 |openmp_h3351f45_0 9.0 MB conda-forge
libpng-1.6.37 | h7cec526_2 313 KB conda-forge
libpq-12.2 | h1b4eb34_1 2.0 MB
libspatialite-4.3.0a | h5142b36_0 2.1 MB
libssh2-1.10.0 | h52ee1ee_2 221 KB conda-forge
libtiff-4.3.0 | h1167814_1 621 KB conda-forge
libwebp-base-1.2.1 | h0d85af4_0 692 KB conda-forge
libxml2-2.9.10 | h53d96d6_0 1.2 MB conda-forge
llvm-openmp-12.0.1 | hda6cdc1_1 287 KB conda-forge
lz4-c-1.9.3 | he49afe7_1 155 KB conda-forge
numpy-1.21.4 | py39h7eed0ac_0 5.8 MB conda-forge
openjpeg-2.3.1 | h6cbf5cd_3 373 KB conda-forge
openssl-1.1.1l | h0d85af4_0 1.9 MB conda-forge
pcre-8.45 | he49afe7_0 220 KB conda-forge
pixman-0.38.0 | h01d97ff_1003 611 KB conda-forge
poppler-0.89.0 | h9de36d4_1 1.6 MB conda-forge
poppler-data-0.4.11 | hd8ed1ab_0 3.6 MB conda-forge
postgresql-12.2 | h1b4eb34_1 3.3 MB
proj-6.2.1 | h773a61f_0 10.0 MB
conda-forge
python_abi-3.9 | 2_cp39 4 KB conda-forge
tiledb-2.3.4 | h8370e7a_0 2.9 MB conda-forge
xerces-c-3.2.3 | h8f8adb3_0 1.5 MB conda-forge
zstd-1.5.0 | h582d3a0_0 583 KB conda-forge
------------------------------------------------------------
Total: 133.2 MB
The following NEW packages will be INSTALLED:
boost-cpp conda-forge/osx-64::boost-cpp-1.72.0-hdf9ef73_0
bzip2 conda-forge/osx-64::bzip2-1.0.8-h0d85af4_4
c-ares conda-forge/osx-64::c-ares-1.18.1-h0d85af4_0
cairo conda-forge/osx-64::cairo-1.16.0-hec6a9b0_1003
cfitsio conda-forge/osx-64::cfitsio-3.470-h01dc385_7
curl pkgs/main/osx-64::curl-7.78.0-h7bc2e8c_0
expat conda-forge/osx-64::expat-2.4.1-he49afe7_0
fontconfig conda-forge/osx-64::fontconfig-2.13.1-h10f422b_1005
freetype conda-forge/osx-64::freetype-2.10.4-h4cff582_1
freexl conda-forge/osx-64::freexl-1.0.6-h0d85af4_0
gdal pkgs/main/osx-64::gdal-3.0.2-py39ha6ec53f_1
geos pkgs/main/osx-64::geos-3.8.0-hb1e8313_0
geotiff pkgs/main/osx-64::geotiff-1.6.0-h02c1893_0
gettext pkgs/main/osx-64::gettext-0.21.0-h7535e17_0
giflib conda-forge/osx-64::giflib-5.2.1-hbcb3906_2
glib pkgs/main/osx-64::glib-2.69.1-hdf23fa2_0
hdf4 pkgs/main/osx-64::hdf4-4.2.13-h39711bb_2
hdf5 conda-forge/osx-64::hdf5-1.10.6-nompi_hc5d9132_1114
icu conda-forge/osx-64::icu-64.2-h6de7cb9_1
jbig conda-forge/osx-64::jbig-2.1-h0d85af4_2003
jpeg conda-forge/osx-64::jpeg-9d-hbcb3906_0
json-c conda-forge/osx-64::json-c-0.13.1-h575e443_1002
kealib conda-forge/osx-64::kealib-1.4.14-h31dd65d_2
krb5 conda-forge/osx-64::krb5-1.19.2-hcfbf3a7_0
lerc conda-forge/osx-64::lerc-2.2.1-h046ec9c_0
libblas conda-forge/osx-64::libblas-3.9.0-12_osx64_openblas
libcblas conda-forge/osx-64::libcblas-3.9.0-12_osx64_openblas
libcurl pkgs/main/osx-64::libcurl-7.78.0-hb8e4fae_0
libdap4 pkgs/main/osx-64::libdap4-3.19.1-h3d3e54a_0
libdeflate conda-forge/osx-64::libdeflate-1.7-h35c211d_5
libedit conda-forge/osx-64::libedit-3.1.20191231-h0678c8f_2
libev conda-forge/osx-64::libev-4.33-haf1e3a3_1
libgdal pkgs/main/osx-64::libgdal-3.0.2-ha1444b2_1
libgfortran conda-forge/osx-64::libgfortran-5.0.0-9_3_0_h6c81a4c_23
libgfortran5 conda-forge/osx-64::libgfortran5-9.3.0-h6c81a4c_23
libiconv conda-forge/osx-64::libiconv-1.16-haf1e3a3_0
libkml conda-forge/osx-64::libkml-1.3.0-h88bc94a_1012
liblapack conda-forge/osx-64::liblapack-3.9.0-12_osx64_openblas
libnetcdf pkgs/main/osx-64::libnetcdf-4.6.1-hfd9a460_4
libnghttp2 conda-forge/osx-64::libnghttp2-1.43.0-h6f36284_1
libopenblas
conda-forge/osx-64::libopenblas-0.3.18-openmp_h3351f45_0
libpng conda-forge/osx-64::libpng-1.6.37-h7cec526_2
libpq pkgs/main/osx-64::libpq-12.2-h1b4eb34_1
libspatialite pkgs/main/osx-64::libspatialite-4.3.0a-h5142b36_0
libssh2 conda-forge/osx-64::libssh2-1.10.0-h52ee1ee_2
libtiff conda-forge/osx-64::libtiff-4.3.0-h1167814_1
libwebp-base conda-forge/osx-64::libwebp-base-1.2.1-h0d85af4_0
libxml2 conda-forge/osx-64::libxml2-2.9.10-h53d96d6_0
llvm-openmp conda-forge/osx-64::llvm-openmp-12.0.1-hda6cdc1_1
lz4-c conda-forge/osx-64::lz4-c-1.9.3-he49afe7_1
numpy conda-forge/osx-64::numpy-1.21.4-py39h7eed0ac_0
openjpeg conda-forge/osx-64::openjpeg-2.3.1-h6cbf5cd_3
pcre conda-forge/osx-64::pcre-8.45-he49afe7_0
pixman conda-forge/osx-64::pixman-0.38.0-h01d97ff_1003
poppler conda-forge/osx-64::poppler-0.89.0-h9de36d4_1
poppler-data conda-forge/noarch::poppler-data-0.4.11-hd8ed1ab_0
postgresql pkgs/main/osx-64::postgresql-12.2-h1b4eb34_1
proj conda-forge/osx-64::proj-6.2.1-h773a61f_0
python_abi conda-forge/osx-64::python_abi-3.9-2_cp39
tiledb conda-forge/osx-64::tiledb-2.3.4-h8370e7a_0
xerces-c conda-forge/osx-64::xerces-c-3.2.3-h8f8adb3_0
zstd conda-forge/osx-64::zstd-1.5.0-h582d3a0_0
The following packages will be UPDATED:
ca-certificates pkgs/main::ca-certificates-2021.7.5-h~ -->
conda-forge::ca-certificates-2021.10.8-h033912b_0
certifi pkgs/main::certifi-2021.5.30-py39hecd~ -->
conda-forge::certifi-2021.10.8-py39h6e9494a_1
conda pkgs/main::conda-4.10.3-py39hecd8cb5_0 -->
conda-forge::conda-4.11.0-py39h6e9494a_0
libcxx pkgs/main::libcxx-10.0.0-1 -->
conda-forge::libcxx-12.0.1-habf9029_0
openssl pkgs/main::openssl-1.1.1k-h9ed2024_0 -->
conda-forge::openssl-1.1.1l-h0d85af4_0
Proceed ([y]/n)? y
Downloading and Extracting Packages
bzip2-1.0.8 | 155 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
fontconfig-2.13.1 | 271 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
krb5-1.19.2 | 1.3 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
gdal-3.0.2 | 1.1 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
freetype-2.10.4 | 890 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
hdf5-1.10.6 | 3.1 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
proj-6.2.1 | 10.0 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libblas-3.9.0 | 12 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
lerc-2.2.1 | 164 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libgfortran-5.0.0 | 19 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
lz4-c-1.9.3 | 155 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libiconv-1.16 | 1.3 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
icu-64.2 | 12.3 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libedit-3.1.20191231 | 103 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libxml2-2.9.10 | 1.2 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
python_abi-3.9 | 4 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
numpy-1.21.4 | 5.8 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
conda-4.11.0 | 16.9 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
ca-certificates-2021 | 139 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
poppler-0.89.0 | 1.6 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
liblapack-3.9.0 | 12 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
expat-2.4.1 | 143 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
boost-cpp-1.72.0 | 19.1 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
glib-2.69.1 | 2.7 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libgdal-3.0.2 | 10.4 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libspatialite-4.3.0a | 2.1 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libnetcdf-4.6.1 | 782 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
openssl-1.1.1l | 1.9 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
hdf4-4.2.13 | 682 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libcurl-7.78.0 | 311 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libwebp-base-1.2.1 | 692 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
c-ares-1.18.1 | 100 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
xerces-c-3.2.3 | 1.5 MB |
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| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
geotiff-1.6.0 | 120 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libnghttp2-1.43.0 | 867 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
zstd-1.5.0 | 583 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libtiff-4.3.0 | 621 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libkml-1.3.0 | 473 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libcblas-3.9.0 | 12 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
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#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
llvm-openmp-12.0.1 | 287 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
gettext-0.21.0 | 2.6 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
curl-7.78.0 | 133 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
pixman-0.38.0 | 611 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
json-c-0.13.1 | 66 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
cairo-1.16.0 | 1.3 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
postgresql-12.2 | 3.3 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
jbig-2.1 | 42 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
certifi-2021.10.8 | 145 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libev-4.33 | 99 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
libpq-12.2 | 2.0 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
poppler-data-0.4.11 | 3.6 MB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
cfitsio-3.470 | 1.3 MB |
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| 100%
freexl-1.0.6 | 42 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
pcre-8.45 | 220 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
kealib-1.4.14 | 156 KB |
#################################################################################################################################################################################################################################
| 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
(base) ➜ ~ gdalinfo --version
dyld: Library not loaded: @rpath/libpoppler.91.dylib
Referenced from:
/Users/idan.miara/opt/miniconda3/lib/libgdal.26.dylib
Reason: image not found
[1] 76584 abort gdalinfo --version
(base) ➜ ~
_______________________________________________
gdal-dev mailing list
[email protected]
https://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/gdal-dev
_______________________________________________
gdal-dev mailing list
[email protected]
https://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/gdal-dev
--
M.Sc. Geogr. Daniel Scheffler
Helmholtz Centre Potsdam
GFZ German Research Centre For Geosciences
Department 1 - Geodesy and Remote Sensing
Section 1.4 - Remote Sensing
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